Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  7  of  345  ( 41358 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2232191--2232492
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114
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0
100
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3.0
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24
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1.94
2253323--2253449
47
2.7
47
81
1
148
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24
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0
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2.0
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17
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0
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0
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36
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13
2.1
13
100
0
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3.0
42
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3
168
31
25
11
31
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.6
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25
13
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1.94
2316501--2316622
47
2.6
47
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0
226
32
23
14
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1.94
2316641--2316820
31
5.8
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0
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25
26
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3.5
50
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27
22
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2319476--2319792
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18
23
26
1.98
2319476--2319794
121
2.6
121
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5
450
31
19
23
26
1.98
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23
2.0
23
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0
0
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0
0
26
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1.8
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18
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0
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55
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2
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9
4.9
9
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52
0
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5.1
9
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58
52
0
6
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1.27
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2.0
99
96
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9
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6
166
42
20
13
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16
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15
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6
50
48
0
2
48
1.14
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25
2.2
25
83
3
76
25
0
5
69
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
0
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0
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0
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1.46
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2
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0
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2
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2.0
17
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52
45
0
0
54
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0
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2.1
44
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2
112
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2.0
20
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52
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2.0
22
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11
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1.10
2424710--2424767
18
3.1
18
80
9
71
72
8
15
3
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2425308--2425368
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0
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0
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19
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5
65
47
5
0
47
1.25
2446978--2447006
15
2.0
15
93
6
51
68
0
0
31
0.89
2447293--2447319
7
3.9
7
100
0
54
59
0
0
40
0.98
2447720--2447755
13
2.6
14
82
8
56
5
25
2
66
1.27
2455144--2455198
23
2.5
22
77
11
58
58
1
5
34
1.32
2460001--2460043
21
2.0
21
100
0
86
48
13
9
27
1.73
2463485--2463517
17
1.9
17
88
11
50
15
3
9
72
1.21
2468460--2468501
21
2.0
22
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4
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45
11
16
26
1.82
2468741--2468766
6
4.3
6
100
0
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0
15
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21
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3
71
1.15
2470439--2470483
20
2.3
21
77
14
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20
2
4
73
1.11
2486273--2486788
184
2.8
183
85
3
698
40
20
12
26
1.88
2490488--2490540
9
5.8
9
80
12
63
54
1
0
43
1.11
2490487--2490571
29
2.9
30
80
7
102
56
1
2
40
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2496270--2496343
36
2.1
36
100
0
148
25
20
24
29
1.99
2497056--2497088
15
2.4
14
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10
50
63
12
0
24
1.28
2497626--2497699
38
1.9
38
97
0
139
17
17
25
39
1.91
2498158--2498206
17
2.9
17
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3
64
65
2
0
32
1.04
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2
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2
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0
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0
0
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0
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0
0
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1.00
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29
7
3
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1.44
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28
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0
0
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18
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17
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15
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0
0
35
0.94
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20
2.0
20
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10
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63
0
0
36
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3
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0
59
0
0
64
35
0.94
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14
3.7
14
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5
52
38
9
15
36
1.80
2521652--2521695
14
3.1
14
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18
56
36
6
20
36
1.79
2521778--2521816
20
2.0
20
94
0
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48
2
0
48
1.15
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86
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25
1.60
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16
2.4
16
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4
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50
13
7
28
1.69
2530877--2531309
219
2.0
218
99
0
857
31
9
14
43
1.78
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34
2.1
32
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10
77
49
10
2
37
1.52
2531605--2531642
14
2.7
14
88
8
51
39
7
2
50
1.46
2536177--2536320
67
2.1
69
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3
265
45
11
4
39
1.59
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2
16.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
2549885--2549911
2
13.5
2
100
0
54
0
51
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2554553--2554604
15
3.5
15
70
19
54
55
3
5
34
1.42
2554549--2554641
30
3.1
30
95
3
161
53
3
7
35
1.45
2554568--2554619
15
3.5
15
70
19
54
51
1
5
40
1.37
2555549--2555590
22
1.9
22
85
0
57
30
7
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1.74
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2.1
27
84
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46
3
5
44
1.42
2569103--2569132
15
2.1
14
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51
0
46
0
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1.00
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2.0
127
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0
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1.9
99
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0
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30
0
0
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13
4.1
13
81
9
56
27
1
0
70
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345