Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  165  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56574588--56574633
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2.0
23
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0
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23
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0
0
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0.98
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0
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41
0
2
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1.14
56576448--56576493
16
3.1
15
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20
51
69
4
0
26
1.07
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17
2.5
17
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3
52
65
0
6
27
1.17
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10
10.7
10
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1
2
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1.23
56579148--56579236
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4.6
19
72
12
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1
3
62
1.19
56579147--56579274
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4.5
27
70
19
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2
2
60
1.23
56579358--56579519
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1.9
87
83
8
213
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5
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20
2.3
20
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14
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37
0
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2.0
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50
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2.1
49
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3
131
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1.92
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44
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135
21
15
30
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1.94
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1.96
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111
23
16
28
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18
2.1
19
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5
60
50
0
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2.4
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210
21
21
24
33
1.97
56619872--56619980
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2.6
42
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2
121
28
23
17
30
1.97
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37
2.9
37
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0
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20
22
1.98
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47
9.0
47
88
1
596
27
30
11
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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29
69
30
33
8
26
1.87
56632962--56633385
142
3.0
141
90
0
659
27
30
11
30
1.92
56638279--56638424
46
3.2
46
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13
147
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18
29
20
1.96
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5.7
48
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12
170
27
17
30
24
1.98
56648170--56648485
47
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48
74
12
223
26
19
29
24
1.98
56649616--56649654
21
1.9
21
94
5
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10
38
30
20
1.86
56655610--56655639
15
2.0
15
93
0
51
50
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0
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0
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23
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1.93
56663725--56663883
26
6.3
26
82
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199
28
23
20
27
1.99
56663725--56663883
74
2.1
74
89
9
243
28
23
20
27
1.99
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20
2.8
20
94
0
96
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10
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1.84
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20
10
35
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56663933--56664010
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85
30
20
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39
1.83
56671830--56671926
26
3.8
26
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2
135
26
24
23
24
2.00
56671976--56672050
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3.8
20
91
6
111
33
18
9
38
1.83
56671976--56672031
11
5.5
11
71
16
57
32
19
10
37
1.86
56671993--56672049
9
5.8
10
76
15
57
33
19
8
38
1.82
56672078--56672125
25
1.9
25
86
0
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27
14
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35
1.93
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18
2.8
18
93
0
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20
18
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46
1.85
56673946--56674001
18
3.1
18
89
0
67
19
14
17
48
1.81
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40
4.7
40
82
9
218
23
21
28
26
1.99
56683750--56683934
40
4.7
40
84
7
227
23
22
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56683750--56683932
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2.3
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241
24
22
27
25
2.00
56683751--56683967
79
2.7
78
79
12
237
25
21
27
25
1.99
56687096--56687253
65
2.4
65
85
2
210
20
20
22
35
1.96
56688244--56688294
25
2.0
25
100
0
102
11
15
11
60
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2.9
17
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40
20
18
22
1.92
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2.0
24
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13
111
17
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1.65
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135
16
24
22
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1.94
56709545--56709652
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15
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2.0
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24
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1.99
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1.93
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31
12
29
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1.89
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32
12
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26
1.93
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65
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12
17
46
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56733962--56734046
43
2.0
43
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0
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25
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22
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18
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162
24
31
17
26
1.97
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4.1
37
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1
261
26
32
19
21
1.97
56751135--56751286
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2.1
74
93
1
261
26
32
19
21
1.97
56751405--56751676
47
5.7
47
91
2
411
27
30
9
32
1.88
56759230--56759315
30
2.9
30
80
11
97
30
23
17
29
1.97
56770350--56770464
46
2.5
44
81
6
124
28
17
30
23
1.97
56778671--56778718
24
2.0
24
84
8
62
33
2
20
43
1.64
56787009--56787116
29
3.8
29
82
6
130
26
27
15
29
1.96
56788101--56788138
19
2.0
20
89
5
60
36
2
15
44
1.61
56789920--56789970
26
1.9
27
88
4
77
39
23
11
25
1.89
56790007--56790064
21
2.7
22
84
10
77
34
12
22
31
1.91
56796211--56796248
19
2.0
20
89
5
60
36
2
15
44
1.61
56798092--56798139
21
2.3
21
85
7
62
33
10
25
31
1.89
56798105--56798145
21
2.0
21
95
0
73
34
12
21
31
1.91
56799587--56799625
16
2.4
16
95
0
69
12
5
30
51
1.62
56808843--56808872
16
1.9
16
93
6
53
30
0
20
50
1.49
56812677--56812751
29
2.7
27
78
8
78
30
13
28
28
1.94
56812677--56812761
28
3.0
28
81
5
91
30
14
28
27
1.95
56820090--56820187
28
3.6
27
80
12
101
45
12
10
31
1.75
56820121--56820186
26
2.4
28
87
7
91
48
13
9
28
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56827988--56828107
28
4.3
28
96
2
215
34
27
7
30
1.85
56828213--56828302
27
3.2
28
78
7
103
20
24
23
32
1.98
56828223--56828313
27
3.2
28
79
4
85
21
26
19
31
1.98
56828213--56828327
55
2.1
56
80
8
128
19
24
21
34
1.96
56835923--56836011
28
3.2
28
95
3
153
33
28
7
30
1.85
56836117--56836206
27
3.2
28
75
7
85
20
22
23
34
1.97
56836163--56836217
29
1.9
28
85
3
74
23
23
20
32
1.98
56840490--56841234
372
2.0
372
99
0
1463
31
16
20
31
1.95
56843233--56843344
27
4.2
26
83
7
134
37
22
24
16
1.93
56843233--56843344
54
2.1
54
86
3
154
37
22
24
16
1.93
56846456--56846492
15
2.3
17
90
9
60
70
0
24
5
1.08
56848337--56848582
49
4.9
50
82
2
316
27
19
26
27
1.99
56852144--56852182
20
1.9
20
89
5
60
10
20
17
51
1.74
56853290--56853336
18
2.5
20
79
6
53
53
10
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23
1.70
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46
3.7
46
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7
164
31
27
18
22
1.97
56861628--56861757
64
2.0
64
96
0
242
26
25
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41
1.80
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27
12.8
27
77
7
204
36
20
7
35
1.82
56864160--56864531
164
2.3
164
93
0
636
35
20
8
35
1.82
56864160--56864505
137
2.5
137
81
4
378
36
20
8
35
1.82
56864181--56864567
55
7.1
54
73
7
228
35
21
8
35
1.83
56864539--56864677
27
5.2
26
73
8
100
36
23
12
28
1.90
56864546--56864678
54
2.5
53
78
6
133
38
21
12
28
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56864546--56864701
81
1.9
81
82
2
197
39
20
11
28
1.87
56864579--56864692
27
4.2
27
83
0
129
41
21
7
28
1.81
56864579--56864780
54
3.7
54
76
5
190
40
19
9
30
1.84
56864604--56864765
27
5.9
27
76
9
105
40
19
9
30
1.84
56864806--56864879
27
2.7
27
76
12
71
37
20
20
21
1.94
56864819--56864883
27
2.4
27
82
5
78
35
18
24
21
1.96
56865591--56865657
20
3.3
20
89
4
100
40
10
17
31
1.84
56865707--56865842
52
2.7
51
90
5
206
29
21
22
27
1.99
56865707--56865842
26
5.3
26
84
3
172
29
21
22
27
1.99
56865975--56866066
42
2.2
42
86
0
121
32
13
19
34
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345