Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  70  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22231635--22231848
41
5.2
41
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6
175
18
14
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40
1.89
22232502--22232543
16
2.6
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4
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1.76
22235444--22235566
28
4.4
28
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2
176
33
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13
26
1.93
22241596--22241637
13
3.2
13
90
6
66
2
19
0
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0.86
22242503--22242553
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2.4
22
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5
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41
1.72
22247903--22248039
38
3.6
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2
141
16
22
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32
1.96
22247903--22248253
41
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5
188
17
19
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1.93
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41
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41
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7
212
17
18
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37
1.92
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3.1
81
81
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258
18
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123
2.3
122
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6
302
17
17
26
38
1.92
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82
2.2
82
81
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193
17
15
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19
2.2
19
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2.1
24
100
0
100
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24
2.2
24
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0
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40
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1.9
21
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43
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2.0
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60
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27
26
19
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1.99
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46
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96
2.0
96
88
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286
46
20
8
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1.78
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28
2.3
28
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32
27
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32
1.85
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28
2.2
29
88
8
94
22
22
23
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22280610--22280673
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2.2
28
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2
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25
25
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31
1.98
22281124--22281162
19
2.1
19
85
0
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15
5
7
71
1.26
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10
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10
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29
8
8
52
1.62
22287791--22287855
28
2.3
28
91
0
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32
27
7
32
1.85
22287961--22288023
28
2.2
29
88
8
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22
22
23
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1.98
22287971--22288034
28
2.2
28
86
2
83
25
25
18
31
1.98
22288487--22288525
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
22291069--22291178
21
5.2
21
72
4
80
17
23
16
42
1.88
22291167--22291219
21
2.6
21
82
5
65
9
20
22
47
1.79
22291071--22291199
42
3.1
42
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2
134
17
23
16
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1.87
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2.0
18
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44
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2.0
144
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0
0
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2.0
22
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41
13
23
20
1.88
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0
132
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5
32
1.80
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27
3.8
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2
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41
18
18
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1.90
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31
2.0
31
93
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40
14
17
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2.0
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1
208
26
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1.97
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27
2.1
27
100
0
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12
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5
100
0
50
0
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60
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2.3
27
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10
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38
7
14
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1.75
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492
2.0
494
94
2
1768
27
17
14
40
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.63
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16
2.6
17
75
7
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36
2
0
61
1.09
22351132--22351202
16
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22
52
33
2
0
63
1.09
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25
0
0
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2.0
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2.0
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0
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2.0
20
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20
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1.97
22365368--22365452
22
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22
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1.97
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1.9
44
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32
20
21
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0
0
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1.00
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0
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0
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19
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0
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90
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20
40
1.80
22378064--22378136
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103
20
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11
5
1.56
22392702--22392777
11
7.1
10
76
7
62
56
26
11
5
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22392965--22393000
9
4.0
9
88
0
54
16
41
8
33
1.78
22413815--22413867
26
2.0
27
82
10
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32
11
11
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55
4.0
54
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242
22
25
16
35
1.94
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16
2.2
16
94
0
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40
2
28
28
1.71
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2.0
21
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60
4
0
34
1.17
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17
2.5
17
76
0
50
48
13
6
30
1.69
22427190--22427232
19
2.2
20
87
4
61
39
11
11
37
1.78
22436689--22436748
29
2.1
27
84
6
75
61
1
3
33
1.22
22449446--22449492
21
2.3
20
79
13
51
53
4
0
42
1.20
22450024--22450069
21
2.3
21
79
20
55
58
2
0
39
1.10
22450639--22450675
19
1.9
19
94
0
65
43
0
0
56
0.99
22457877--22457936
24
2.5
26
73
15
65
51
11
11
25
1.72
22474996--22475034
18
2.2
18
90
4
62
20
30
33
15
1.94
22490935--22490969
15
2.2
16
90
5
54
2
20
0
77
0.90
22498785--22498867
27
3.1
27
71
10
80
38
18
1
42
1.58
22498827--22498893
13
5.2
13
70
13
57
34
19
1
44
1.60
22498952--22499021
25
2.8
25
84
0
86
31
17
25
25
1.97
22502395--22502439
23
1.9
24
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4
65
28
46
2
22
1.63
22521853--22521885
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
22523421--22523558
57
2.4
57
92
0
231
37
17
12
32
1.87
22529055--22529141
24
3.5
24
76
13
86
35
3
1
59
1.22
22529057--22529142
8
10.1
9
83
5
67
37
3
1
58
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22529118--22529175
30
2.0
30
83
10
75
37
1
3
56
1.26
22529055--22529124
8
8.4
8
85
6
86
35
4
0
60
1.17
22531927--22532033
39
2.7
39
89
0
169
25
25
27
22
2.00
22531940--22532124
91
2.0
91
92
0
307
23
28
28
20
1.99
22531979--22532085
52
2.1
52
96
0
196
25
28
26
19
1.99
22532031--22532263
39
6.0
39
91
1
351
22
25
28
22
1.99
22532031--22532248
117
1.9
117
95
0
391
22
27
29
21
1.99
22534713--22534741
12
2.4
12
100
0
58
6
27
41
24
1.80
22542593--22542652
24
2.5
24
72
0
57
56
1
0
41
1.09
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27
7.4
27
82
4
201
26
14
28
29
1.95
22550255--22550455
54
3.7
54
80
5
226
26
14
28
29
1.95
22560392--22560469
40
2.0
40
97
0
147
38
28
16
16
1.91
22560399--22560485
40
2.2
40
87
0
120
40
29
16
13
1.87
22569720--22569788
35
2.0
35
97
0
129
34
21
23
20
1.96
22579243--22579427
46
4.0
46
78
10
180
27
17
30
24
1.97
22579248--22579464
46
4.7
44
76
14
152
27
17
30
24
1.97
22592506--22592540
17
2.1
17
100
0
70
40
14
5
40
1.69
22601150--22601420
48
5.6
48
80
3
274
29
16
27
26
1.97
22604846--22604944
50
2.0
50
83
0
126
24
23
18
34
1.96
22604809--22604946
25
5.5
25
75
3
89
23
21
20
34
1.97
22605099--22605160
31
2.1
30
82
17
76
45
8
17
29
1.77
22606724--22606785
30
2.1
30
87
0
88
37
12
22
27
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22607275--22607383
47
2.3
48
81
6
116
28
19
28
23
1.98
22608433--22608474
22
2.0
22
90
4
68
9
38
26
26
1.87
22609758--22610075
46
6.7
46
74
10
216
28
20
29
22
1.98
22610274--22610501
40
5.7
40
89
3
334
26
21
26
25
2.00
22618317--22618523
40
5.2
39
90
5
285
24
23
27
24
2.00
22625099--22625282
40
4.6
40
81
6
221
25
23
25
25
2.00
22625099--22625282
80
2.3
80
86
5
248
25
23
25
25
2.00
22628390--22628444
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2.1
26
96
0
101
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12
0
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1.41
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26
2.3
26
93
3
100
58
6
18
15
1.59
22630649--22630687
19
2.0
20
95
5
71
46
5
7
41
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345