Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10105695--10105833
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72
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2.7
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9
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27
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2.5
47
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2
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18
15
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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3
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4
6
44
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.54
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2.5
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2.0
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17
26
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10337686--10337798
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10
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1.88
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2.0
21
90
0
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21
29
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0
50
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20
2.4
18
85
7
54
46
2
0
51
1.13
10367620--10367727
54
2.0
54
100
0
216
18
25
12
42
1.86
10368315--10368394
32
2.5
32
79
4
90
52
17
3
26
1.61
10370677--10370719
2
21.5
2
85
0
59
51
41
0
6
1.29
10370677--10370721
12
3.8
12
87
0
72
51
40
0
8
1.33
10379524--10379644
57
2.1
58
86
7
167
26
19
6
47
1.74
10385782--10385815
17
2.0
17
100
0
68
29
11
0
58
1.33
10386248--10386275
5
5.6
5
100
0
56
78
0
0
21
0.75
10390932--10390959
5
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5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
10396488--10396531
6
7.2
6
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52
75
4
0
20
0.98
10396486--10396537
19
2.7
20
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5
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71
3
0
25
1.03
10405501--10405556
6
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0
85
78
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1
16
0.97
10405501--10405556
18
3.1
18
92
0
94
78
3
1
16
0.97
10407290--10407331
15
2.9
15
85
3
59
73
2
2
21
1.06
10407320--10407355
9
4.0
9
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13
56
77
0
11
11
0.99
10407921--10408074
71
2.2
71
86
0
218
12
30
24
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10408746--10408797
27
1.9
27
84
0
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25
26
9
38
1.86
10411567--10411593
9
3.0
9
100
0
54
33
11
0
55
1.35
10411818--10411946
45
2.9
44
74
13
120
21
23
12
42
1.87
10425154--10425236
25
3.3
25
80
8
71
20
26
20
32
1.97
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30
1.9
30
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0
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22
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27
15
1.94
10436377--10436425
3
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3
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12
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34
0
2
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1.06
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16
1.87
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30
2.3
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0
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1.88
10442245--10442298
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12
29
38
18
1.88
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2.6
13
100
0
68
8
26
26
38
1.85
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49
2.0
49
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0
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20
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11
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12
7
0
80
0.90
10450536--10450591
18
3.1
18
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2
67
12
7
0
80
0.90
10455869--10455917
25
1.9
26
83
4
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40
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10
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19
2.1
19
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2
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1.32
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17
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0
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1.15
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0
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1.20
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17
2.7
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0
0
50
1.00
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0
0
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10
52
82
2
0
14
0.77
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21
2.0
21
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0
64
29
21
29
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1.98
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71
2.1
71
80
4
173
29
13
21
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10511012--10511072
30
2.0
30
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6
88
14
29
34
21
1.93
10512850--10512927
10
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11
68
21
53
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3
1
14
0.91
10512886--10512930
14
3.1
15
81
9
58
82
0
0
17
0.68
10512850--10512931
9
8.3
9
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80
3
1
14
0.91
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3.0
16
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68
0
2
29
1.01
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0
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0
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23
17
1.83
10517196--10517255
30
2.1
30
85
11
83
31
1
21
45
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345