Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  14  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4478597--4478665
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34
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5
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0
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1.25
4479037--4479070
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2.5
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2
0
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1.01
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1
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2.2
25
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76
33
0
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1.31
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127
2.0
133
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375
29
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60
1.37
4493267--4493363
3
31.7
3
79
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29
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3
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1.33
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73
14
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28
8
0
62
1.25
4493588--4493656
34
2.0
34
86
5
95
28
8
0
62
1.25
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2.3
23
90
0
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50
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117
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0
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1.9
112
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0
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21
2.3
21
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71
75
4
8
12
1.18
4501294--4501360
30
2.3
27
82
10
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52
1
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31
1.51
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22
2.3
20
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13
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4
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1.15
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3.4
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60
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3
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2.3
30
80
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72
33
4
2
58
1.33
4501803--4501845
21
2.1
22
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12
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32
2
0
65
1.06
4501804--4501856
22
2.4
21
81
9
52
32
3
3
60
1.32
4501927--4502021
47
2.0
49
84
10
126
33
5
5
55
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4501982--4502022
13
3.1
14
79
13
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7
4
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1.50
4501915--4502051
24
5.7
24
70
22
85
33
5
4
56
1.41
4502446--4502515
24
3.1
22
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8
70
41
2
2
52
1.31
4502760--4503041
3
91.7
3
68
17
91
31
8
3
57
1.44
4502996--4503040
23
2.0
23
86
8
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33
8
0
57
1.30
4513664--4513718
25
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14
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1
0
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1.11
4516062--4516125
10
6.2
10
75
10
58
29
0
3
67
1.06
4516062--4516115
21
2.6
21
88
5
74
31
0
1
66
1.02
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18
2.2
20
80
12
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37
0
4
58
1.19
4516147--4516187
19
2.2
19
86
4
57
39
0
4
56
1.21
4519122--4519161
17
2.4
17
86
0
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57
2
10
30
1.45
4522461--4522500
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2.9
14
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0
53
42
17
7
32
1.77
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2.2
26
100
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22
3
36
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6.6
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80
4
52
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3
13
0
0.80
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15
3.3
15
85
8
64
77
0
22
0
0.77
4528152--4528209
7
7.9
7
77
9
53
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1
18
0
0.82
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14
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78
1
19
0
0.84
4529679--4530079
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43
65
13
199
34
21
23
21
1.97
4529443--4530253
88
9.2
88
87
3
1057
32
21
24
21
1.98
4529748--4530219
44
10.8
44
63
11
164
33
20
25
20
1.97
4531172--4531205
18
2.0
16
88
11
50
11
32
50
5
1.63
4531693--4532004
3
104.7
3
68
11
124
26
5
4
63
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4531814--4531910
28
3.3
28
73
18
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22
5
4
68
1.27
4531895--4532004
38
2.8
38
82
5
123
31
8
1
58
1.38
4532074--4532102
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2.3
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5
51
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0
0
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51
20
0
0
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15
2.0
16
93
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55
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0
0
19
0.71
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12
9.0
11
67
20
52
70
4
3
21
1.22
4533972--4534018
18
2.8
16
81
12
51
76
0
4
19
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107.0
3
68
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113
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5
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1.30
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2.3
43
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135
61
1
9
28
1.34
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6.5
15
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13
