Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  53  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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26
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2.4
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19
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1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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14
24
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16244040--16244123
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1.9
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14
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35
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1
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2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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4.1
23
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10
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37
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20
20
1.95
16272888--16272974
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2.0
41
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111
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22
20
19
1.95
16274356--16274418
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2.0
32
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9
85
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4
0
49
1.23
16274398--16274451
18
2.9
19
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10
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44
7
0
48
1.31
16274628--16274664
19
1.9
20
88
5
58
35
8
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51
1.55
16275110--16275241
65
2.0
65
98
0
255
43
20
6
29
1.78
16277909--16277958
24
2.1
24
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0
91
30
8
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1.75
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20
2.8
18
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5
1
41
1.37
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1.92
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3
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1
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2.4
18
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0
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18
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5
0
72
1.04
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19
2.3
20
80
7
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40
0
2
56
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
19
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10
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4
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4
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0
27
0
0.85
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2.2
20
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4
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0
25
0
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12
2.1
12
100
0
50
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18
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0
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23
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29
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79
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1.06
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38
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1
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1.08
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44
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2
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1.17
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0.98
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29
1.87
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29
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29
29
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2.0
25
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2.0
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17
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12
92
0
58
34
21
0
44
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16362564--16362591
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14
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0
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0
28
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3.2
9
100
0
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10
0
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1.34
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13
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1.61
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27
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16
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1.60
16368529--16368674
40
3.7
40
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201
34
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2
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2.3
21
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0
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0
0
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1.9
20
89
10
60
55
15
10
18
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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