Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   

This is table  238  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80733560--80733630
23
3.1
22
67
21
65
23
29
14
32
1.94
80733467--80733659
93
2.1
94
88
1
280
26
29
10
32
1.90
80737119--80737162
6
7.3
6
85
7
54
52
0
11
36
1.38
80737703--80737758
25
2.4
23
76
8
60
53
0
16
30
1.43
80739892--80739993
37
2.8
37
89
2
145
28
31
16
23
1.96
80740200--80740388
93
2.0
93
86
2
263
26
29
11
32
1.91
80740200--80740388
46
4.1
47
88
2
265
26
29
11
32
1.91
80744356--80744624
40
6.8
40
93
0
400
25
28
21
24
1.99
80745881--80745985
37
2.8
37
89
0
156
27
30
17
24
1.97
80746194--80746385
47
4.1
47
89
0
267
26
29
10
33
1.90
80779946--80779989
3
14.7
3
80
0
52
65
4
0
29
1.12
80790749--80790792
19
2.2
20
84
4
54
34
25
18
22
1.96
80794154--80794249
48
2.0
48
95
0
174
31
19
3
45
1.66
80798392--80798539
74
2.0
74
97
0
278
42
20
4
33
1.71
80800140--80800247
26
4.2
26
93
2
164
34
7
22
36
1.82
80805982--80806322
86
4.0
85
82
4
362
30
19
18
31
1.96
80805990--80806310
172
1.9
171
85
3
448
30
18
18
32
1.95
80806864--80806943
28
2.9
28
75
3
90
58
6
13
21
1.57
80812739--80812766
7
4.0
7
100
0
56
0
57
14
28
1.38
80823421--80823451
15
2.1
15
100
0
62
67
0
12
19
1.22
80828999--80829037
21
1.9
20
94
5
69
33
10
25
30
1.89
80829181--80829247
16
4.6
15
74
22
63
56
0
0
43
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80829209--80829251
11
4.1
11
79
11
54
60
0
0
39
0.97
80829191--80829245
20
3.0
19
87
10
71
58
0
0
41
0.98
80830958--80831026
21
3.3
21
83
2
86
11
23
8
56
1.62
80837471--80837526
29
1.9
29
100
0
112
37
10
28
23
1.88
80837868--80837917
14
3.6
14
84
7
57
56
2
0
42
1.11
80837880--80837917
14
2.6
14
95
4
67
60
0
0
39
0.97
80838341--80838385
18
2.5
17
82
10
54
46
6
2
44
1.42
80844173--80844308
40
3.4
39
88
4
166
17
30
18
33
1.94
80844213--80844377
20
8.2
20
69
2
107
15
29
17
37
1.91
80844253--80844366
60
1.9
60
83
0
147
15
27
16
40
1.89
80845828--80845949
43
2.8
43
96
0
217
23
21
31
22
1.98
80846022--80846087
30
2.2
30
83
8
80
56
19
6
18
1.62
80846323--80846384
21
3.0
21
92
0
106
1
51
20
25
1.57
80846787--80846815
14
2.1
14
93
6
51
58
6
0
34
1.25
80846982--80847020
17
2.4
17
86
4
53
48
0
10
41
1.37
80851989--80852077
42
2.1
43
87
4
126
38
1
11
49
1.46
80852041--80852167
17
7.4
17
73
10
89
40
1
10
48
1.47
80851989--80852109
44
2.8
44
83
6
131
38
0
12
47
1.47
80852021--80852199
9
19.4
9
71
11
69
38
1
11
48
1.50
80852021--80852204
26
7.0
26
69
15
94
38
1
11
47
1.50
80851989--80852200
113
1.9
113
83
7
279
38
1
12
47
1.50
80852305--80852360
15
3.8
15
76
21
64
51
0
1
46
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80852570--80853444
355
2.5
354
98
0
1680
37
12
15
35
1.85
80853901--80854266
183
2.0
183
98
0
705
42
14
15
27
1.86
80856912--80856972
26
2.3
26
100
0
122
32
0
45
21
1.52
80857253--80857310
28
2.1
28
83
6
73
36
29
1
32
1.68
80857287--80857330
21
2.1
21
91
0
70
34
34
2
29
1.70
80857539--80857596
21
2.8
21
86
5
73
41
34
1
22
1.64
80857670--80857921
41
6.1
41
88
2
373
21
23
19
35
1.96
80857670--80857911
123
2.0
123
94
0
430
21
23
20
34
1.97
80858765--80858882
45
2.5
46
83
4
139
27
21
15
36
1.93
80863102--80863221
48
2.5
48
85
2
154
27
22
15
35
1.94
80870935--80871205
48
5.9
48
72
15
180
27
17
27
27
1.98
80871023--80871152
42
3.1
40
77
12
120
24
15
29
30
1.96
80871125--80871237
48
2.4
48
89
0
172
30
21
24
23
1.99
80876788--80876842
17
3.4
17
75
10
69
49
18
0
32
1.48
80876794--80876842
15
3.1
15
72
11
53
48
18
0
32
1.48
80876779--80876842
32
2.0
32
96
