Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  334  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111483935--111485407
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735
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0
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2.2
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1.84
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19
3.2
19
90
4
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33
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1.83
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2.0
26
92
0
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47
0
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33
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2.1
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44
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35
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0
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1.22
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4.0
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22
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2.0
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4.1
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0
0
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61
0
0
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21
2.5
21
93
0
88
30
37
9
22
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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0
0
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2.1
16
88
5
50
42
0
0
57
0.98
111551735--111551827
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20
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2
2
29
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50
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26
1
5
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75
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2
4
62
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24
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2.3
25
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3
78
30
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210
3.8
209
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971
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18
21
29
1.97
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206
3.4
201
85
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797
30
18
21
29
1.97
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2.0
22
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11
60
41
0
2
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1.9
27
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79
32
3
1
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1.25
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26
3.2
26
96
0
150
34
5
23
35
1.80
111586858--111586910
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2.0
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72
37
22
15
24
1.92
111591035--111591144
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4.2
26
95
0
175
34
5
24
35
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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1.84
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26
4.0
26
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1
18
37
1.61
111607470--111607596
57
2.2
57
95
1
229
41
3
18
36
1.69
111607481--111607599
26
4.4
26
72
15
89
44
3
16
35
1.65
111608150--111608226
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3.0
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75
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3
53
1.42
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2.5
20
78
15
59
39
1
3
54
1.30
111608669--111608718
22
2.4
21
80
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59
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2
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19
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56
50
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319
21
23
16
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111645070--111645229
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23
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17
34
1.96
111645027--111645240
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2.5
84
96
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23
24
16
35
1.95
111655671--111655814
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3.6
40
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111655635--111655814
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111660676--111660831
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41
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3
262
26
19
23
30
1.98
111660676--111660873
82
2.4
82
85
6
269
27
20
23
28
1.99
111668253--111668408
41
3.8
41
96
1
278
26
19
23
30
1.98
111668253--111668450
82
2.4
82
87
5
285
27
20
24
28
1.99
111669740--111669883
40
3.6
40
82
7
193
24
26
22
26
2.00
111669704--111669883
80
2.3
79
86
5
240
25
26
22
25
2.00
111673105--111673159
28
2.1
26
83
10
67
25
21
14
38
1.92
111673401--111673487
44
2.0
44
100
0
174
51
6
16
25
1.68
111674128--111674834
139
5.1
141
80
13
774
59
5
3
31
1.37
111674434--111674468
18
1.9
18
88
11
54
57
2
2
37
1.29
111674491--111674644
3
50.7
3
67
15
50
59
3
5
32
1.36
111674491--111674527
18
2.1
18
89
0
56
56
2
2
37
1.28
111674452--111674771
120
2.6
122
80
11
352
58
5
4
32
1.38
111674736--111674848
3
38.0
3
71
11
63
61
3
2
31
1.26
111674311--111674803
262
1.9
264
85
5
701
59
4
3
31
1.36
111674759--111674901
61
2.4
59
85
6
193
62
3
4
29
1.30
111674587--111674848
143
1.8
139
83
8
341
59
4
3
32
1.36
111674619--111674895
143
2.0
143
80
11
322
61
3
3
30
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111674963--111675014
3
18.0
3
80
11
56
67
0
1
30
1.02
111676547--111676580
13
2.5
14
85
9
52
61
5
14
17
1.52
111676641--111676792
77
2.0
77
97
0
286
32
23
17
26
1.96
111688780--111688944
43
3.9
43
85
4
174
26
21
29
23
1.99
111688877--111688971
41
2.3
42
81
7
104
29
21
28
21
1.98
111688834--111689025
43
4.6
40
74
7
116
28
19
27
24
1.98
111691708--111692472
3
252.7
3
65
19
105
60
4
3
31
1.34
111691623--111692445
141
5.9
140
82
12
1005
60
5
3
31
1.34
111691631--111692444
279
2.9
280
91
5
1292
60
5
3
31
1.34
111692076--111692129
14
3.7
15
78
14
51
62
5
0
31
1.18
111692465--111692679
67
3.1
67
72
19
213
63
3
3
29
1.29
111692528--111692594
21
3.3
20
78
15
59
59
5
1
32
1.31
111692565--111692612
3
16.0
3
82
8
62
62
2
2
33
1.18
111692672--111692723
22
2.3
23
81
15
65
59
3
3
32
1.33
111692729--111692785
3
19.7
3
78
10
57
68
0
1
29
1.00
111693345--111693369
10
2.5
10
100
0
50
8
0
0
92
0.40
111696538--111696603
26
2.4
27
82
5
80
57
4
0
37
1.19
111708214--111708277
31
2.1
30
88
8
94
60
0
0
39
0.97
111711712--111711754
22
1.9
23
85
4
61
37
13
4
44
1.65
111715581--111715621
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
111722107--111722165
31
1.9
31
92
0
100
42
6
11
38
1.68
111727266--111727356
44
2.1
44
91
0
146
28
13
7
50
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111727672--111727721
20
2.5
20
93
0
91
28
4
14
54
1.58
111728835--111728868
15
2.3
15
89
0
50
61
8
0
29
1.26
111733465--111733521
16
3.4
16
68
17
53
21
26
15
36
1.93
111733462--111733531
34
2.1
34
97
0
131
20
24
14
41
1.89
111733427--111733573
79
1.9
80
89
1
233
18
25
14
41
1.88
111733496--111733810
46
6.9
46
93
0
443
21
25
13
40
1.89
111735590--111735869
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90
5
381
28
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19
27
1.98
111738781--111738828
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10
60
60
2
0
37
1.09
111743834--111743873
19
2.1
19
86
9
55
35
5
0
60
1.19
111746444--111746539
31
3.0
31
77
7
102
40
3
10
45
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345