Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  316  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106591602--106591664
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2.2
28
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0
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2.2
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0
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2.3
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0
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1
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91
0
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20
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28
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18
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23
18
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5
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
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1.9
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9
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1.35
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2.0
26
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1.9
100
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4.6
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5
5
59
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1.31
106718881--106719003
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4
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1.34
106718831--106719009
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5
4
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1.40
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1.9
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21
1.98
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45
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203
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21
20
1.98
106723059--106723147
30
3.0
30
80
8
101
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15
11
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106723059--106723138
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5.2
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9
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56
15
15
12
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3.8
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79
14
198
28
29
21
21
1.98
106726049--106726219
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1.8
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297
27
29
21
21
1.99
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1.97
106733916--106734406
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12
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18
22
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1.97
106733957--106734406
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106733957--106734490
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1.98
106736011--106736052
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34
0
25
40
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.75
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2.7
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22
30
1.77
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1.9
175
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1.92
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45
75
6
129
30
14
21
32
1.94
106771902--106772361
44
10.1
44
76
9
404
30
18
22
28
1.97
106771902--106772392
95
5.3
93
76
12
397
30
18
22
28
1.97
106771943--106772392
139
3.2
139
87
2
652
30
19
22
28
1.98
106771943--106772476
139
3.8
139
81
5
411
30
19
22
27
1.98
106773998--106774039
19
2.2
20
86
4
59
30
2
2
64
1.19
106774053--106774172
26
4.7
26
76
4
91
29
5
6
59
1.44
106774115--106774207
48
1.9
48
80
4
107
27
4
4
63
1.32
106774052--106774227
75
2.3
76
80
9
175
30
5
5
59
1.41
106774141--106774220
25
3.3
24
74
17
67
30
5
2
62
1.29
106774170--106774220
25
2.0
25
85
7
68
35
5
0
58
1.22
106774122--106774227
26
4.2
24
71
17
65
30
3
3
62
1.30
106774490--106774547
15
3.8
16
73
15
59
27
5
0
67
1.12
106780797--106780882
41
2.1
40
82
2
100
65
10
3
20
1.38
106780869--106780933
28
2.3
27
76
7
67
63
0
7
29
1.22
106782592--106782641
7
6.9
7
88
8
73
30
0
2
68
1.01
106782592--106782641
23
2.3
23
89
6
77
30
0
2
68
1.01
106782599--106782641
16
2.9
15
93
6
70
30
0
0
69
0.88
106784066--106784113
25
1.9
25
87
8
71
56
2
8
33
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106785182--106785269
44
2.0
44
97
0
167
36
23
12
27
1.91
106785707--106785736
8
3.9
8
95
4
53
36
0
10
53
1.35
106789516--106789676
44
3.7
44
76
6
130
27
24
20
27
1.99
106789747--106789959
44
4.8
44
81
2
167
31
20
16
30
1.95
106789806--106790419
44
13.5
44
72
11
220
30
21
19
28
1.98
106789478--106790188
278
2.6
278
85
1
953
29
21
18
29
1.97
106790025--106790422
44
8.8
45
71
13
221
29
23
19
27
1.98
106789884--106790473
227
2.6
227
86
3
781
29
22
19
28
1.98
106791000--106791143
72
2.0
72
100
0
288
16
20
22
40
1.91
106794284--106794326
15
2.9
14
80
13
50
20
4
2
72
1.14
106806390--106806421
15
2.1
15
100
0
64
25
6
9
59
1.52
106806327--106806576
86
2.8
87
76
9
256
31
14
16
36
1.90
106806479--106806516
14
2.7
14
88
11
60
28
13
0
57
1.36
106806386--106806552
91
1.9
87
83
13
214
31
12
14
41
1.84
106806589--106806856
90
2.7
102
81
8
301
28
17
18
35
1.94
106806685--106806997
90
3.5
90
85
3
418
28
15
19
36
1.92
106806835--106806869
14
2.5
14
90
0
52
17
20
5
57
1.60
106806685--106807023
91
3.8
89
85
5
407
28
15
19
36
1.93
106807372--106807478
44
2.4
44
76
6
119
35
15
19
28
1.93
106807930--106807973
23
1.9
23
81
9
54
61
9
22
6
1.50
106808910--106808952
15
2.9
14
80
13
50
20
4
2
72
1.14
106814694--106814767
27
2.9
27
72
10
73
54
2
10
32
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106819902--106819926
7
3.6
7
100
0
50
12
0
0
88
0.53
106828092--106828645
274
2.0
274
98
0
1072
35
19
11
33
1.88
106843221--106843362
27
5.2
27
83
7
171
35
24
21
17
1.95
106843221--106843362
54
2.6
54
92
1
239
35
24
21
17
1.95
106843468--106843541
26
2.8
26
83
4
76
29
10
22
36
1.89
106844324--106844370
24
2.0
24
86
0
67
38
2
36
23
1.67
106845783--106845894
27
4.2
26
80
7
125
16
23
22
37
1.94
106845783--106845894
54
2.1
54
86
3
154
16
23
22
37
1.94
106851628--106851767
70
2.0
70
100
0
280
37
10
22
30
1.87
106851801--106851871
24
3.0
24
95
0
124
35
1
38
25
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345