Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  16  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4974642--4974671
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10
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5
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0
10
0
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0.47
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2.0
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0
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4978234--4978264
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2.0
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6
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177
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0
1008
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18
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1.97
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2.7
45
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2
174
27
20
21
30
1.98
4985004--4985044
21
1.9
22
85
5
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29
2
12
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1.49
4985124--4985162
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15
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23
0
5
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1.05
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2.5
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2
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3.7
26
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14
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5
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2.2
27
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1.28
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1.9
19
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10
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12
5
5
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4986992--4987031
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2.0
21
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12
5
5
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1.09
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5.6
46
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10
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34
14
22
28
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4995447--4995655
52
4.1
51
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9
293
35
13
22
28
1.92
4995533--4995566
7
4.7
7
88
3
50
44
2
26
26
1.69
4995619--4995764
37
4.0
37
92
1
233
36
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1.94
4996411--4996668
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1
338
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22
2.0
23
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12
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4
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22
2.0
22
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0
59
58
11
11
18
1.63
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11
3.7
11
80
0
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56
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22
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2.4
50
90
4
188
26
20
11
41
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5002829--5002922
31
3.1
31
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13
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58
5
0
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1.21
5002830--5002884
11
5.2
11
77
4
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65
1
0
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1.03
5004074--5004108
16
2.2
16
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0
70
11
40
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1.65
5007995--5008206
46
4.6
45
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5
264
42
13
23
20
1.88
5009521--5009571
25
2.1
24
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10
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17
17
15
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5018334--5018365
16
2.0
17
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50
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6
0
46
1.27
5019846--5020122
106
2.6
107
83
2
333
24
22
22
30
1.99
5021036--5021096
22
2.7
23
82
7
90
45
18
19
16
1.85
5021036--5021104
22
3.1
22
77
4
77
46
17
17
18
1.85
5024062--5024119
11
5.4
11
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10
75
55
0
1
43
1.10
5024062--5024122
5
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5
78
15
52
54
0
1
44
1.10
5024062--5024125
33
2.0
32
85
14
87
54
0
1
43
1.09
5024063--5024218
38
4.2
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19
100
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3
2
41
1.31
5029716--5029755
21
1.9
21
85
10
55
55
2
7
35
1.42
5047229--5047269
21
2.0
22
85
9
59
56
14
7
21
1.63
5048718--5048774
17
3.5
17
72
13
66
66
12
15
5
1.41
5048715--5048783
31
2.2
32
97
2
131
66
11
15
5
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5053762--5053791
15
2.0
15
93
0
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26
16
30
26
1.97
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3.3
18
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20
54
60
1
3
34
1.23
5056372--5056408
19
1.9
19
94
0
65
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2
13
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2.3
24
82
14
62
57
8
3
30
1.47
5056492--5056566
30
2.5
30
81
10
82
56
6
2
34
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5056604--5056660
27
2.0
27
83
6
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64
7
0
28
1.19
5056604--5056645
23
2.0
21
86
13
59
61
7
0
30
1.22
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14
2.8
13
81
11
51
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7
17
28
1.76
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89
3.8
88
81
8
333
36
19
16
27
1.93
5058763--5058902
71
2.0
71
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2
192
32
22
15
29
1.95
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90
2.6
90
81
5
311
37
16
15
30
1.90
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14
2.2
14
100
0
62
58
6
16
19
1.59
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18
16
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1.93
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26
2.2
25
82
8
71
39
22
25
12
1.89
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6.2
26
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221
