Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  74  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23612021--23612076
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18
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0
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16
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3
52
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2
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11
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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28
19
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14
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0
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25
25
23
2.00
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28
1.99
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2.9
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164
24
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19
23
1.97
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48
3.8
48
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10
245
32
24
6
36
1.81
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97
1.9
100
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31
24
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1.81
23786919--23787122
97
2.1
97
78
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215
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25
7
35
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4.0
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80
14
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25
25
24
25
2.00
23791382--23791720
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8.1
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25
24
25
2.00
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23
1.95
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20
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0
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241
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3.1
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0
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1.96
23836873--23837041
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2.3
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250
31
20
19
28
1.97
23836873--23837041
49
3.5
48
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241
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20
19
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0
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1.9
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0
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37
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25
1.91
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2.5
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22
18
27
1.98
23844339--23844459
24
5.0
25
84
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160
31
22
19
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.4
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0
130
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17
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1.93
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1.9
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20
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1
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1.14
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23
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1.96
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28
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28
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40
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27
22
24
2.00
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22
24
2.00
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25
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27
1.95
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2.5
447
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1561
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14
25
27
1.95
23886898--23888067
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26.1
45
63
11
247
32
14
25
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23889502--23889564
29
2.1
30
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1
1
58
1.17
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12
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11
77
7
82
32
0
1
66
1.00
23889509--23889661
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1
1
60
1.16
23889586--23889744
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18
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2
1
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19
106
32
2
1
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1.15
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20
2.0
20
89
0
60
28
2
2
66
1.18
23893379--23893500
28
4.3
28
84
2
136
24
13
32
28
1.94
23895561--23895598
19
2.0
19
85
10
51
42
0
15
42
1.47
23895762--23895818
29
2.0
29
92
0
96
45
0
1
52
1.11
23895747--23895808
8
8.0
8
75
20
51
37
0
1
61
1.06
23895877--23895948
33
2.2
32
85
11
94
40
0
5
54
1.24
23896053--23896105
22
2.5
21
82
17
65
39
0
3
56
1.17
23896059--23896103
22
1.9
24
86
13
67
40
0
2
57
1.11
23897162--23897253
47
2.0
47
82
4
114
25
19
21
33
1.97
23897321--23897376
18
2.9
19
75
20
62
39
12
12
35
1.81
23902837--23902921
29
3.0
29
91
1
127
24
14
34
27
1.94
23905917--23905991
37
2.0
37
100
0
150
33
10
26
29
1.90
23912075--23912170
42
2.3
42
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7
115
31
22
13
32
1.93
23914954--23914997
21
2.1
21
91
0
70
38
22
9
29
1.85
23915733--23915849
48
2.4
48
87
2
137
28
25
20
25
1.99
23915813--23915913
37
2.8
36
85
10
125
24
27
20
26
1.99
23919680--23919798
29
4.2
29
74
4
100
26
12
29
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23920757--23920891
58
2.3
58
96
1
243
30
15
11
42
1.82
23927437--23927549
28
4.0
29
88
3
158
26
14
31
27
1.94
23932813--23932933
27
4.4
27
73
10
93
49
4
19
26
1.68
23934185--23934230
22
2.2
22
88
7
69
50
0
0
50
1.00
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35
2.0
38
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7
127
33
2
12
51
1.53
23941392--23941538
20
7.1
21
68
22
73
26
2
0
70
1.00
23941471--23941518
17
2.8
17
84
9
62
25
2
0
72
0.95
23941468--23941538
15
4.4
16
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10
74
23
1
0
74
0.90
23945012--23945062
25
2.0
25
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7
59
15
23
7
52
1.68
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3.6
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0
238
29
29
18
22
1.98
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790
2.0
790
99
0
3045
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24
21
28
1.99
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3.6
40
78
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124
22
28
20
28
1.98
23956603--23956793
43
4.6
41
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7
156
22
28
20
28
1.98
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43
2.5
43
90
0
164
22
30
22
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1.99
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2.0
64
100
0
260
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30
1.81
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2.1
15
93
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53
36
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1.82
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2.1
34
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8
88
26
20
27
26
1.99
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28
3.0
29
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3
118
28
30
15
25
1.96
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3.3
16
79
7
54
13
16
24
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1.83
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40
2.0
40
87
0
115
32
18
11
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1.87
23993801--23993985
40
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219
23
27
23
24
2.00
23998618--23998654
14
2.6
14
86
0
56
59
5
10
24
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23999805--23999876
31
2.3
31
95
0
126
13
38
26
20
1.90
24002847--24003030
67
2.8
64
76
8
185
30
17
29
22
1.97
24007029--24007070
21
2.0
22
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4
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42
19
19
19
1.89
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5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
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20
2.2
20
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0
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35
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2
48
1.54
24011444--24011541
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2.1
46
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0
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6
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1.72
24023044--24023199
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1
170
26
17
23
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35
100
0
146
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28
10
27
1.91
24054881--24054942
28
2.3
26
75
5
61
58
8
14
19
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345