Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  177  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60231791--60231843
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0
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4.1
13
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13
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5
20
1
72
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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1.9
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3.3
30
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21
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100
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60282224--60282280
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1.00
60282224--60282291
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3.2
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2.8
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2.3
13
100
0
60
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16
30
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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18
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0
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1
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15
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0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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40
22
22
14
1.90
60326340--60326427
30
2.9
30
78
6
97
29
26
15
28
1.96
60326834--60326858
13
1.9
13
100
0
50
16
32
16
36
1.90
60327312--60327408
30
3.2
30
73
2
79
28
26
14
29
1.95
60329414--60329504
12
7.5
12
70
21
57
74
4
8
12
1.19
60329423--60329480
12
4.5
12
79
14
62
72
3
8
15
1.23
60346666--60346718
15
3.5
15
79
5
63
1
18
1
77
0.96
60348227--60348273
20
2.3
20
81
0
58
23
12
34
29
1.92
60351085--60351119
10
3.7
9
88
11
52
2
8
2
85
0.79
60351085--60351134
19
2.4
19
83
12
55
4
14
4
78
1.05
60354432--60354456
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
60354525--60354600
5
15.0
5
75
17
61
5
18
1
75
1.07
60354538--60354596
24
2.6
22
84
12
75
5
18
1
74
1.09
60354525--60354600
14
5.8
12
76
17
64
5
18
1
75
1.07
60357014--60357060
20
2.3
20
85
0
67
29
36
12
21
1.91
60361842--60361938
30
3.2
30
71
8
81
28
15
27
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60369984--60370025
17
2.5
17
88
7
59
28
19
33
19
1.96
60373481--60373705
40
5.6
40
82
9
246
24
26
22
26
2.00
60373475--60373706
80
2.9
79
82
7
281
24
26
21
26
2.00
60373481--60373706
120
1.9
120
83
7
298
25
26
22
26
2.00
60380045--60380338
38
7.0
38
73
19
212
30
24
14
29
1.95
60380052--60380258
85
2.4
85
95
0
369
30
25
14
29
1.95
60380090--60380303
47
4.7
48
79
12
254
31
23
14
29
1.94
60380175--60380308
48
2.8
48
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3
200
31
22
14
31
1.94
60380090--60380335
133
1.9
132
89
0
384
31
24
14
29
1.95
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15
2.8
15
88
0
66
52
14
16
16
1.75
60384116--60384163
25
1.9
25
95
0
87
37
8
18
35
1.81
60389577--60389710
42
3.2
42
96
2
243
33
20
14
32
1.92
60390702--60390766
27
2.4
27
82
5
78
21
24
18
35
1.96
60390820--60391061
27
8.9
27
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6
132
30
9
18
40
1.83
60390798--60391061
54
4.9
54
73
9
196
30
9
19
40
1.83
60390908--60391102
81
2.4
81
80
5
191
30
9
21
38
1.85
60391065--60391262
27
7.3
27
86
2
263
39
7
23
29
1.82
60391065--60391262
81
2.4
81
91
1
317
39
7
23
29
1.82
60394116--60394371
38
6.0
40
72
22
166
30
24
15
29
1.95
60394161--60394334
47
3.7
47
90
0
240
32
22
14
29
1.94
60397703--60398113
46
9.0
46
91
1
556
40
13
23
21
1.89
60397713--60398113
183
2.2
184
86
1
545
40
14
23
21
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60400266--60400347
26
3.2
26
98
0
155
30
6
26
36
1.81
60412582--60412616
10
3.5
10
88
0
52
37
22
25
14
1.92
60412579--60412626
20
2.4
20
75
0
60
31
18
29
20
1.97
60425006--60425065
27
2.2
27
85
5
77
26
15
23
35
1.94
60425171--60425203
17
1.9
17
93
0
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18
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27
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60426991--60427096
44
2.5
42
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133
32
28
16
22
1.96
60438579--60438731
57
2.7
57
79
9
161
32
19
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7
100
0
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3.2
8
100
0
52
76
0
0
23
0.78
60450027--60450055
15
1.9
15
100
0
58
72
6
6
13
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345