Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
108
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24
1
31
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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10
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62
0
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29
2.3
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100
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0
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50
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1.65
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2.2
12
100
0
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1.91
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2.5
20
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32
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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19
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1
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2.0
43
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129
59
1
1
38
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7965287--7965315
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0
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0
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0
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12
64
63
3
4
29
1.30
8017772--8017828
27
2.1
27
83
3
71
63
1
5
29
1.27
8018646--8018695
20
2.4
21
87
12
68
38
8
0
54
1.30
8026083--8026116
12
2.8
12
90
0
50
14
32
11
41
1.82
8028712--8028744
15
2.1
16
88
5
50
0
15
3
81
0.80
8045067--8045097
7
4.4
7
95
0
53
48
25
16
9
1.76
8047396--8047431
14
2.6
14
90
0
54
27
0
44
27
1.55
8052755--8052787
14
2.4
14
90
5
50
30
3
0
66
1.06
8055635--8055676
21
2.0
21
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0
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14
14
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66
1.40
8055640--8055681
21
2.0
21
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0
66
14
16
4
64
1.45
8056367--8056395
15
1.9
15
100
0
58
89
0
10
0
0.48
8061572--8061646
21
3.6
20
78
7
69
22
4
2
70
1.16
8061600--8061646
22
2.2
22
85
7
62
23
2
2
72
1.06
8063271--8063312
22
1.9
22
85
9
59
76
9
4
9
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8064213--8064254
12
3.3
12
87
12
50
23
0
4
71
1.05
8064209--8064289
21
3.7
21
73
8
56
29
2
4
62
1.29
8064210--8064254
15
3.2
15
76
23
53
24
0
4
71
1.05
8064210--8064275
27
2.4
27
76
18
66
27
3
3
66
1.21
8064394--8064432
10
3.5
11
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10
53
35
0
10
53
1.35
8064470--8064778
154
2.0
154
94
0
546
31
14
22
31
1.94
8064957--8065040
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
8066515--8066563
25
1.9
26
83
4
64
38
22
14
24
1.91
8072847--8072929
25
3.2
25
85
12
107
37
24
4
33
1.77
8081715--8081759
20
2.2
20
84
4
54
42
13
8
35
1.75
8081724--8081763
20
2.0
20
95
0
71
37
15
10
37
1.80
8083537--8083585
3
16.0
3
87
4
71
32
2
2
63
1.17
8083674--8083733
31
1.9
31
83
6
77
25
6
5
63
1.39
8083944--8083985
20
2.2
20
87
12
61
33
0
7
59
1.25
8084251--8084317
27
2.4
28
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9
84
31
11
5
50
1.63
8084251--8084329
27
3.1
25
78
10
81
31
12
5
50
1.62
8085238--8085331
25
3.6
27
77
8
72
32
7
4
55
1.47
8085268--8085339
25
2.9
25
79
4
74
34
8
5
51
1.55
8094302--8094369
29
2.5
28
77
17
79
64
5
1
27
1.25
8094424--8094465
3
13.7
3
80
14
50
66
0
2
30
1.04
8094437--8094479
23
2.0
21
86
9
59
65
2
6
25
1.30
8094668--8094713
22
2.1
23
92
8
78
60
4
4
30
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8096764--8097120
87
4.0
90
81
7
365
38
16
15
29
1.90
8096699--8097486
164
4.8
163
76
13
636
35
19
16
29
1.93
8097031--8097343
75
4.2
72
85
7
346
35
19
15
29
1.93
8097030--8097484
161
3.0
146
78
12
377
34
19
16
29
1.94
8097261--8097431
88
1.9
87
88
4
254
38
17
15
28
1.91
8097349--8097485
73
1.9
72
87
1
202
32
21
15
30
1.94
8109612--8109640
11
2.7
11
94
5
51
55
6
0
37
1.27
8112651--8112809
26
6.1
26
92
0
255
35
23
6
33
1.82
8112651--8112809
52
3.1
52
95
0
282
35
23
6
33
1.82
8112958--8112985
10
2.8
10
100
0
56
35
21
0
42
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345