Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  43  of  345  ( 41358 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.7
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44
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30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2.0
77
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2.4
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2.0
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2.2
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211
24
28
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.4
19
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23
70
33
5
1
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12558868--12558917
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0
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0
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33
1.89
12575336--12575360
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
12587095--12587134
13
2.8
15
85
14
66
35
0
0
65
0.93
12590315--12590679
83
4.5
83
79
10
353
18
18
22
40
1.92
12592208--12592257
14
3.6
14
86
2
75
52
12
0
36
1.39
12593847--12594030
81
2.2
79
80
16
203
19
19
21
39
1.92
12686783--12686972
51
3.7
51
90
2
294
31
24
14
30
1.94
12690913--12690969
30
1.9
30
88
0
87
38
8
24
28
1.85
12695858--12695929
36
2.0
36
86
10
103
20
20
16
41
1.90
12699702--12699735
17
2.0
17
88
0
50
47
0
2
50
1.16
12699680--12699750
21
3.0
24
74
13
76
38
0
1
60
1.06
12701620--12701700
30
2.7
30
84
3
110
44
2
34
18
1.63
12705700--12706279
288
2.0
290
88
2
862
37
13
15
34
1.86
12710960--12711015
16
3.5
16
76
9
60
33
1
12
51
1.50
12722851--12722919
33
2.1
33
100
0
138
30
20
10
39
1.85
12729269--12729397
48
2.7
48
86
3
170
30
18
24
26
1.98
12729428--12729666
42
5.6
42
75
10
191
28
14
25
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12729469--12729666
43
4.7
42
79
8
195
28
15
25
30
1.96
12729456--12729666
85
2.5
85
87
0
296
28
14
25
31
1.95
12729428--12729666
127
1.9
127
81
5
295
28
14
25
31
1.95
12734292--12734373
42
2.0
41
86
6
114
50
2
20
26
1.61
12737888--12737932
22
2.0
22
100
0
90
31
4
17
46
1.68
12752279--12752329
6
8.2
6
79
16
59
78
0
5
15
0.93
12762093--12762252
43
3.8
42
76
14
150
29
26
18
25
1.98
12770269--12770330
29
2.2
29
94
2
108
43
11
19
25
1.84
12776563--12776647
40
2.2
40
84
2
109
27
16
27
29
1.97
12776662--12776762
28
3.6
28
73
5
87
29
15
29
24
1.96
12779254--12779466
42
5.0
43
79
4
130
34
26
14
24
1.93
12779336--12779466
42
3.1
41
82
4
145
38
25
10
25
1.88
12779435--12779515
43
1.9
43
87
2
119
30
27
13
28
1.94
12780078--12780171
39
2.4
40
90
1
145
35
25
17
22
1.95
12781888--12781933
18
2.6
17
86
6
65
60
2
0
36
1.09
12781891--12781931
18
2.2
19
91
4
66
65
2
0
31
1.05
12783028--12783059
7
4.6
7
100
0
64
62
12
0
25
1.30
12800634--12800711
38
2.1
38
97
0
147
28
20
19
32
1.97
12801667--12801748
27
3.1
26
89
5
119
35
20
25
18
1.95
12803547--12803589
18
2.3
19
80
11
54
46
23
9
20
1.79
12805184--12805254
28
2.5
28
76
0
79
33
28
8
29
1.86
12808395--12808671
42
6.3
42
74
13
202
29
25
17
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12808507--12808647
48
2.9
48
87
2
203
27
24
17
30
1.97
12808642--12808779
37
3.8
37
84
6
167
26
27
18
28
1.98
12810770--12810808
20
1.9
20
84
5
51
30
7
5
56
1.49
12829580--12829692
38
2.9
38
85
2
127
24
24
24
25
2.00
12829675--12829850
86
2.1
84
91
2
280
12
23
33
30
1.92
12829694--12829850
43
3.7
43
92
0
260
12
23
33
31
1.91
12832213--12832354
47
3.0
47
94
1
250
28
12
14
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1.82
12833174--12833329
43
3.6
44
82
6
185
27
20
28
23
1.99
12833157--12833329
88
2.0
88
86
5
244
26
20
27
25
1.99
12833856--12833888
16
1.9
18
88
11
52
24
15
12
48
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345