Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  33  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
1.05
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4
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1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
55
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28
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2.6
343
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25
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12
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21
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
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23
10
31
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9579468--9579639
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0
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1.71
9623247--9623278
14
2.3
14
100
0
64
31
46
15
6
1.71
9624572--9624617
22
2.1
22
84
11
60
47
6
4
41
1.49
9627742--9627775
10
3.4
10
91
0
59
20
11
0
67
1.21
9635396--9635423
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
9638611--9638635
6
4.2
6
100
0
50
80
0
0
20
0.72
9642408--9642455
20
2.4
20
82
6
53
58
16
22
2
1.49
9642415--9642455
20
2.2
19
86
8
57
60
17
19
2
1.46
9649650--9649690
6
6.5
6
89
10
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80
2
0
17
0.82
9649627--9649684
20
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22
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15
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3
0
24
1.00
9649650--9649691
20
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20
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0
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2
0
16
0.81
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9
4.8
9
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0
77
25
9
18
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1.79
9651146--9651170
11
2.3
11
100
0
50
8
0
0
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0.40
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12
2.2
12
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0
52
34
15
23
26
1.94
9655985--9656146
63
2.6
63
80
1
182
22
22
29
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9659202--9659248
21
2.3
21
82
10
53
44
21
8
25
1.80
9661201--9661362
43
3.8
43
78
8
168
23
15
27
33
1.95
9677235--9677424
68
2.8
68
84
0
247
43
13
11
32
1.79
9677235--9677424
34
5.6
34
81
1
220
43
13
11
32
1.79
9680104--9680194
47
2.0
46
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2
155
54
8
7
28
1.58
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3.0
29
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20
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2
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1.41
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6
6.3
6
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2
5
15
1.04
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2.3
23
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6
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3
9
9
1.12
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17
4.0
17
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11
59
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0
2
25
1.00
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2.1
17
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0
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28
1.69
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1.9
16
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0
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9
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1.33
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4
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0
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25
0
25
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1.50
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37
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3
1
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1.29
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45
4.6
43
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10
209
22
17
15
45
1.85
9705647--9705849
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2.3
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272
22
16
14
45
1.84
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22
1.9
22
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0
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4
0
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1.14
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17
1.9
17
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0
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30
6
0
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1.18
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19
5.2
19
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7
164
36
16
9
37
1.80
9709473--9709570
36
2.6
38
90
9
164
36
16
9
37
1.80
9710951--9710990
11
3.7
11
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3
55
0
22
0
77
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20
2.0
20
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0
51
2
20
0
76
0.90
9710982--9711041
25
2.3
26
80
5
68
13
10
8
68
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9714320--9714356
18
2.1
18
89
0
56
21
16
0
62
1.33
9718331--9718365
2
17.5
2
100
0
70
0
48
0
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1.00
9722725--9722757
14
2.4
14
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0
57
33
21
24
21
1.97
9723338--9723376
5
7.6
5
94
5
69
17
0
0
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2.1
28
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0
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11
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47
1.70
9733012--9733083
35
2.1
35
97
0
135
34
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0
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0
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127
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2.2
14
94
0
53
67
0
0
32
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345