Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  100  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32964401--32964465
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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33007646--33007716
27
2.6
26
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0
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3.0
27
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25
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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20
1
4
73
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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10
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1.71
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25
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24
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11
97
33
21
25
19
1.97
33143209--33143300
25
3.7
26
77
8
102
34
16
25
23
1.95
33145005--33145036
14
2.4
14
90
10
50
21
9
28
40
1.84
33145002--33145133
52
2.6
51
81
2
149
25
14
27
33
1.94
33145048--33145184
50
2.7
51
82
1
159
25
19
27
27
1.99
33158405--33158557
74
2.0
75
92
5
256
24
18
31
26
1.97
33168081--33168118
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
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1.55
33173520--33173567
26
2.0
24
84
12
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37
10
4
47
1.57
33190818--33190874
30
1.9
30
100
0
114
26
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10
29
1.90
33211069--33211110
22
2.1
19
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13
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45
2
0
52
1.13
33211822--33211889
25
2.7
24
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13
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2
1
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1.21
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0
0
30
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18
1.9
17
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5
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0
0
29
0.87
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22
3.7
21
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15
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40
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5
38
1.70
33218723--33218811
19
4.8
19
90
8
148
37
14
10
38
1.80
33218723--33218811
35
2.4
37
88
9
146
37
14
10
38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33219162--33219390
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5.1
45
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12
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25
27
15
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1.96
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3.8
78
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0
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23
18
31
1.98
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217
2.7
217
91
1
950
27
22
17
32
1.97
33220048--33220250
43
4.7
43
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16
121
27
22
16
33
1.96
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6.9
45
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6
252
25
26
16
32
1.96
33220339--33220616
78
3.4
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7
337
24
23
19
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1.98
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369
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1.98
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21
21
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1.96
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2.8
555
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1877
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22
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1.96
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3.0
44
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26
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16
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1.92
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2.6
78
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1
304
23
24
17
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1.96
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2.2
133
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0
513
27
19
17
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1.95
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1.9
13
100
0
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2.2
138
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6
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2.0
82
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0
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6
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2.5
23
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47
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14
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20
29
28
1.98
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46
3.8
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11
207
21
20
28
29
1.98
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1.8
93
93
2
301
21
20
29
28
1.98
33249570--33249633
25
2.6
25
80
5
67
31
20
25
23
1.98
33265840--33265878
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2.1
19
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0
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28
20
5
1.72
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14
1.9
14
100
0
54
37
14
0
48
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33273315--33273399
21
4.0
22
80
9
95
35
23
23
17
1.95
33280275--33280578
155
2.0
155
94
0
536
23
18
29
29
1.98
33284547--33284575
14
2.0
15
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51
3
20
6
68
1.27
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32
2.0
32
96
0
119
31
17
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1.81
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2.1
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90
0
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23
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1.99
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50
3.9
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283
28
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23
21
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1.99
33289723--33289779
9
5.9
9
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15
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35
21
8
35
1.84
33289711--33289781
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345