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24
6
32
1.81
5170074--5170188
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4.3
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5
131
35
22
24
17
1.95
5170074--5170188
54
2.1
54
85
3
160
35
22
24
17
1.95
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26
6.2
26
94
0
261
35
25
6
32
1.82
5175904--5176018
27
4.3
26
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5
149
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23
23
16
1.94
5175904--5176018
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2.1
54
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3
169
36
23
23
16
1.94
5176119--5176194
26
2.8
27
84
4
91
32
11
19
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1.88
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4.2
26
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1.83
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32
16
17
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1.93
5192915--5193365
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5.8
77
84
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545
33
16
17
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1.93
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1.9
13
100
0
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0
0
12
0.53
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2.4
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15
89
40
18
1
40
1.59
5194149--5194191
19
2.2
20
87
4
61
4
11
6
76
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5209651--5209694
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2.0
21
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0
2
25
0.96
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2.1
25
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19
11
1.63
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3
101.0
3
66
16
92
28
5
3
61
1.36
5210993--5211041
23
2.2
22
81
3
53
30
8
2
59
1.38
5211090--5211180
30
2.9
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11
107
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7
2
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15
2.2
16
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5
54
22
8
0
68
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17
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10
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23
9
2
65
1.34
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125
2.1
127
84
5
343
35
12
15
36
1.86
5213404--5213511
51
2.2
50
83
5
137
43
19
25
11
1.84
5213892--5213925
17
2.0
18
88
11
54
44
50
0
5
1.26
5213914--5213962
25
1.9
25
84
12
64
46
42
0
10
1.37
5214957--5215000
19
2.4
19
88
7
65
36
0
2
61
1.09
5214957--5215000
18
2.4
18
88
7
63
36
0
2
61
1.09
5215096--5215140
16
3.1
15
81
12
58
33
0
6
60
1.23
5215100--5215139
18
2.2
19
86
4
55
35
0
5
60
1.19
5215184--5215236
21
2.5
22
82
8
58
35
5
5
52
1.49
5221315--5221516
109
1.9
109
92
2
343
32
19
17
29
1.95
5221713--5221746
9
3.8
9
88
11
52
64
0
2
32
1.08
5221798--5221855
13
4.5
13
73
16
57
55
3
1
39
1.27
5222071--5222103
6
5.5
6
100
0
66
81
0
0
18
0.68
5222125--5222161
3
12.3
3
94
0
65
67
2
0
29
1.04
5223717--5223848
45
3.0
45
74
8
126
22
21
25
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5223797--5224464
88
7.6
89
91
2
883
25
25
21
27
1.99
5223885--5224022
43
3.1
44
67
19
124
24
24
24
26
2.00
5223885--5224023
44
3.2
44
68
15
133
24
24
25
25
2.00
5224332--5224464
45
3.0
45
66
14
132
27
21
18
33
1.96
5226108--5226149
6
7.0
6
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10
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0
19
0
80
0.70
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24
2.1
23
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3
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2
16
0
82
0.77
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23
2.2
24
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3
68
3
17
1
76
1.03
5226162--5226203
8
5.4
8
85
5
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14
0
7
78
0.95
5226162--5226194
15
2.2
15
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0
57
12
0
9
78
0.95
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19
2.5
20
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6
57
42
12
18
26
1.85
5230191--5230392
109
1.9
109
92
2
343
32
19
17
29
1.95
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9
3.8
9
88
11
52
64
0
2
32
1.08
5230946--5230978
6
5.5
6
100
0
66
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0
0
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0.68
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3
11.3
3
93
0
59
67
2
0
29
1.05
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2.0
36
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0
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16
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43
1.86
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14
2.4
14
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0
50
26
14
0
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1.36
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3.6
83
78
12
276
28
15
18
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1.92
5234803--5235311
87
6.0
83
73
18
306
27
16
19
36
1.93
5235149--5235182
14
2.4
14
90
0
50
20
17
2
58
1.51
5235068--5235255
87
2.2
87
93
1
326
28
18
17
36
1.93
5235162--5235399
73
3.2
72
82
5
289
27
16
20
35
1.94
5235383--5235417
17
2.1
17
88
0
52
14
8
2
74
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5235400--5235794
77
5.1
76
71
16
236
27
15
21
35
1.94
5235236--5235723
165
3.0
162
85
4
604
26
15
20
36
1.93
5235585--5235794
77
2.8
75
85
7
275
29
14
23
32
1.94
5236005--5236109
44
2.4
44
90
0
156
26
17
28
27
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5236379--5236412
17
2.0
18
88
11
54
44
50
0
5
1.26
5236401--5236449
25
1.9
25
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12
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42
0
10
1.37
5237398--5237461
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2.1
31
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2
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25
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12
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2.5
17
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37
0
2
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1.10
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8
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5
5
52
1.49
5239329--5239622
41
6.7
41
73
13
237
35
17
17
30
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345