Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5405733--5405808
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22
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2.3
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3
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0
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2.0
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15
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24
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2.4
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0
2
31
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5454092--5454404
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12
12
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5453993--5454456
195
2.4
193
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11
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2.0
80
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0
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0
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6
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6
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0
95
34
1
15
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12
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5460378--5461087
195
3.6
196
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7
751
33
11
11
43
1.77
5461976--5462018
14
3.1
14
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27
4
11
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1.55
5461975--5462027
27
2.0
27
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1.56
5467554--5467668
27
4.3
26
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149
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23
23
16
1.94
5467554--5467668
54
2.1
54
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169
36
23
23
16
1.94
5469228--5469333
26
4.1
26
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2
169
36
25
4
33
1.77
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27
4.1
26
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5
132
36
22
23
18
1.95
5473317--5473427
54
2.1
54
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3
152
36
22
23
18
1.95
5475010--5475093
26
3.2
26
94
3
143
36
23
3
35
1.73
5478995--5479350
195
1.8
195
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6
479
31
11
12
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1.78
5478995--5479269
97
2.8
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10
243
30
10
13
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1.78
5479040--5479424
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3.9
95
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10
280
33
11
11
43
1.77
5479018--5479416
195
2.0
195
79
8
429
34
12
11
42
1.78
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3.1
14
73
6
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4
11
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1.55
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27
2.0
27
96
0
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26
3
11
58
1.49
5482081--5482413
97
3.4
97
71
9
244
34
11
11
42
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
195
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12
42
1.79
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28
2.1
30
81
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5
28
1.54
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2.1
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10
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1.49
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2.2
24
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3
79
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5
20
1.25
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3
45.7
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11
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4
6
33
1.46
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17
3.4
17
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11
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55
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1
34
1.41
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20
22
22
34
1.97
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1.95
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2.0
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4
6
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1
5
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10
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193
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12
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16
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2.1
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2.1
60
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2.0
13
100
0
52
30
0
15
53
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5529598--5530069
48
9.8
48
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1
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17
100
0
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0
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24
20
1.98
5554024--5554103
40
2.1
38
90
4
124
15
18
23
42
1.88
5555820--5556102
40
7.1
40
87
5
328
24
27
22
25
2.00
5558534--5558583
16
3.0
17
77
11
50
68
4
0
28
1.08
5565510--5565568
29
2.0
30
86
3
84
35
8
6
49
1.60
5565580--5565620
21
2.0
21
85
0
55
53
14
9
21
1.70
5565687--5565747
17
3.4
17
66
16
50
27
3
16
52
1.59
5565674--5565749
38
2.1
38
92
5
129
28
2
17
51
1.59
5568415--5568536
22
5.3
22
62
21
61
25
29
11
33
1.91
5568387--5569034
47
13.6
47
90
3
912
27
28
9
34
1.88
5568408--5569034
143
4.4
143
94
2
1050
27
28
9
33
1.89
5568892--5569033
49
3.1
42
86
13
130
30
27
8
33
1.86
5571554--5571588
16
2.3
15
90
5
52
62
2
2
31
1.24
5571734--5571776
20
2.1
21
82
4
52
62
6
2
27
1.33
5572447--5572471
11
2.3
11
100
0
50
28
0
0
72
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5572802--5572848
18
2.6
18
82
0
67
6
0
29
63
1.19
5572802--5572851
19
2.7
19
81
9
68
8
0
32
60
1.26
5573584--5573836
77
3.3
75
82
7
251
34
18
18
28
1.94
5573616--5573836
77
2.9
78
85
6
272
33
19
18
28
1.95
5573840--5574000
73
2.1
75
85
6
220
31
21
19
27
1.97
5573679--5574150
164
2.8
165
90
2
723
31
20
19
28
1.97
5573916--5574089
91
1.9
88
86
5
242
33
20
18
27
1.96
5574005--5574148
74
1.9
75
90
2
227
27
22
19
31
1.98
5574084--5574205
61
2.0
61
96
0
226
23
25
18
32
1.97
5574008--5574281
137
2.0
136
86
4
381
27
24
18
29
1.98
5574145--5574285
76
1.9
76
90
0
228
31
24
17
27
1.97
5584187--5584221
16
2.3
15
90
5
52
62
2
2
31
1.24
5584367--5584409
20
2.1
21
82
4
52
62
6
2
27
1.33
5584610--5584639
11
2.7
11
89
0
51
60
0
0
40
0.97
5585061--5585112
12
4.1
12
77
20
52
23
0
3
73
1.00
5585429--5585480
24
2.1
25
92
3
88
3
3
25
67
1.25
5585417--5585499
26
3.2
26
75
16
82
3
2
27
66
1.21
5587385--5587436
28
1.9
26
84
7
68
28
1
7
61
1.34
5587823--5587870
14
3.4
14
83
13
55
41
2
0
56
1.11
5589616--5589659
15
2.9
15
86
0
52
47
0
15
36
1.46
5589829--5589863
15
2.3
15
90
0
52
65
0
8
25
1.21
5589864--5590663
88
9.0
88
81
3
827
22
23
21
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5590101--5590231
44
3.0
44
67
8
113
21
25
17
35
1.95
5590731--5590858
64
2.0
64
92
0
211
35
14
17
32
1.90
5601791--5601836
20
2.3
20
82
14
60
28
28
17
26
1.98
5601803--5601846
19
2.2
20
84
4
54
34
25
18
22
1.96
5604548--5604619
34
2.1
35
84
7
94
20
26
11
41
1.86
5609283--5609326
15
2.9
15
86
0
52
47
0
15
36
1.46
5609451--5609801
3
117.7
3
67
8
117
56
1
10
30
1.44
5609933--5609991
29
2.0
30
90
3
93
35
6
6
50
1.55
5610110--5610170
17
3.4
17
66
16
50
27
3
16
52
1.59
5610097--5610172
38
2.1
38
90
5
120
28
2
15
52
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345