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1
9
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1.37
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2.2
18
88
12
59
34
4
0
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1.17
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10.2
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18
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5
3
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1.34
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25
2.5
26
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2
83
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1
6
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1.24
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26
8.0
24
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15
148
29
5
4
60
1.40
4539422--4539481
22
2.6
24
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30
1
1
66
1.11
4541379--4541440
27
2.2
29
77
11
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50
3
3
43
1.34
4541573--4541624
14
3.6
14
73
14
52
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0
5
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1.20
4541597--4541641
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2.2
19
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11
63
57
0
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1.19
4541574--4541641
21
3.3
22
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10
72
60
0
4
35
1.17
4546033--4546110
17
4.2
18
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20
63
61
1
3
33
1.22
4546072--4546130
24
2.5
22
78
10
55
59
1
5
33
1.29
4557989--4558069
37
2.2
37
86
0
108
41
6
17
34
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4561671--4561874
27
7.6
27
86
4
250
27
14
27
30
1.95
4565942--4565987
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2.2
21
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7
58
17
30
30
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1.96
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11
6.8
11
87
0
114
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2
1
26
1.10
4567396--4567470
14
5.4
14
81
12
93
69
2
1
26
1.10
4567396--4567471
19
4.0
20
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17
63
68
2
1
27
1.11
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26
2.2
26
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0
107
20
15
5
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64
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25
18
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1.98
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137
97
0
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19
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1.98
4578556--4578607
26
2.0
26
96
0
95
36
26
5
30
1.80
4578612--4578684
26
2.8
26
95
0
128
34
27
5
32
1.80
4579749--4579783
18
1.9
18
94
0
61
28
22
14
34
1.93
4581009--4581094
22
4.0
22
78
4
95
25
2
9
62
1.37
4581629--4581706
35
2.2
36
76
21
85
44
1
5
48
1.32
4581828--4581864
3
12.7
3
88
5
58
32
0
2
64
1.07
4581888--4581920
15
2.1
16
88
5
50
45
0
0
54
0.99
4582493--4582526
17
1.9
18
88
5
52
41
0
23
35
1.55
4591959--4591998
21
1.9
21
84
0
53
32
0
20
47
1.50
4592398--4592516
25
4.8
25
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9
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21
26
21
30
1.98
4598137--4598198
30
2.1
30
93
0
106
24
17
11
46
1.81
4600395--4600451
11
5.2
11
78
0
60
70
14
1
14
1.26
4600395--4600448
22
2.5
22
84
0
72
70
12
1
14
1.25
4601751--4601781
14
2.2
14
100
0
62
35
25
19
19
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4609249--4609295
6
7.8
6
92
0
67
38
0
59
2
1.09
4609695--4609778
22
3.9
22
79
6
82
28
3
7
60
1.40
4609703--4609761
21
2.8
20
80
7
73
27
3
6
62
1.36
4610143--4610238
27
3.7
26
71
6
86
62
8
3
26
1.38
4611877--4611950
36
2.1
36
100
0
148
37
18
24
18
1.94
4612474--4612524
25
2.0
25
100
0
102
23
37
3
35
1.74
4616518--4616546
15
1.9
15
100
0
58
68
3
13
13
1.33
4618518--4618561
17
2.8
16
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10
63
72
0
0
27
0.85
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2
18.0
2
94
5
63
48
0
0
51
1.00
4628024--4628066
10
4.4
9
91
8
59
44
0
2
53
1.13
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3
11.7
3
88
5
54
36
2
0
61
1.11
4628051--4628108
12
4.7
12
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6
53
36
3
3
56
1.33
4628215--4628250
3
12.0
3
87
0
54
36
2
0
61
1.11
4628080--4628335
141
1.8
138
81
8
318
30
6
7
55
1.53
4630586--4630662
26
3.3
23
80
14
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71
2
0
25
0.99
4630616--4630673
21
2.8
21
85
10
75
70
5
0
24
1.07
4640452--4640505
27
2.0
27
100
0
108
40
18
25
14
1.89
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23
1.9
23
90
4
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28
0
0
71
0.87
4653468--4653839
147
2.5
151
90
3
567
29
25
22
22
1.99
4659300--4659415
45
2.6
45
87
0
160
38
15
23
22
1.92
4659300--4659566
46
5.9
45
83
3
194
40
14
22
21
1.90
4659390--4659568
46
3.9
46
88
1
252
41
13
23
21
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4659397--4659590
92
2.1
92
84
4
259
41
13
23
21
1.88
4667001--4667035
15
2.4
15
90
4
54
68
0
31
0
0.90
4672150--4672190
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
4675905--4675990
9
9.1
9
78
13
68
63
1
1
33
1.09
4675905--4675965
17
3.3
18
80
13
63
63
1
0
34
1.04
4675905--4675983
10
8.3
10
73
19
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63
1
0
35
1.03
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17
3.2
19
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27
0
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1.23
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2.0
18
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0
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2
0
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1.11
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2.2
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29
1
6
63
1.27
4676171--4676230
28
2.1
28
82
11
70
35
3
1
60
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345