Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  67  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21008245--21008354
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21018931--21018979
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63
2
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2.9
24
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2.00
21054797--21055020
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2.0
129
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2.0
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3.9
9
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52
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0
0.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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20
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40
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25
1.98
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2.5
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256
29
20
25
25
1.99
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80
2.6
79
81
10
207
30
19
25
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2.1
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2.1
25
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2.1
47
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2.0
44
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14
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2.0
114
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2.5
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2.0
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15
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25
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48
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20
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1.8
144
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20
26
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1.98
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5.6
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250
27
25
20
25
1.99
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5.4
41
91
2
302
24
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.9
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2
35
1.30
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23
2.8
20
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23
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58
5
5
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1.41
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220
2.5
220
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23
16
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1.97
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2.0
21
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1.33
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28
1.9
28
96
0
99
38
3
1
55
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
21275125--21275209
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2.1
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1.83
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0
0
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16
100
0
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1.88
21318165--21318331
48
3.4
49
75
10
155
23
27
19
29
1.98
21320316--21320361
15
3.1
15
78
12
58
36
10
13
39
1.79
21322547--21322606
23
2.5
25
76
17
65
46
0
0
53
1.00
21322550--21322667
31
3.8
30
79
10
105
44
2
0
53
1.14
21332149--21332185
7
5.3
7
93
0
65
13
16
45
24
1.83
21336812--21336850
19
2.1
19
95
0
69
25
15
5
53
1.62
21340740--21340793
27
2.0
27
100
0
108
33
7
22
37
1.82
21344526--21344608
18
4.8
18
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24
79
43
2
3
50
1.32
21349517--21349541
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
21349807--21349881
38
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39
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102
54
1
0
44
1.08
21349801--21349921
28
4.3
28
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1
0
49
1.10
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25
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1
5
33
1.32
21354336--21354413
38
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38
100
0
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8
35
1.70
21359978--21360027
18
2.8
18
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3
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18
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26
20
1.95
21363625--21363755
45
3.0
44
84
4
174
25
29
21
23
1.99
21371624--21371754
45
3.0
44
85
4
174
27
29
20
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21376057--21376124
34
2.0
34
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11
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20
22
23
33
1.97
21378984--21379015
14
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13
90
10
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12
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18
1.50
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8
4.6
8
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3
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13
0
0
86
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7
5.0
7
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12
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16
0
0
83
0.64
21380259--21380294
16
2.3
16
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4
65
13
0
0
86
0.58
21391494--21391544
21
2.4
21
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0
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43
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9
13
1.77
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2.4
19
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50
0
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1.34
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19
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0
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1.34
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0
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0
20
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26
4.0
26
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0
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30
5
27
36
1.80
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25
2.3
25
85
11
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1
13
20
1.38
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55
2.3
55
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2
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28
28
25
17
1.98
21436037--21436080
20
2.2
20
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4
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27
22
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1.92
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28
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0
157
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7
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33
1.84
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56
1.9
55
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35
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24
20
1.95
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27
4.0
28
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104
35
19
24
20
1.96
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28
3.3
28
96
0
166
31
7
27
33
1.85
21468094--21468224
44
3.0
42
85
6
147
20
17
27
34
1.95
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22
2.0
22
90
4
68
16
26
45
11
1.82
21470105--21470160
28
2.0
29
89
10
89
16
42
23
17
1.88
21471163--21471338
49
3.6
48
73
12
119
23
30
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21471186--21471430
93
2.6
93
79
8
241
23
31
18
26
1.97
21471186--21471430
49
5.1
48
69
15
168
23
31
18
26
1.97
21473979--21474014
18
2.0
18
88
0
54
33
22
22
22
1.97
21475324--21475654
48
6.9
47
80
5
245
25
27
18
29
1.98
21475324--21475644
96
3.3
96
81
6
291
24
27
19
29
1.98
21475459--21475538
23
3.4
23
63
19
56
25
25
20
30
1.99
21475324--21475653
144
2.3
142
79
9
348
24
27
18
29
1.98
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37
5
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1.77
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2.2
59
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12
150
55
0
1
41
1.14
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30
2.0
30
100
0
122
29
13
9
47
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345