Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  55  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16787006--16787151
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3.5
41
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5
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19
28
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0
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28
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20
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1.91
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2
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25
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17
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2.9
30
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27
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239
27
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28
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1.98
16898156--16898419
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1.9
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5
354
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19
29
23
1.98
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36
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25
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1.9
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25
6
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1.30
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1.9
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55
70
2
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0.99
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1.9
18
88
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62
5
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22
1.45
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2.1
21
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64
0
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1.23
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23
2.6
22
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2
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6
0
44
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
0
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1.00
16932355--16932398
22
2.0
22
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61
47
0
0
52
1.00
16932360--16932398
15
2.6
15
88
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53
48
0
0
51
1.00
16932694--16932766
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3
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1.24
16947959--16947992
12
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11
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0
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50
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1.35
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23
13
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0
0
37
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0
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100
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19
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16958154--16958187
16
2.1
16
88
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50
0
11
11
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1.02
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26
19
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1.9
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2.0
19
100
0
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42
1.62
16964289--16964322
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2
11
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0
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1.80
16978182--16978367
73
2.5
73
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354
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6
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16982740--16982784
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2.0
23
86
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33
8
4
53
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16984160--16984203
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0
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51
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16990688--16990729
18
2.4
18
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52
45
0
2
52
1.13
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2.0
23
100
0
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4
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2.0
21
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0
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0
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0
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1.96
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13
11
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1.81
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20
1.74
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22
2
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0
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20
0
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113
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4
18
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17018193--17018634
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39
1.70
17018337--17018376
17
2.6
16
88
11
57
12
0
37
50
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17017931--17018465
276
1.9
274
92
3
887
37
3
20
38
1.69
17018354--17018909
282
2.0
275
91
4
902
37
3
20
38
1.70
17018027--17019092
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2.4
443
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2
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35
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21
40
1.70
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115
2.0
115
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4
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20
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1.67
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57
12
0
37
50
1.41
17019074--17019131
17
3.3
18
82
2
75
13
0
32
53
1.40
17019258--17019692
126
3.5
126
89
0
649
37
15
18
28
1.92
17023404--17023470
30
2.2
30
83
2
89
10
20
43
25
1.84
17023967--17023992
7
3.7
7
100
0
52
57
15
0
26
1.38
17025357--17025437
40
2.1
38
81
9
92
27
28
25
18
1.98
17025715--17025813
42
2.4
41
71
8
92
36
24
13
26
1.92
17025970--17026031
31
2.0
31
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0
115
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3
40
1.66
17026452--17026503
28
2.0
26
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11
79
61
7
7
23
1.49
17034991--17035036
24
1.9
24
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0
74
19
23
8
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1.77
17034994--17035045
24
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24
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0
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23
23
7
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1.78
17036386--17036411
13
2.0
13
100
0
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30
5
0
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1.14
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2
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1.47
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19
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20
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42
0
0
57
0.98
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26
1.9
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4
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43
1
5
49
1.38
17064903--17064928
13
2.0
13
100
0
52
53
0
23
23
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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3
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35
2
0
62
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36
2.6
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36
2
0
61
1.08
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11
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11
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13
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31
3
0
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1.09
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19
2.2
19
90
0
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0
51
1.35
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16
19
1.94
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5
130
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16
1.92
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0
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28
28
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1.8
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1.64
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3.0
30
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21
29
28
1.98
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91
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275
20
22
29
27
1.98
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2.00
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259
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23
25
2.00
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2.1
55
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25
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25
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0
86
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18
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0
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0
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1.00
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18
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1.25
17152129--17152175
23
2.0
23
83
0
58
21
6
12
59
1.55
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12
2.1
12
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0
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0
0
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6
5.7
6
85
7
50
12
3
0
84
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17173391--17173476
17
5.2
16
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20
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1
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1.03
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3
90
4
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32
0
0
67
0.91
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175
3.2
175
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1
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20
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1.97
17185541--17186027
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16
328
33
20
19
26
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2.1
15
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0
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0
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1
1
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1.04
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1
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34
2
18
1.64
17191870--17191915
19
2.3
20
85
7
67
26
39
0
34
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345