Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  101  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33289716--33289770
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11
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1.98
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27
1.9
27
88
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1.82
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280
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29
1.82
33291374--33291577
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29
28
17
24
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2.0
23
100
0
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2.0
90
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0
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6
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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0
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0.80
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1
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2
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1.15
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9
18.3
9
69
20
80
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2
1
34
1.20
33329089--33329278
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10.3
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1.20
33329187--33329278
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2.0
47
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15.9
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31
0
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2.0
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2.0
13
100
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15
15
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25
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59
2.8
59
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22
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49
1.72
33350910--33351069
29
5.4
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18
89
22
23
6
46
1.75
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2.0
30
93
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2.2
22
81
7
53
58
6
16
18
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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1
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3.5
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2
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1.64
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163
20
22
17
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1.92
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2.5
26
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2
110
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64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33444676--33444709
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2.2
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64
0
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32
1.08
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1.86
33471580--33471613
5
6.4
5
93
6
50
0
82
0
17
0.67
33471583--33471616
6
6.0
6
93
6
54
0
82
0
17
0.67
33471580--33471616
11
3.4
11
85
14
58
0
81
0
18
0.70
33481665--33481842
46
3.8
46
80
4
223
28
28
21
21
1.99
33481673--33481843
93
1.8
93
93
0
297
27
29
21
21
1.99
33484405--33484482
40
2.0
40
89
0
120
16
12
34
35
1.87
33491447--33491499
24
2.3
22
78
15
63
47
0
1
50
1.12
33494609--33494633
13
1.9
13
100
0
50
16
4
16
64
1.44
33517626--33519803
728
3.0
728
97
0
4093
32
18
10
38
1.84
33531481--33531551
27
2.7
26
81
14
74
22
1
4
71
1.11
33531513--33531552
11
3.7
11
80
6
55
20
0
2
77
0.88
33531507--33531552
21
2.2
21
92
0
74
21
0
2
76
0.90
33534947--33534984
16
2.3
17
81
4
51
57
2
2
36
1.26
33536621--33536681
32
1.9
32
96
0
113
11
18
11
59
1.61
33537927--33538001
24
3.1
24
86
3
98
20
28
22
29
1.98
33540426--33540551
40
3.2
40
70
0
117
34
26
19
19
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33543858--33543923
13
5.1
13
80
14
82
36
25
7
30
1.84
33543858--33543923
26
2.5
26
87
4
98
36
25
7
30
1.84
33548175--33548370
78
2.5
79
81
5
209
38
26
16
18
1.91
33548128--33548435
80
3.9
80
77
5
259
37
26
16
19
1.93
33548219--33548489
40
6.8
40
71
7
151
38
24
15
21
1.92
33548227--33548435
80
2.6
80
85
5
266
38
25
16
19
1.92
33549674--33549715
15
2.7
15
85
3
57
35
2
26
35
1.70
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24
3.1
24
84
0
105
18
32
22
26
1.97
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22
2.2
21
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36
21
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34
1.84
33553111--33553170
17
3.2
19
83
13
79
35
18
10
36
1.84
33553513--33553541
15
1.9
15
100
0
58
24
6
6
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1.45
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9
3.9
9
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3
61
23
0
0
76
0.79
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18
2.7
20
75
21
52
47
0
2
50
1.12
33575987--33576152
82
2.0
82
92
0
278
35
19
1
43
1.62
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18
1.9
18
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5
52
32
11
0
55
1.36
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10
3.8
10
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60
30
17
17
33
1.94
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25
2.8
25
91
0
104
25
22
22
28
1.99
33589294--33589377
25
3.4
25
81
12
86
28
21
22
27
1.99
33602999--33603059
30
2.0
30
100
0
122
37
6
13
42
1.70
33617760--33617794
18
1.9
18
88
11
54
60
0
2
37
1.12
33619567--33619745
89
2.0
89
95
0
322
41
17
11
29
1.85
33624710--33624992
143
2.0
144
85
0
388
24
21
19
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33628876--33628910
6
5.8
6
90
10
54
17
28
0
54
1.43
33630701--33630794
40
2.4
39
85
3
118
37
38
11
12
1.80
33638160--33638224
27
2.4
27
80
10
78
38
18
13
29
1.89
33639046--33639085
20
2.0
20
85
9
55
17
12
5
65
1.44
33644250--33644296
21
2.3
21
81
3
60
42
14
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36
1.72
33645596--33645641
25
1.9
24
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67
45
2
0
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1.13
33646214--33646257
21
2.1
21
95
0
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25
1.45
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0
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25
100
0
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19
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17
1.84
33660483--33660554
36
2.0
35
84
10
92
41
1
1
55
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345