Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  262  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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20
30
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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29
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22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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28
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1.99
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2.00
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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A
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(0-2)
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39
87
3
134
31
18
25
24
1.98
89477440--89477655
39
5.5
39
89
1
333
20
22
28
28
1.99
89477355--89477642
78
3.7
78
83
5
307
23
20
27
27
1.99
89481736--89481760
10
2.5
10
100
0
50
8
8
0
84
0.79
89484640--89484725
43
2.0
43
93
0
145
19
19
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29
1.97
89487658--89487816
35
4.5
35
79
0
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28
8
19
43
1.80
89490127--89490177
18
2.8
18
81
0
57
25
9
23
41
1.85
89492255--89492470
46
4.7
46
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12
253
29
28
20
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1.98
89492310--89492479
93
1.8
93
92
0
286
29
27
20
22
1.98
89496226--89496250
12
2.1
12
100
0
50
56
0
24
20
1.43
89499924--89500187
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40
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270
25
28
21
25
1.99
89499924--89500191
79
3.4
78
79
7
290
25
28
20
25
1.99
89509529--89510061
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11.4
47
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8
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33
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28
29
1.87
89509528--89510061
185
2.8
188
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7
825
33
8
28
29
1.87
89509531--89510061
138
3.8
141
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8
737
33
8
28
29
1.87
89512053--89512398
39
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40
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7
444
24
21
28
25
1.99
89512064--89512385
79
4.1
79
90
5
462
24
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14.5
47
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3
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8
29
29
1.86
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25
3.3
25
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10
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32
5
29
32
1.79
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326
1.9
327
97
0
1197
32
7
28
30
1.86
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17
2.1
17
94
0
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41
19
0
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1.52
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7
14.7
7
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28
0
28
1.62
89529780--89529817
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2.1
18
90
0
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5
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1.48
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2.3
18
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4
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7
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1.54
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2.7
48
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1.93
89533330--89533458
48
2.7
47
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7
154
35
27
14
22
1.93
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21
2.0
22
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4
61
39
2
6
51
1.42
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2.7
46
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2
209
30
26
21
21
1.98
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2.0
30
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25
5
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1.77
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2.5
28
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12
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1.93
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3.9
43
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10
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1.97
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2
206
34
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23
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1.96
89552696--89552813
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27
1.98
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6
179
27
15
26
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1.96
89552842--89553053
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4.6
46
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9
213
28
15
26
29
1.96
89557462--89557554
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2.3
40
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7
118
25
15
27
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17
2.4
17
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0
55
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7
1.77
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2.0
44
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24
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1.93
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30
2.0
30
87
0
86
32
22
9
34
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89593326--89593393
26
2.6
26
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84
22
17
20
39
1.92
89594612--89594687
36
2.1
36
97
0
143
19
27
27
25
1.99
89607722--89607851
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2.8
47
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33
26
16
24
1.96
89610518--89610647
40
3.3
40
86
6
149
27
28
20
23
1.99
89610546--89610700
79
2.0
79
84
7
208
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28
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24
1.99
89610546--89610702
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4.0
40
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12
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26
28
21
24
1.99
89618574--89618758
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2.3
80
80
8
216
25
28
22
24
1.99
89618574--89618758
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25
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1.99
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2.0
45
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0
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2.0
24
100
0
98
8
42
28
20
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345