Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   

This is table  239  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81048970--81049042
15
4.8
15
77
1
56
43
0
1
54
1.08
81048969--81049024
20
2.8
20
91
0
94
39
0
0
60
0.97
81051145--81051189
20
2.3
21
77
14
51
33
0
2
64
1.06
81061653--81061690
13
3.0
13
84
7
51
68
0
10
21
1.19
81063147--81063301
43
3.6
43
90
3
249
30
30
25
12
1.93
81063138--81063301
86
1.9
86
92
0
274
29
31
25
13
1.94
81063294--81063614
75
4.3
75
93
1
527
29
24
22
22
1.99
81063317--81063614
113
2.6
112
95
1
524
28
24
23
23
1.99
81063294--81063614
38
8.5
38
93
2
522
29
24
22
22
1.99
81077992--81078032
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
81091669--81091796
63
2.0
62
92
1
211
26
14
21
38
1.91
81091837--81091880
21
2.1
21
91
8
72
34
11
0
54
1.36
81103481--81103506
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
81112743--81112872
47
2.8
47
90
0
188
31
30
16
22
1.95
81114666--81115643
487
2.0
487
95
0
1769
36
21
14
27
1.92
81115901--81115925
13
1.9
13
100
0
50
0
40
28
32
1.57
81116897--81117016
46
2.6
44
88
7
161
23
26
20
29
1.99
81116897--81117114
46
4.7
46
77
8
144
23
27
20
29
1.99
81121148--81121805
328
2.0
328
97
0
1244
29
15
21
33
1.94
81130202--81130239
6
6.3
6
96
0
67
31
15
0
52
1.43
81131048--81131105
28
2.2
25
85
14
82
37
29
1
31
1.67
81131054--81131110
28
2.0
28
100
0
114
36
28
3
31
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81133649--81133689
21
2.0
21
90
0
64
51
9
14
24
1.72
81135667--81135700
7
4.9
7
96
0
59
38
0
2
58
1.13
81143715--81143784
34
2.1
34
91
0
113
45
24
7
22
1.77
81153465--81153563
48
2.1
48
94
0
171
33
21
13
32
1.91
81158803--81158842
21
2.0
20
90
5
62
17
27
40
15
1.89
81164630--81165025
96
4.1
96
79
5
305
26
18
28
27
1.98
81164752--81164867
50
2.4
48
78
12
119
27
15
27
29
1.96
81164656--81165032
48
7.8
48
71
4
231
25
17
28
28
1.98
81169897--81170267
57
6.5
57
76
7
290
25
21
19
34
1.96
81169897--81170263
85
4.3
85
73
9
268
25
21
19
34
1.96
81169897--81170263
28
13.0
27
74
11
227
25
21
19
34
1.96
81172989--81173291
28
10.8
28
78
5
299
23
22
19
35
1.96
81172989--81173291
85
3.6
84
81
5
344
23
22
19
35
1.96
81172989--81173291
57
5.4
57
84
2
344
23
22
19
35
1.96
81174061--81174110
22
2.3
22
82
0
64
32
52
2
14
1.53
81180131--81180184
21
2.5
21
75
3
54
16
33
33
16
1.92
81181319--81181361
21
2.0
22
82
8
54
13
13
9
62
1.53
81185486--81185510
13
1.9
13
100
0
50
40
8
4
48
1.51
81190095--81190137
10
4.3
10
82
11
52
67
2
6
23
1.27
81190158--81190195
13
2.8
13
88
4
58
44
13
0
42
1.43
81195805--81195835
16
1.9
16
93
0
53
16
0
9
74
1.07
81202908--81202934
13
2.1
13
100
0
54
55
7
14
22
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81203147--81203260
38
3.0
38
100
0
228
23
5
10
60
1.50
81207046--81207434
39
10.0
39
94
0
652
22
26
28
22
1.99
81212501--81212972
47
10.1
47
94
1
788
31
8
30
29
1.88
81212501--81212972
93
5.0
94
93
1
788
31
8
30
29
1.88
81217287--81217589
37
8.0
39
92
5
489
21
25
30
23
1.99
81220694--81220726
17
1.9
17
100
0
66
36
0
0
63
0.95
81220694--81220731
17
2.5
15
87
12
51
39
0
0
60
0.97
81220974--81221012
16
2.4
16
82
0
51
33
25
5
35
1.78
81225730--81225759
3
9.7
3
92
7
51
66
3
0
30
1.07
81226867--81226911
22
2.0
22
86
0
63
55
0
4
40
1.20
81227328--81227385
20
3.0
20
78
12
68
60
1
0
37
1.07
81227328--81227368
19
2.1
20
90
4
66
60
2
0
36
1.10
81227378--81227459
19
4.3
19
73
7
58
63
1
7
28
1.28
81227389--81227467
29
2.8
28
75
12
81
62
1
6
30
1.28
81227733--81227900
86
2.0
87
85
2
232
32
8
20
38
1.84
