Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  328  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110079948--110079976
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4.8
6
100
0
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17
17
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0
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21
1.9
21
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0
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4.4
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64
70
0
1
28
0.98
110100805--110100852
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2.5
19
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62
70
0
0
29
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1
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20
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27
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2.7
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20
25
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2.0
16
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0
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21
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0
0
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0
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2.0
25
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4
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2.0
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100
0
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13
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4
50
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2.9
9
100
0
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46
7
0
46
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2.1
28
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10
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1
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20
1.13
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6
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3
116
26
0
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27
1.59
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23
2.0
23
82
0
56
30
2
13
54
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110151276--110151312
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1.9
19
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0
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2
5
51
1.39
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23
2.9
23
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4
71
40
15
16
27
1.88
110164422--110164469
20
2.5
20
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3
62
64
2
6
27
1.28
110164464--110164526
27
2.3
26
76
10
63
50
11
0
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0
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10
0
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15
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8
55
76
2
5
15
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110167897--110167938
22
1.9
22
85
9
59
71
0
4
23
1.05
110174780--110174811
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1.9
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1.06
110176624--110176671
20
2.5
20
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3
53
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4
6
25
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27
2.3
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10
63
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11
0
38
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15
2.0
15
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10
0
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2.0
66
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0
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18
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12
40
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110180878--110180911
14
2.4
14
90
0
50
44
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5
38
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110181259--110181371
30
3.8
30
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2
140
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47
4
20
1.69
110181861--110181990
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5.6
23
68
18
81
34
4
2
58
1.31
110181867--110182077
25
8.7
25
67
18
124
32
6
3
57
1.41
110182230--110182277
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
110182230--110182281
8
6.5
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82
8
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30
1
1
65
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110192134--110193208
73
13.9
73
74
14
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28
16
21
33
1.95
110192409--110192436
14
2.0
14
100
0
56
14
21
7
57
1.61
110192443--110193210
74
10.0
73
76
11
682
27
16
22
33
1.95
110192206--110193210
239
4.3
230
81
12
1140
27
16
22
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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14
22
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1.93
110192668--110193210
161
3.5
160
81
9
668
27
15
22
33
1.95
110193193--110193227
17
2.1
17
89
10
54
11
17
5
65
1.43
110193368--110193648
77
3.7
76
90
3
399
25
17
20
36
1.94
110193368--110193688
77
4.2
77
87
4
386
24
18
20
36
1.94
110193362--110193690
152
2.2
152
83
5
409
25
18
20
36
1.95
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10
10
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3.4
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0
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3
19
1.67
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83
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155
26
46
4
22
1.69
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23
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3
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2.0
25
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27
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5
55
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110215246--110215278
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0
1.00
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4
2
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1.27
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0
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110222278--110222311
13
2.6
14
86
13
54
14
23
0
61
1.33
110228016--110228061
19
2.4
19
88
0
74
21
0
26
52
1.47
110233620--110233648
3
9.7
3
100
0
58
34
0
31
34
1.58
110243540--110243580
21
1.9
22
90
5
66
41
0
2
56
1.13
110244898--110245064
75
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74
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4
219
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19
19
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110247104--110247167
19
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3
1
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1.19
110248421--110248446
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5
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0
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0
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0
0.96
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19
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30
16
19
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1.94
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1
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1.24
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0
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2
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38
1.70
110269593--110269647
22
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20
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16
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17
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110269756--110269828
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19
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1.80
110269790--110269837
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0
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110275596--110275650
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3.7
15
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2
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87
0
10
1
0.63
110275594--110275650
22
2.6
22
88
5
89
85
0
12
1
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10.0
44
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30
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24
26
1.98
110276549--110276976
132
3.2
132
93
0
705
31
18
24
25
1.98
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159
3.0
159
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0
866
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18
23
27
1.97
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207
5.3
207
93
0
1801
30
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29
1.97
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19
4.9
19
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125
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8
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1.78
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1.78
110278815--110278903
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2.5
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10
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38
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1
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1.23
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1.96
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2.0
37
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0
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1
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1.59
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19
1
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38
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17
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3
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1.38
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2.9
114
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27
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26
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1.96
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1.91
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2.4
21
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15
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20
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0
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1.26
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1.9
241
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0
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1.92
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9
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9
86
0
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1
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1.63
110291171--110291229
27
2.2
27
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0
100
45
23
1
28
1.63
110295910--110295977
22
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22
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10
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41
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23
16
1.90
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22
2.0
22
85
0
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13
9
69
1.35
110297136--110297231
7
13.3
7
76
17
54
48
1
1
48
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110297137--110297230
39
2.6
36
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12
104
50
1
1
47
1.15
110299689--110299771
31
2.6
31
82
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85
15
3
19
61
1.48
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43
5.7
43
91
0
368
27
30
19
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1.98
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46
4.0
46
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39
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24
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14
2.1
14
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0
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30
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0
2
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4
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1.51
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21
2.6
21
77
13
58
32
5
0
61
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345