Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  251  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85384465--85384657
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0
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1.99
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3.5
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328
22
22
27
27
1.99
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4.9
48
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334
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19
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1.99
85417241--85417479
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2.5
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27
19
24
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1.99
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19
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4
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0
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0
0
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2.9
18
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13
72
13
1
5
78
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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116
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0
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17
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0
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30
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20
5
0
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1.01
85498009--85498047
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20
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20
5
0
74
1.01
85507784--85507816
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15
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63
1.43
85507830--85507927
4
23.5
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19
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3
3
72
1.12
85507833--85507875
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15
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0.95
85507830--85507911
21
3.9
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10
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20
3
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3.2
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1
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1.18
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2.9
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2.9
21
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35
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3
60
1.12
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42
0
0
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0.98
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85509177--85509212
17
2.1
18
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2
2
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1.30
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2.0
71
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4
2
40
1.32
85509294--85509442
73
2.0
73
84
0
190
54
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4
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1.38
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2.1
20
100
0
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9
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1.51
85509593--85509637
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2.5
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8
4
35
1.54
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20
2.1
20
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1.50
85513152--85513198
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2.0
24
100
0
94
21
12
14
51
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85513261--85513352
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2.8
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1.90
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33
3.5
33
82
7
124
32
24
11
31
1.91
85515225--85515327
30
3.4
30
77
10
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25
22
21
31
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21
1.9
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53
0
0
46
1.00
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1
1
47
1.23
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2.0
13
100
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2
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1
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1
1
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1.20
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1
1
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1.16
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2.3
11
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0
50
72
0
0
28
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85529769--85529798
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3
0
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1.07
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20
2.0
20
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7
2
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1.45
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0
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0
0
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0
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0
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1.87
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3
100
0
58
34
0
0
65
0.93
85551089--85551114
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
85551697--85551748
26
2.1
23
86
10
68
34
3
5
55
1.42
85559381--85559468
37
2.4
35
80
15
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26
19
28
26
1.99
85559456--85559504
25
1.9
26
95
4
91
26
18
28
26
1.98
85559481--85559695
40
5.4
40
94
2
355
23
20
28
27
1.99
85559481--85559695
79
2.7
80
93
2
355
23
20
28
27
1.99
85559481--85559730
79
3.2
80
88
2
337
24
20
28
26
1.99
85567449--85567664
40
5.4
40
96
0
371
23
20
29
26
1.99
85576914--85576965
21
2.5
20
81
9
61
21
38
26
13
1.90
85577287--85577326
21
1.9
21
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10
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50
20
2
27
1.61
85577404--85577437
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0
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1.55
85579142--85579167
8
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8
100
0
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0
0
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72
2.1
72
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287
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1.77
85585285--85585311
14
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14
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0
54
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7
7
33
1.58
85587341--85587649
47
6.6
46
73
13
179
28
20
27
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
27
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2
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9
24
31
1.88
85594834--85595056
47
4.8
46
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11
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28
20
28
22
1.98
85594834--85595054
94
2.4
91
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5
248
28
19
28
23
1.98
85594880--85595143
141
1.9
140
82
5
336
28
19
28
23
1.98
85599548--85599589
19
2.2
20
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4
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28
9
11
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1.70
85601293--85601338
22
2.1
22
87
0
65
23
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17
13
1.83
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2.0
17
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0
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26
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1.73
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2.4
15
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0
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0
0.82
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25
2.1
26
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13
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0
25
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1.53
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2.2
62
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0
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24
28
32
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1.95
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21
2.1
21
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0
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24
6
4
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1.37
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27
2.0
26
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11
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28
2
2
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1.12
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3.8
20
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13
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35
18
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1.83
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20
3.5
20
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35
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1.9
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23
23
1.97
85634340--85634431
47
1.9
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10
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32
19
23
23
1.97
85634351--85634441
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3.7
25
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100
31
19
24
24
1.98
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12
2.4
12
100
0
58
6
34
37
20
1.80
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12
2.5
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14
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6
33
36
24
1.80
85640715--85640822
20
5.4
20
76
8
80
35
16
9
38
1.81
85640753--85640822
20
3.5
20
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7
81
35
18
8
37
1.82
85640974--85641080
23
4.7
22
75
14
92
37
19
17
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85640974--85641055
23
3.6
22
82
8
94
35
20
18
25
1.95
85640974--85641105
45
2.8
44
81
12
115
35
18
18
26
1.95
85645876--85646060
79
2.3
82
81
7
220
25
27
22
24
2.00
85645876--85646060
40
4.7
40
82
7
216
25
27
22
24
2.00
85654258--85654515
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10.3
25
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5
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1.38
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1
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85655400--85655447
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2.1
22
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4
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28
1.98
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1.8
93
96
0
317
20
21
29
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1.98
85665990--85666021
17
1.9
17
93
6
57
37
0
18
43
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345