Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  277  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.9
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30
19
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1.98
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94529852--94530124
140
1.9
141
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19
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1.98
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1.9
19
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67
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1.21
94545981--94546128
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2
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2
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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26
24
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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26
31
1.72
94644540--94645160
309
2.0
309
94
0
1082
27
19
29
23
1.98
94648085--94648123
18
2.2
18
85
0
51
12
35
33
17
1.88
94653958--94654093
47
3.0
43
75
14
123
28
27
20
22
1.99
94661449--94661577
46
2.8
46
80
11
158
30
27
20
21
1.98
94661999--94662058
30
2.0
30
87
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86
31
25
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36
1.82
94670542--94670871
170
1.9
170
96
0
615
31
15
9
43
1.79
94671349--94671387
20
2.0
20
94
0
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30
12
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1.92
94674450--94674684
39
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39
90
0
380
25
30
22
21
1.99
94684836--94684897
32
1.9
32
83
0
79
24
17
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20
1.94
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40
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1
324
24
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1.99
94698619--94698791
84
2.1
84
98
0
337
42
4
19
33
1.71
94715771--94715807
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29
2.1
29
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0
113
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1.79
94726888--94727046
43
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9
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25
16
28
28
1.97
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40
4.6
40
79
9
185
25
22
27
24
2.00
94739969--94740132
79
2.1
77
80
8
181
26
20
26
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
3.6
15
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11
12
14
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1.58
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13
2.3
13
100
0
60
23
16
13
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1.82
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51
2.0
51
100
0
208
32
11
31
24
1.91
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46
3.2
46
78
5
165
30
20
28
20
1.98
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40
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24
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27
23
2.00
94760907--94761006
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2.6
37
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32
5
5
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16
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1.94
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16
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32
1.95
94769857--94770415
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734
30
16
21
31
1.95
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219
2.6
219
87
4
785
30
15
20
32
1.94
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4.4
46
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15
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24
18
30
26
1.98
94776898--94777056
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3.3
48
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9
195
24
16
32
25
1.96
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48
2.6
48
84
9
152
28
16
30
24
1.96
94784648--94784874
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4.7
49
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8
225
26
19
28
25
1.99
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2.9
37
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0
135
26
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1.96
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48
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29
2.0
30
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100
24
3
12
60
1.47
94791996--94792034
19
2.1
19
100
0
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10
20
35
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13
2.0
13
100
0
52
30
7
15
46
1.74
94797348--94797423
37
2.1
37
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14
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25
7
23
43
1.80
94803409--94803548
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2.3
60
83
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169
26
24
20
29
1.99
94807309--94807384
37
2.1
37
83
14
95
25
7
23
43
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94808499--94808575
38
2.0
38
97
0
145
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14
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45
1.73
94813088--94813154
7
9.1
8
87
9
67
29
0
56
13
1.37
94813088--94813145
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4.1
14
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4
100
29
0
56
13
1.38
94813088--94813149
21
2.9
21
86
11
90
30
0
54
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2.5
20
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16
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2.0
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12
0
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20
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1.79
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13
3.2
13
89
0
64
36
12
9
41
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345