Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  61  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18788500--18788625
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18
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2
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29
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33
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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2.3
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1.97
18967795--18968029
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30
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1.97
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14
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0
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0
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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24
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16
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19038338--19038390
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19049066--19049092
12
2.2
12
100
0
54
0
62
0
37
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19049154--19049214
25
2.4
27
76
18
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4
36
3
55
1.38
19049707--19049732
13
2.0
13
100
0
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0
25
0
74
0.82
19083812--19083871
27
2.2
27
96
0
111
36
23
1
38
1.65
19084600--19084645
24
1.9
24
83
16
60
34
0
10
54
1.36
19084733--19084769
18
2.0
20
89
10
60
37
0
13
48
1.43
19086032--19086119
23
3.8
23
78
4
79
29
11
19
39
1.86
19086128--19086186
27
2.2
27
81
0
64
61
11
5
22
1.50
19087507--19087541
10
3.4
10
88
4
52
51
0
0
48
1.00
19087502--19087548
20
2.3
20
86
10
69
55
0
0
44
0.99
19087562--19087620
17
3.5
17
77
13
59
71
3
16
8
1.25
19087562--19087633
34
2.2
33
80
7
83
72
2
18
6
1.20
19088464--19088604
40
3.6
40
69
10
103
29
14
23
32
1.94
19097547--19097580
11
3.1
11
95
0
59
64
14
8
11
1.49
19101791--19101910
56
2.1
56
98
0
231
45
9
23
22
1.81
19103420--19103729
47
6.6
47
89
2
442
33
8
28
29
1.86
19105714--19105992
40
7.0
40
93
0
450
25
21
26
26
2.00
19107257--19107376
56
2.1
56
98
0
231
45
9
23
22
1.81
19108882--19109190
47
6.6
47
90
2
449
33
8
28
29
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19109165--19109218
16
3.4
16
77
10
65
38
1
25
33
1.67
19109115--19109271
79
2.0
79
98
1
307
33
8
31
26
1.87
19108882--19109190
96
3.3
92
81
7
352
33
8
28
29
1.86
19118682--19118707
13
2.0
13
100
0
52
15
30
38
15
1.88
19119843--19119868
10
2.6
10
100
0
52
46
7
15
30
1.74
19120020--19120163
50
2.9
50
81
2
173
31
18
26
23
1.98
19144544--19144593
24
2.1
24
100
0
100
62
4
4
30
1.32
19149771--19149876
50
2.1
50
96
1
194
23
20
14
41
1.89
19152123--19152169
24
2.0
24
87
4
69
48
34
4
12
1.61
19152640--19153048
46
8.9
46
87
1
439
21
24
14
39
1.91
19153057--19153212
33
4.7
33
71
12
113
22
26
21
29
1.99
19153090--19153214
66
1.9
66
81
3
153
21
28
21
28
1.99
19156209--19156277
30
2.3
30
80
5
77
30
18
4
46
1.69
19159128--19159191
32
2.0
33
90
3
103
43
3
6
46
1.44
19159649--19159673
7
3.6
7
100
0
50
28
0
16
56
1.41
19169465--19169643
47
3.7
47
77
9
164
24
30
20
25
1.98
19169667--19169763
46
2.3
40
76
19
106
26
31
16
24
1.96
19169689--19169854
46
3.6
47
80
8
180
24
30
18
27
1.98
19169702--19169872
94
1.8
92
85
7
238
23
29
18
28
1.98
19171297--19171454
68
2.3
69
81
7
178
36
16
27
20
1.94
19176902--19177316
144
2.9
144
87
1
582
27
30
16
25
1.96
19176931--19177316
48
8.0
48
88
2
497
27
30
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19184307--19184523
48
4.5
47
85
3
247
28
28
16
26
1.97
19184343--19184534
48
4.0
48
88
0
258
29
28
16
26
1.97
19192147--19192228
44
1.9
42
85
5
110
36
23
2
37
1.68
19193724--19193766
13
3.1
14
83
10
52
46
4
0
48
1.22
19194059--19194113
3
18.0
3
96
3
101
0
32
0
67
0.91
19195350--19195415
32
2.1
32
94
0
114
63
9
18
9
1.49
19195403--19195470
13
5.3
13
75
8
59
75
0
19
5
1.01
19195362--19195434
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2.5
30
85
14
93
71
5
17
5
1.25
19195669--19195741
31
2.4
32
78
19
93
45
2
1
50
1.24
19198140--19198190
27
1.9
26
96
4
93
39
3
23
33
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345