Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  23  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6712465--6712509
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2.1
22
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4
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6726375--6726428
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2.0
178
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1
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14
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133
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1.98
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11.3
45
66
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177
26
16
25
30
1.97
6758486--6759225
266
2.8
265
82
4
659
28
18
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1.98
6760461--6760711
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1.9
132
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18
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0
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0
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19
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3.0
15
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2
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2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6772543--6772639
27
3.6
27
74
20
80
17
2
38
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1.61
6773819--6773912
22
4.3
22
73
15
88
23
2
28
45
1.64
6774672--6774824
40
3.9
40
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224
24
26
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30
1.98
6779622--6779686
22
3.0
22
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0
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16
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10
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1.63
6782298--6782359
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2.0
31
90
0
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29
22
6
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1.78
6782575--6782624
24
2.1
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2
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1.16
6784474--6784517
18
2.4
18
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0
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22
50
9
18
1.75
6784494--6784579
30
2.9
30
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0
136
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1.70
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3
0
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6785113--6785181
25
2.8
25
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4
88
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2
55
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6785199--6785261
25
2.5
24
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72
30
4
6
58
1.43
6785204--6785275
25
2.8
25
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10
67
30
5
4
59
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6785322--6785377
25
2.3
24
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37
16
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2.0
27
100
0
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21
18
23
1.95
6797599--6797955
100
3.7
100
80
8
409
26
16
18
38
1.92
6797872--6798304
148
2.9
146
84
6
548
32
15
18
33
1.92
6797872--6798304
75
5.9
74
85
4
552
32
15
18
33
1.92
6798407--6798439
14
2.4
14
94
0
57
18
12
6
63
1.48
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3.6
89
81
6
336
27
18
18
35
1.94
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102
1.8
103
88
4
294
28
15
17
38
1.91
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30
2.3
30
89
0
111
27
49
5
17
1.69
6800035--6800150
23
4.9
25
75
8
84
36
6
3
54
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6800086--6800228
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5.7
25
72
15
80
31
7
4
55
1.49
6800113--6800220
27
4.0
28
70
15
86
29
6
4
59
1.43
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78
2.2
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16
159
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6
4
57
1.44
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20
2.7
19
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61
39
0
5
54
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4.0
46
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1
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40
15
23
21
1.91
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1.9
74
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1
192
32
18
17
32
1.94
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1.9
24
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4
74
35
0
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50
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121
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4
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0
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27
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0
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1.63
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2.3
21
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44
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15
2.0
15
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0
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18
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18
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0
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30
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20
18
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100
0
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13
1.43
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3.0
46
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2
192
20
21
15
42
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6852128--6852152
13
1.9
13
100
0
50
16
28
24
32
1.96
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0
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15
26
1.95
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3
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19
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0
2
28
1.00
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0
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69
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19
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2
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10
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1
32
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22
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53
29
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29
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1.86
6860117--6860153
6
6.0
6
93
6
65
81
0
2
16
0.81
6860117--6860153
19
2.0
18
94
5
65
81
0
2
16
0.81
6864106--6864130
7
3.6
7
100
0
50
44
12
0
44
1.41
6864450--6864516
29
2.3
30
81
2
73
40
2
7
49
1.46
6865364--6865409
4
11.8
4
82
13
60
21
2
0
76
0.90
6865362--6865412
24
2.1
24
100
0
102
19
5
0
74
1.02
6866793--6866878
45
1.9
45
90
4
138
33
1
2
62
1.15
6866801--6866879
9
8.9
9
78
19
78
34
1
1
63
1.11
6866802--6866879
8
8.9
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14
50
34
1
1
62
1.11
6867833--6867926
30
3.1
30
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1
152
25
25
6
42
1.78
6867843--6867920
15
5.2
15
70
11
70
25
23
7
43
1.80
6872503--6872614
30
3.7
30
93
0
188
25
21
7
45
1.77
6872503--6872610
15
7.2
15
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15
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26
21
7
44
1.78
6879887--6879950
32
2.0
32
100
0
128
46
15
12
25
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6891650--6891700
3
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3
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0
102
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0
0
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24
2.0
24
84
7
64
26
14
36
22
1.92
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17
2.0
17
100
0
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11
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41
1.66
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5
11.2
5
100
0
112
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0
39
1.54
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2.7
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0
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10
0
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1.38
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27
2.0
27
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0
99
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1.85
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15
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15
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27
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18
0
5
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0.99
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21
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20
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3
0
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24
2.0
24
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8
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15
0
8
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1.03
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2.3
17
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0
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17
0
5
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0.96
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2.0
728
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20
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1.97
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22
2.3
21
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10
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14
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24
28
1.93
6934218--6934277
21
2.8
22
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10
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11
3.7
11
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23
2
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1.50
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2.1
24
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0
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19
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18
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6947329--6947453
35
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178
38
11
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1.82
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11
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12
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35
0
0
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0.94
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21
5.3
21
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20
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36
2
0
59
1.18
6947760--6947790
16
2.0
16
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35
0
0
64
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7
15.7
7
69
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38
4
0
57
1.20
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3
11.3
3
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6
52
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6949611--6949654
20
2.2
20
87
0
61
45
20
4
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1.71
6949622--6949662
20
2.0
20
95
0
73
39
17
4
39
1.71
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46
3.8
46
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12
207
30
29
19
20
1.97
6951684--6951854
93
1.8
93
93
0
297
29
29
19
20
1.97
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2.4
14
100
0
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38
26
14
20
1.91
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3.7
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9
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30
20
25
1.98
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2.4
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23
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28
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2.8
9
100
0
50
24
12
0
64
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345