0
119
45
20
0
34
1.51
80882456--80882567
42
2.7
42
87
2
145
25
17
29
27
1.98
80882537--80882665
48
2.7
48
91
0
204
27
23
24
24
2.00
80890398--80890448
21
2.4
21
86
0
66
39
11
17
31
1.86
80890410--80890455
21
2.2
21
92
0
74
34
10
21
32
1.88
80890530--80890577
24
2.0
25
83
4
62
33
18
20
27
1.96
80898491--80898551
10
5.9
10
77
11
61
37
9
19
32
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80898491--80898551
21
2.9
20
80
4
68
37
9
19
32
1.85
80903809--80903953
20
7.3
20
72
7
98
13
31
20
34
1.92
80903797--80903955
40
4.0
40
85
1
203
15
29
20
33
1.94
80903793--80903940
20
7.4
20
70
1
73
14
29
20
35
1.93
80903793--80903953
79
2.0
80
86
1
225
14
29
21
35
1.92
80910826--80910868
2
21.5
2
100
0
86
0
48
0
51
1.00
80912893--80913009
44
2.7
44
93
0
189
22
17
29
30
1.97
80913814--80913855
20
2.1
20
100
0
84
35
0
11
52
1.38
80921988--80922306
137
2.3
137
84
1
397
21
24
15
38
1.92
80921988--80922306
46
7.0
46
89
1
399
21
24
15
38
1.92
80929336--80929485
39
3.8
39
92
0
228
20
18
28
32
1.96
80934611--80934663
23
2.2
24
83
3
63
43
3
1
50
1.30
80934677--80934753
22
3.5
21
79
15
84
54
1
0
44
1.08
80934674--80934753
23
3.6
22
81
6
81
55
1
0
43
1.08
80934889--80934925
11
3.5
10
89
10
56
75
5
0
18
0.99
80935145--80935177
11
2.9
12
86
13
52
33
0
0
66
0.92
80935393--80935435
22
2.0
22
85
0
59
58
11
11
18
1.63
80935400--80935440
11
3.7
11
80
0
55
56
9
14
19
1.66
80939965--80940278
48
6.5
48
79
3
326
26
28
16
28
1.97
80939982--80940279
144
2.1
144
87
1
418
26
29
16
27
1.97
80942581--80942635
25
2.1
27
83
6
69
60
7
3
29
1.41
80948015--80948084
21
3.2
21
70
18
61
52
2
5
38
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80948024--80948100
24
3.3
24
68
17
63
48
2
6
42
1.42
80948010--80948136
45
2.8
45
79
5
139
47
3
7
42
1.46
80950050--80950200
53
2.8
53
87
4
205
29
28
16
25
1.97
80956404--80956442
18
2.1
19
90
4
62
58
30
0
10
1.31
80956654--80956713
30
2.0
30
86
0
84
41
10
5
43
1.60
80957988--80958067
39
2.1
39
95
0
142
28
18
15
37
1.91
80971179--80971743
291
1.9
291
97
0
1076
44
13
11
30
1.79
80974365--80974562
75
2.8
74
82
10
218
57
2
13
27
1.49
80974430--80974560
65
2.0
67
89
4
205
57
3
10
28
1.50
80974458--80974560
34
3.3
30
71
12
89
55
4
12
27
1.57
80974428--80974772
157
2.2
160
94
1
606
59
3
8
28
1.44
80974496--80974679
92
2.0
90
83
8
230
59
3
7
29
1.41
80974587--80974717
65
2.0
66
86
4
185
58
3
8
30
1.43
80974822--80974854
17
1.9
17
93
0
57
69
0
3
27
1.03
80978320--80978502
40
4.6
40
70
6
129
20
19
27
33
1.96
80978320--80978503
80
2.3
80
82
3
219
20
19
27
33
1.96
80980784--80980813
16
1.9
15
93
6
51
16
0
0
83
0.65
80986414--80986493
39
2.1
39
92
0
133
28
20
21
30
1.98
80994514--80994593
39
2.1
39
92
0
133
27
21
22
28
1.99
80997437--80997499
31
2.0
31
93
6
110
36
6
11
46
1.65
81001506--81001560
27
2.1
26
83
10
67
30
20
0
49
1.49
81004793--81004822
3
10.3
3
92
7
53
63
0
36
0
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81014128--81014178
25
2.0
25
100
0
102
35
31
11
21
1.90
81027016--81027119
34
3.1
34
92
0
181
28
29
22
19
1.98
81028079--81028191
42
2.7
41
79
4
118
43
18
18
19
1.88
81028119--81028205
21
4.1
22
73
8
83
43
16
18
21
1.87
81029319--81029358
21
1.9
21
84
0
53
40
15
5
40
1.68
81033122--81033229
57
1.9
57
84
3
146
27
27
19
25
1.99
81033441--81033784
40
8.6
40
90
1
501
25
26
22
25
2.00
81036046--81036248
47
4.3
47
89
0
307
28
30
8
32
1.87
81048970--81049023
5
10.8
5
83
0
63
40
0
0
59
0.98
81048970--81049023
10
5.4
10
81
0
72
40
0
0
59
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345