Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  41  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11665551--11665588
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0
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0
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1.12
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2
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0
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2.6
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1
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53
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117
95
0
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13
24
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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9
9
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20
1.96
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21
20
1.98
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95
2.9
93
83
8
336
32
19
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32
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2.9
45
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18
17
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2.2
140
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18
16
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96
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32
17
16
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1
0
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1.9
22
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2
0
37
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.96
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2.5
33
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0
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28
19
22
1.98
11801366--11801480
44
2.6
44
95
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203
26
27
15
29
1.96
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2.3
20
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20
2.8
19
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60
0
5
34
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11875743--11875782
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0
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0
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20
1.31
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30
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80
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4
5
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1.31
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27
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14
34
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20
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20
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20
95
0
77
44
9
16
30
1.79
11885845--11885891
19
2.5
20
86
6
62
40
12
23
23
1.89
11887830--11887880
24
2.1
24
100
0
102
11
35
9
43
1.75
11893548--11893575
10
2.8
10
100
0
56
32
0
46
21
1.52
11893970--11894030
30
2.0
30
100
0
122
24
13
36
26
1.92
11896177--11896234
28
2.1
28
100
0
116
31
3
24
41
1.71
11896526--11896559
18
1.9
18
88
5
52
17
5
2
73
1.16
11902514--11902561
21
2.1
24
85
11
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54
6
0
39
1.26
11902978--11903004
12
2.2
12
100
0
54
14
0
7
77
0.97
11902971--11903008
12
3.7
10
83
16
51
21
0
10
68
1.19
11908635--11908676
19
2.2
20
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4
68
33
19
0
47
1.49
11912454--11912624
93
1.8
93
93
0
297
28
27
22
22
1.99
11912449--11912621
46
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46
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28
26
21
22
1.99
11914127--11914339
15
14.3
15
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17
142
33
5
0
60
1.25
11914165--11914344
3
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3
77
8
177
32
5
1
61
1.26
11914152--11914200
25
2.0
25
100
0
98
40
0
2
57
1.10
11914568--11914632
27
2.4
27
82
12
73
27
7
3
61
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11914536--11914632
26
3.7
27
76
12
94
28
8
3
59
1.41
11919027--11919067
21
2.0
21
85
0
55
65
4
0
29
1.13
11919700--11919750
26
2.0
27
88
7
79
39
1
3
54
1.30
11919727--11919768
17
2.4
18
92
7
70
40
0
2
57
1.12
11920929--11920986
26
2.3
26
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8
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56
5
3
34
1.38
11924720--11924840
39
3.1
39
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2
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44
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20
13
1.85
11924758--11924822
21
3.2
21
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10
1.79
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2.1
40
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0
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27
1.97
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153
1.8
154
85
2
393
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20
22
26
1.98
11928320--11928379
21
2.9
21
78
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68
50
21
1
26
1.59
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21
2.9
21
80
2
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55
22
0
21
1.43
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0
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0
0
31
0.90
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8
204
35
18
14
31
1.91
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2.1
31
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0
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39
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199
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1.91
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24
2.3
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40
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24
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2.7
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2
148
28
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1.95
11957735--11957853
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2.5
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9
118
32
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26
1.96
11962680--11962730
21
2.4
21
100
0
102
19
29
11
39
1.87
11966128--11966315
49
3.8
49
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2
232
25
19
26
28
1.99
11966114--11966310
100
2.0
101
91
2
324
24
19
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11969321--11969377
15
3.7
16
84
11
75
14
14
8
63
1.52
11969321--11969386
31
2.2
30
86
10
91
13
13
9
63
1.51
11980763--11980831
25
2.8
25
88
0
102
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14
1.91
11986498--11986607
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2.6
42
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5
123
25
15
25
33
1.95
11988229--11988303
4
18.8
4
94
0
132
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0
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2.4
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0
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2
23
34
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23
2.1
23
84
0
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2
31
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0
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2.0
19
100
0
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10
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1.81
11997191--11997222
16
2.1
15
94
5
55
50
28
18
3
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345