Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  299  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101464255--101464334
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3.4
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81
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0
0
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180
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3.7
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3.9
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1.98
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1.96
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19
2.9
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1.9
20
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3.5
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29
23
16
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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100
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2.3
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33
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26
1.96
101541569--101541725
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2.8
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1.94
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319
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19
1.93
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48
2.7
45
78
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128
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1.98
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28
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1.97
101554161--101554333
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1.8
94
83
2
231
23
27
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
134
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1.86
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2.0
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100
0
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7
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2.0
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101636141--101636250
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5.7
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25
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68
3
1
26
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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23
21
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1.93
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59
1.9
59
88
0
170
25
8
14
51
1.69
101650732--101650853
47
2.6
47
89
0
190
36
13
22
26
1.92
101650843--101651248
55
7.4
54
71
15
266
34
17
24
23
1.96
101650779--101651236
208
2.1
213
90
5
710
35
16
23
24
1.95
101650779--101651110
101
3.2
101
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382
35
15
23
25
1.94
101651097--101651122
12
2.2
12
100
0
52
50
7
19
23
1.73
101651117--101651248
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2.4
55
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7
173
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19
25
20
1.96
101651459--101651495
9
4.1
9
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0
56
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16
10
27
1.80
101652715--101652768
25
2.2
25
100
0
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25
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101669632--101669656
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2.1
12
100
0
50
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0
16
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1.47
101669646--101669690
23
2.0
23
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4
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6
17
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1.76
101669583--101669644
19
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19
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12
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1.73
101670152--101670216
20
3.1
20
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20
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18
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10
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1.54
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26
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0
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107
2.0
108
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1.60
101679546--101679593
4
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20
50
20
0
2
77
0.88
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23
2.0
23
100
0
90
20
0
4
75
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101679544--101679589
10
4.3
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19
0
2
78
0.86
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23
2.2
23
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22
0
4
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1.00
101679600--101679641
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2.0
21
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4
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0
0
59
0.97
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10
6.5
11
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2
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1.22
101679758--101679788
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2.0
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45
0
0
54
0.99
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13
131
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2
2
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1.27
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2.8
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0
0
60
0.97
101679875--101679942
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3.1
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1
1
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1.19
101679901--101679947
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0
0
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4.3
27
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128
37
22
23
16
1.94
101686331--101686445
54
2.1
54
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162
37
22
23
16
1.94
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26
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0
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6
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5.0
46
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1
350
22
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2.0
27
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0
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22
11
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23
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23
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24
3.0
24
95
0
124
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1
38
25
1.65
101719588--101719681
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1.9
48
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10
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35
4
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23
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27
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27
83
9
128
15
22
22
39
1.92
101721081--101721190
54
2.0
54
85
3
150
15
22
21
40
1.91
101723824--101723874
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13
15
1.52
101723847--101723877
11
2.8
11
90
0
53
61
9
16
12
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101723836--101723877
22
1.9
22
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7
14
14
1.48
101726804--101726877
37
2.0
37
100
0
148
18
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35
37
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2
12.5
2
100
0
50
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0
0
52
1.00
101736828--101736882
17
3.2
16
85
14
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58
1
1
38
1.20
101736837--101736886
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2.3
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2
0
44
1.11
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12
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1.82
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0
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0
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1.40
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4.3
43
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0
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17
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1.96
101750544--101750701
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1.8
86
93
0
271
30
22
17
30
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345