Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  332  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111034871--111034958
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2.4
34
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2
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1.26
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2
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2.6
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11
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2.0
53
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0
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14
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21.6
44
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362
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19
21
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2.2
187
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19
22
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3.9
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31
18
21
28
1.97
111041858--111042409
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1.9
286
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0
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31
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22
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1.97
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21
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2.1
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2.6
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22
11
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3
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9
0
58
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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11
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23
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4.6
84
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518
32
20
22
24
1.98
111063457--111063848
171
2.3
167
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509
32
20
22
24
1.98
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2.2
44
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2.2
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137
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2.0
25
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30
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0
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0
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2.2
24
89
0
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9
50
1.54
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100
0
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0
0
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5
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12
204
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22
18
31
1.97
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5.9
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351
27
22
18
31
1.97
111077352--111077822
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2.6
179
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635
27
21
17
32
1.96
111077925--111078163
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5.5
43
65
11
155
20
22
21
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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1.96
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3.5
44
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26
20
33
1.97
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43
3.2
43
70
4
129
22
22
22
32
1.98
111077853--111078344
87
5.6
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88
1
644
21
22
21
34
1.97
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1.9
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19
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2
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2
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25
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24
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2.0
209
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22
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127
2.0
127
90
0
399
25
24
19
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111096942--111097104
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63
1
3
31
1.20
111096962--111097106
16
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17
73
17
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2
2
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1.17
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7
18.4
7
71
18
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62
2
1
33
1.17
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9
12.3
9
70
22
58
61
1
1
34
1.16
111096990--111097130
44
3.2
43
75
13
110
62
1
3
32
1.21
111097267--111097313
23
2.0
23
83
0
58
61
2
8
27
1.36
111101742--111101853
19
5.8
19
84
9
147
36
16
9
36
1.82
111101745--111101853
36
2.8
37
86
9
139
37
16
10
35
1.82
111102291--111102749
177
2.6
176
93
0
774
28
19
18
33
1.96
111102847--111102985
41
3.3
40
67
19
122
23
23
23
28
1.99
111102751--111103037
84
3.4
84
89
5
440
22
22
24
30
1.99
111103981--111104016
12
3.0
12
84
15
56
8
8
0
83
0.82
111103982--111104022
15
2.8
14
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10
55
4
9
0
85
0.73
111109639--111109749
19
5.8
19
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11
111
36
18
10
35
1.85
111109655--111109745
35
2.6
36
82
10
116
35
17
10
36
1.85
111110255--111110316
31
2.0
31
87
0
88
27
11
11
50
1.72
111114907--111114939
17
1.9
17
100
0
66
30
0
24
45
1.53
111117947--111118007
3
20.0
3
80
9
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62
4
3
29
1.32
111118178--111118307
3
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3
77
10
122
63
2
3
31
1.22
111120000--111120247
45
5.6
45
67
7
128
29
21
18
30
1.97
111120408--111120857
44
10.3
43
72
12
281
26
25
19
28
1.99
111120498--111120859
88
4.1
88
76
9
328
26
25
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111120388--111120863
262
1.8
260
85
5
663
25
25
19
29
1.98
111120388--111120857
132
3.6
130
84
3
543
25
26
19
29
1.98
111121393--111121437
22
2.0
22
95
0
81
22
13
11
53
1.71
111127189--111127265
40
1.9
40
97
0
145
12
16
35
35
1.88
111129206--111129268
30
2.1
30
85
8
85
26
7
6
58
1.50
111129440--111129497
29
1.9
31
82
6
75
58
3
8
29
1.44
111130929--111130969
20
2.0
20
100
0
82
24
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14
46
1.82
111131142--111131213
30
2.4
30
76
21
80
40
1
1
56
1.16
111131154--111131211
28
2.1
28
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6
82
34
1
1
62
1.16
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31
2.0
31
100
0
124
29
12
9
48
1.73
111140821--111140898
31
2.5
31
91
0
111
26
11
11
50
1.73
111166428--111167175
177
4.2
176
88
2
1056
29
17
25
27
1.97
111166978--111167261
125
2.2
125
81
10
299
30
18
23
27
1.98
111167065--111167301
125
1.9
126
86
4
345
28
18
22
30
1.97
111167445--111167543
51
1.9
51
100
0
198
26
17
22
34
1.95
111178009--111178060
24
2.2
24
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0
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36
3
9
50
1.54
111181487--111181588
50
2.0
50
100
0
204
40
20
3
35
1.71
111183244--111184335
241
4.5
240
88
1
1508
36
16
12
34
1.86
111192022--111192073
27
2.0
27
85
7
72
38
7
5
48
1.56
111192521--111192615
29
3.2
29
66
16
77
45
5
13
35
1.66
111193894--111193919
7
3.7
7
100
0
52
57
11
0
30
1.34
111194861--111194887
10
2.7
10
100
0
54
40
0
7
51
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111198518--111198545
7
4.0
7
100
0
56
14
0
0
85
0.59
111200511--111200625
57
2.0
57
98
0
221
46
9
12
32
1.74
111207991--111208024
16
2.1
17
94
5
61
47
0
0
52
1.00
111208046--111208087
18
2.3
19
83
4
50
35
4
4
54
1.42
111213162--111213246
43
2.0
43
95
2
154
16
16
11
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15
2.9
17
81
12
62
29
0
2
68
1.02
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9
5.7
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10
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0
0
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0.96
111225208--111225261
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2.9
19
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2
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61
0
0
38
0.96
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1.9
18
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0
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2
5
42
1.41
111227765--111227847
42
2.0
42
95
0
148
49
20
3
26
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345