Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  26  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7568739--7568763
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0
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2.0
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3.8
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1
61
1.23
7584595--7584638
20
2.1
21
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4
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6
0
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1.20
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17
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1
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4.4
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117
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5
1
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4.9
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12
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28
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1
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2.3
90
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4.7
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224
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27
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29
2.3
29
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66
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33
2
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3
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3
5
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1.37
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2.1
14
93
6
51
27
0
0
72
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7594966--7595492
270
2.0
266
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817
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3
5
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7595323--7595394
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2.4
30
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2
2
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1.24
7595236--7595445
72
3.0
70
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2
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78
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78
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1241
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17
18
32
1.94
7607571--7608708
307
3.7
308
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5
1453
31
17
18
32
1.94
7607571--7608704
231
4.9
230
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5
1403
31
16
18
32
1.94
7609316--7609385
21
2.9
26
72
25
73
45
34
0
20
1.51
7610494--7611027
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132
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3
5
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0
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3
11.7
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0
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2
0
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4
5
60
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2.8
19
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11
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0
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5.6
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192
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16
27
28
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29
2.3
29
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0
89
31
11
29
26
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4.9
33
90
0
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1.80
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19
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27
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1.98
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2.2
33
90
0
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16
2.4
16
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8
51
44
0
2
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1.14
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2.7
18
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2
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17
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0
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18
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36
0
2
61
1.09
7629885--7629932
21
2.3
20
82
3
51
37
0
4
58
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
25
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18
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0
0
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2.0
23
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0
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1.04
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40
2.2
40
84
0
109
65
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2
23
1.34
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7
68
61
0
1
36
1.06
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5.7
6
89
0
50
5
0
41
52
1.25
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2.5
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0
238
32
23
20
23
1.98
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20
1.92
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3.6
58
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6
223
26
8
15
51
1.70
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1.9
22
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9
59
69
2
7
21
1.25
7674920--7674969
18
2.7
19
81
6
59
42
2
2
54
1.23
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2.0
58
96
0
214
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10
7
38
1.68
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1.8
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81
4
217
29
22
16
31
1.96
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113
2.0
113
89
0
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17
11
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1.87
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12
26
34
1.92
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4
10.5
4
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10
50
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0
21
4
1.01
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15
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18
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0
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21
2.0
21
90
0
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19
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21
29
1.98
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89
2.0
89
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8
231
22
22
18
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7706789--7707072
41
7.0
41
83
4
324
36
23
21
18
1.95
7706789--7707072
123
2.3
122
87
3
392
36
23
21
18
1.95
7707294--7707357
7
9.0
7
79
3
65
25
1
26
46
1.61
7707310--7707360
15
3.5
15
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2
59
21
1
29
47
1.62
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0
1
23
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1
4
22
1.11
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72
1
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1.09
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1
4
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1.11
7711681--7711767
43
2.0
43
95
0
156
49
16
24
10
1.76
7712460--7712693
3
75.7
3
67
14
66
27
9
2
59
1.44
7713195--7713225
16
1.9
16
93
0
53
19
6
6
67
1.35
7714992--7715069
30
2.6
30
100
0
156
47
0
8
43
1.34
7715007--7715060
18
3.3
18
66
28
57
42
0
9
48
1.35
7715142--7715239
43
2.3
43
89
7
146
28
22
25
23
1.99
7715903--7715965
7
9.0
7
87
0
81
44
1
26
26
1.63
7717582--7717611
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
7718689--7718728
20
2.0
20
100
0
80
45
5
35
15
1.68
7726315--7726496
46
4.0
46
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1
213
20
23
14
40
1.90
7726792--7726917
24
5.3
24
67
11
64
35
21
26
15
1.94
7726882--7726975
23
4.0
23
70
15
84
28
23
29
18
1.97
7726886--7726979
48
1.9
49
82
6
120
29
22
29
18
1.97
7727033--7727092
23
2.6
22
76
7
57
25
25
33
16
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7732189--7732250
33
1.9
31
87
6
88
58
1
0
40
1.08
7733343--7733393
26
2.0
26
96
0
93
29
27
7
35
1.85
7733628--7733687
30
2.0
30
90
0
93
48
6
0
45
1.29
7735650--7735708
4
14.8
4
100
0
118
25
0
25
49
1.51
7741046--7741179
51
2.6
51
86
0
196
36
2
13
47
1.58
7744953--7744994
18
2.3
18
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0
57
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0
4
30
1.14
7759323--7759691
44
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11
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30
20
21
26
1.98
7759543--7759704
87
1.9
87
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2
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29
21
23
25
1.99
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3
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3
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0
78
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0
0
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1.9
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5
134
33
5
2
58
1.35
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17
2.1
17
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5
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42
0
0
57
0.99
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28
2.3
27
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16
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45
1
0
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1.10
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19
2.4
19
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7
56
60
4
0
35
1.17
7785938--7786026
27
3.3
27
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3
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30
23
15
30
1.96
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50
4.8
50
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4
284
20
29
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26
1.99
7806209--7806458
100
2.4
104
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6
357
20
29
24
26
1.99
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13
2.5
13
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0
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56
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30
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31
24
0
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1.54
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3
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3
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0
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20
0
1.52
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14
3.4
14
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16
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17
17
8
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1.63
7814191--7814241
6
9.2
6
77
14
56
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31
17
1
1.58
7830511--7830544
2
17.0
2
100
0
68
0
50
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7857007--7857145
69
2.0
69
97
0
260
28
32
12
26
1.92
7862159--7862193
18
1.9
18
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0
52
31
0
14
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1.40
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3
100
0
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0
0
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16
2.0
16
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0
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59
6
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2.1
23
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4
8
14
1.24
7867688--7867725
11
3.5
11
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7
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5
7
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1.15
7867686--7867732
11
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11
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4
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0
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0
0.91
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0
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7867915--7867965
14
3.3
16
81
15
63
66
0
33
0
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345