Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  341  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113380250--113380278
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0
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21
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8
3.6
8
100
0
58
24
13
27
34
1.93
113387707--113387782
23
3.3
23
96
0
143
21
21
26
31
1.98
113393697--113393763
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2.2
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0
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50
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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108
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28
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25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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2.5
120
97
0
568
43
0
4
51
1.28
113583099--113583140
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
113583090--113583131
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
113583256--113583297
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
113583247--113583288
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
113583232--113583470
75
3.1
75
63
16
180
46
3
3
46
1.35
113583076--113583547
157
3.0
157
98
0
890
47
4
3
44
1.40
113583400--113583434
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
113583599--113583689
45
2.0
44
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2
119
37
28
4
29
1.77
113583670--113583721
16
3.2
16
97
0
95
38
38
0
23
1.55
113585666--113586253
3
194.3
3
64
14
122
57
2
10
29
1.46
113585702--113585827
38
3.2
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15
89
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1
10
30
1.41
113585711--113585801
41
2.2
40
78
7
94
57
0
12
30
1.35
113587822--113588010
74
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32
0
8
57
1.34
113588953--113589028
21
3.8
21
74
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71
6
0
22
1.09
113588965--113589028
21
3.1
21
76
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7
0
21
1.12
113593320--113593366
21
2.2
22
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3
78
21
38
19
21
1.94
113601495--113601546
26
2.0
26
85
7
70
30
0
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
2.0
20
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10
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46
0
2
51
1.14
113603039--113603107
14
4.6
15
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22
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46
0
1
52
1.09
113603196--113603254
20
2.8
21
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5
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47
0
3
49
1.18
113603227--113603294
32
2.2
33
82
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81
52
0
2
44
1.16
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161
2.0
163
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389
47
2
8
41
1.47
113604204--113604247
15
2.8
16
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36
0
11
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1.38
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2.5
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11
172
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14
35
1.78
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1.9
18
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0
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28
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1.95
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5.5
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69
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1
25
1.13
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2.5
21
82
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70
1
3
24
1.13
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3
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3
100
0
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0
0
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0.93
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2.0
22
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50
16
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26
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17
2.0
17
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50
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34
2.1
34
100
0
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29
1.9
29
88
0
85
44
5
16
33
1.70
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14
2.7
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2
0
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1.13
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24
2.0
24
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8
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44
0
2
53
1.13
113689750--113689790
20
2.2
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0
26
0
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0.84
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20
1.9
20
100
0
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5
0
50
1.24
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24
2.0
24
86
4
67
41
0
2
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1.11
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93
1.8
93
94
0
306
27
29
21
21
1.98
113693151--113693326
46
3.8
46
81
10
214
28
29
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113695707--113695755
15
3.4
15
78
15
59
61
12
16
10
1.57
113698700--113698870
93
1.8
93
94
0
306
27
29
21
21
1.98
113698692--113698867
46
3.8
46
81
10
214
28
29
21
21
1.98
113700566--113700690
41
3.0
41
88
2
189
32
21
24
21
1.98
113700916--113700979
7
9.0
7
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23
1
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48
1.60
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3.5
15
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2
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21
0
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1.50
113701502--113701572
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9.4
8
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1
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113701496--113701572
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1
0
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99
69
1
0
29
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7
11.0
7
79
9
63
61
1
0
37
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345