Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  337  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112245034--112245088
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2.1
25
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27
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30
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2.0
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2.0
19
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0
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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T
Entropy
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2.7
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2
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2.9
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0
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1.8
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1.9
19
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10
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3.1
84
80
9
247
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18
21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
112397402--112397700
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3.5
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80
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22
19
21
1.94
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6.0
13
76
18
85
38
49
1
11
1.46
112397939--112398032
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3.3
30
71
19
101
35
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1
13
1.49
112398387--112398520
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45.0
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71
11
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1.23
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23
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32
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0
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1.20
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1
64
1.16
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20
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29
3
2
64
1.23
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0
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13
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66
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112425555--112425869
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17
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1.92
112425551--112425846
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3.5
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11
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18
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1.93
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0
0
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2.3
15
94
5
59
36
9
9
45
1.68
112436214--112436264
23
2.4
22
81
12
61
62
0
1
35
1.06
112436487--112436638
20
7.2
20
69
24
82
59
1
5
34
1.28
112436588--112436645
3
19.0
3
75
22
50
63
0
1
34
1.04
112436589--112436663
7
10.1
7
77
16
71
60
0
1
38
1.06
112436603--112436661
23
2.6
23
83
5
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61
0
1
37
1.07
112436588--112436663
30
2.6
27
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17
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60
0
1
38
1.05
112438288--112438996
206
3.5
205
84
4
835
30
21
17
31
1.96
112438405--112439074
210
3.2
209
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29
20
18
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1.97
112445194--112445388
38
5.0
38
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3
203
30
24
22
22
1.99
112451160--112451196
15
2.5
16
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12
53
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10
24
21
1.84
112454848--112454895
19
2.5
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10
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2
6
37
1.38
112455375--112455446
7
10.1
7
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0
1
38
1.06
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0
2
34
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112459621--112459654
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2.0
17
100
0
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0
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3
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3
100
0
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0
0
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23
2.2
23
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3
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38
2
6
53
1.38
112478713--112478762
13
3.8
13
79
15
50
62
2
0
36
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
18
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60
2
0
37
1.09
112483112--112483165
21
2.6
21
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5
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27
0
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1.57
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30
2.0
30
100
0
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1.92
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37
2.0
37
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0
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0
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1.85
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2.0
131
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35
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1.95
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1.95
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2.1
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1.81
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2.5
24
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10
5
31
1.57
112513713--112513768
5
10.6
5
81
11
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39
0
3
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1.16
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40
0
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1.17
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2.0
22
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44
18
0
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1.50
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2.1
26
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0
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0
0
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0.90
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25
0
6
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1.16
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24
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123
30
4
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59
1.39
112518085--112518351
50
5.0
50
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144
29
5
6
59
1.44
112518110--112518248
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2.7
51
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138
32
5
5
57
1.42
112518422--112518494
26
2.8
25
87
6
92
30
8
2
58
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112519259--112519297
16
2.4
16
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0
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38
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15
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1.92
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3
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3
100
0
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0
0
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2.0
40
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137
18
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1.51
112524204--112524253
10
5.0
10
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10
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1.29
112525800--112525850
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18.0
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0
1
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1.00
112525800--112525850
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0
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1.00
112525798--112525880
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0.94
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0
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1.02
112525798--112525874
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0
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15.8
5
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14
53
71
0
1
27
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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