81228580--81228664
10
8.5
10
73
13
50
36
2
3
57
1.29
81228562--81228637
30
2.6
30
83
8
95
32
2
3
60
1.29
81228580--81228645
30
2.2
31
83
2
80
37
1
1
59
1.16
81245758--81245807
2
25.0
2
100
0
100
50
0
0
50
1.00
81248608--81248651
21
2.1
21
86
0
61
36
36
13
13
1.85
81255311--81255339
15
2.0
15
93
6
51
41
41
0
17
1.49
81257835--81257884
20
2.5
20
83
0
64
34
12
12
42
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81264489--81264713
48
4.9
47
73
13
157
29
23
18
29
1.97
81267300--81267332
15
2.2
15
100
0
66
54
12
21
12
1.69
81271020--81271115
50
1.9
49
93
2
165
31
19
17
31
1.95
81271862--81272057
48
4.3
48
72
16
184
27
25
18
28
1.98
81271862--81272087
48
4.9
47
73
15
170
26
25
19
28
1.99
81273219--81273282
33
2.0
32
93
3
110
39
4
20
35
1.73
81273636--81273684
20
2.5
20
82
0
62
30
10
12
46
1.74
81274756--81274815
23
2.6
23
89
0
93
26
31
30
11
1.92
81281634--81281662
15
1.9
15
100
0
58
0
13
20
65
1.26
81281705--81281755
22
2.5
20
83
6
57
58
11
0
29
1.33
81281767--81281811
19
2.3
20
78
17
51
35
4
0
60
1.17
81281819--81281862
21
2.2
20
83
4
52
40
4
18
36
1.71
81291149--81291189
17
2.4
17
95
4
73
31
7
34
26
1.84
81294959--81295046
43
2.0
43
95
0
158
39
13
13
32
1.84
81297321--81297407
44
2.0
44
84
4
113
22
12
26
37
1.90
81299866--81299920
5
11.0
5
80
7
67
43
0
1
54
1.10
81300006--81300045
21
1.9
21
89
0
62
37
0
5
57
1.21
81301163--81301200
11
3.5
11
82
7
51
44
2
18
34
1.64
81301233--81301377
78
1.9
78
80
8
172
42
1
17
39
1.58
81301214--81301346
70
1.9
71
81
7
164
43
1
17
37
1.58
81301214--81301395
75
2.5
71
75
12
177
41
1
18
38
1.58
81301367--81301424
29
2.0
29
83
6
73
39
0
27
32
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81301769--81301809
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
81303510--81303560
22
2.4
21
83
6
66
45
29
0
25
1.54
81304576--81304630
22
2.6
21
80
11
58
49
5
3
41
1.43
81305150--81305195
19
2.4
19
96
0
83
32
15
26
26
1.95
81305256--81305282
11
2.5
11
100
0
54
29
11
14
44
1.80
81305650--81305680
14
2.2
14
94
0
53
74
0
0
25
0.82
81306408--81306463
14
4.1
14
76
15
55
28
16
0
55
1.41
81306430--81306480
14
3.6
14
76
12
52
29
9
0
60
1.28
81306415--81306480
28
2.4
27
83
14
82
30
10
0
59
1.31
81309157--81309196
20
2.0
20
95
0
71
32
10
17
40
1.83
81311692--81311835
72
2.0
72
86
0
198
42
12
12
32
1.80
81312905--81312965
30
2.0
30
90
0
95
14
27
34
22
1.94
81325220--81325254
14
2.6
14
90
4
54
77
0
0
22
0.78
81325294--81325345
18
2.8
17
85
11
59
75
3
9
11
1.18
81325337--81325390
27
2.0
28
85
7
76
70
0
3
25
1.04
81325352--81325402
21
2.5
20
84
9
59
66
0
5
27
1.14
81330602--81330709
26
4.2
26
97
0
207
36
26
6
30
1.82
81336844--81337247
204
2.0
204
91
0
646
29
20
15
34
1.93
81339399--81339439
19
2.2
19
100
0
82
39
4
9
46
1.58
81341181--81341263
6
14.5
6
73
14
68
15
2
4
77
1.05
81341232--81341261
15
1.9
15
93
6
51
13
0
3
83
0.77
81345589--81345774
80
2.3
82
84
5
238
26
27
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81345589--81345774
40
4.7
40
87
5
216
26
27
20
24
1.99
81362082--81362132
8
6.0
9
80
15
56
31
0
1
66
1.03
81362895--81362926
7
4.7
7
96
3
57
25
0
0
75
0.81
81367225--81367260
18
2.0
18
100
0
72
33
38
11
16
1.84
81368498--81368543
19
2.4
19
82
14
58
36
0
6
56
1.25
81373759--81373813
13
4.3
13
73
11
51
69
0
7
23
1.14
81374788--81374823
18
1.9
19
88
5
56
69
5
5
19
1.29
81374784--81374830
18
2.8
17
73
20
53
74
4
6
14
1.17
81374789--81374831
19
2.4
18
80
7
52
74
4
4
16
1.16
81375006--81375039
16
2.1
17
88
5
52
2
14
5
76
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345