Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  218  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73906945--73907120
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21
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3.6
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257
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20
21
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1.98
73906945--73907120
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1
282
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21
21
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1.99
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3.3
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2.0
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25
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73930326--73930597
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4.1
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2.9
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0
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100
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1.94
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3.0
27
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12
25
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
73965114--73965168
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2.1
27
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1.9
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1.79
73974361--73974421
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2.5
24
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50
6
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1.68
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5.1
23
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2
5
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1.35
73974540--73974659
21
5.5
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58
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5
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1.33
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3
12.0
3
88
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261
35
19
16
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1.94
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22
18
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1.98
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2.7
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2.0
90
90
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280
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2.7
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2
2
33
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16
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59
2
2
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19
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26
30
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3
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1
0
55
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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13
33
1.58
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2.7
29
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1
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1.15
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23
2.3
24
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1
1
29
1.12
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26
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28
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104
25
34
17
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74061694--74061805
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1.94
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36
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43
1.70
74100656--74100712
30
1.9
30
85
0
78
26
29
28
15
1.96
74101774--74101951
88
2.0
86
93
2
302
23
18
14
43
1.86
74104680--74104754
30
2.8
25
76
18
78
26
21
18
33
1.96
74104695--74104755
30
2.0
30
96
0
113
27
21
19
31
1.97
74105370--74105407
20
1.9
20
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10
51
60
2
18
18
1.48
74105859--74105888
16
1.9
16
93
6
53
30
0
20
50
1.49
74109734--74109786
28
1.9
27
88
3
79
33
1
5
58
1.32
74132359--74132394
18
2.0
18
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10
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38
2
11
47
1.54
74135081--74135269
72
2.6
72
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3
229
30
28
17
23
1.97
74138477--74138781
150
2.0
150
98
0
592
39
12
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1.82
74152836--74152897
20
3.3
18
85
12
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1
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74152835--74152897
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14
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1.52
74152835--74152918
39
2.2
39
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35
2
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1.55
74156886--74157061
46
3.8
46
78
10
205
22
21
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28
1.99
74156882--74157053
93
1.8
93
92
0
290
22
22
28
27
1.99
74167381--74167419
20
2.0
20
84
0
51
48
7
2
41
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
17
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10
52
70
0
4
25
1.06
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19
2.2
18
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72
0
5
22
1.04
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23
2.0
23
90
9
72
53
0
13
32
1.41
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19
2.2
20
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4
61
67
4
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1.38
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13
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1
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7
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1.84
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28
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23
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29
1.96
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25
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1.97
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21
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1.99
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1.8
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21
28
28
1.99
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10
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1.60
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46
3.7
45
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21
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29
1.99
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1.8
92
92
3
286
22
21
27
28
1.99
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5.9
44
74
13
185
24
30
19
25
1.98
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2.8
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1.98
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48
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5
27
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40
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21
26
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2.00
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25
2.0
25
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33
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1.92
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48
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0
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2.2
16
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0
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11
19
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1.62
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3.7
46
77
11
192
21
19
27
30
1.98
74223550--74223720
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1.8
93
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2
281
21
19
28
29
1.98
74223950--74223987
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74231251--74231288
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
74235348--74235384
19
1.9
19
88
0
56
51
0
18
29
1.47
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0
0
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0.92
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2.1
30
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0
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3
26
1.47
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17
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1.84
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2.0
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3.6
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118
25
28
18
27
1.98
74242638--74242767
44
3.0
45
79
10
144
26
28
18
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345