Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  115  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38107633--38107669
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0
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4.0
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21
1.96
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2.2
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2.0
30
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190
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2.1
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1.05
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16
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2
76
1.05
38157060--38157110
22
2.2
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10
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1
3
80
0.94
38157066--38157121
22
2.5
22
86
11
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12
3
5
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1.05
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2.1
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131
1.9
131
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375
33
17
18
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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28
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1.97
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1.9
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1.97
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1.8
93
91
0
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28
29
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1.98
38214027--38214202
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28
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22
1.98
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2.1
13
100
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1.98
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2.5
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1.99
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2.3
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20
29
1.98
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3.6
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180
23
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19
29
1.98
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5.5
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170
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24
1.98
38236826--38237040
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2.3
94
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253
27
19
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23
1.98
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2.0
65
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2.1
26
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67
26
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2.1
21
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100
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2.5
11
100
0
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22
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2.1
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4
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2.0
17
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0
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44
5
0
50
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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5
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2.3
18
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12
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47
5
0
47
1.24
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15
8.9
15
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2
3
51
1.35
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120
1.8
119
88
6
336
39
4
5
50
1.46
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14
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45
0
2
52
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156
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0
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35
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4.2
10
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17
50
29
2
0
68
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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6
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16
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15
20
18
1.84
38281179--38281280
27
3.8
26
87
5
123
36
21
24
17
1.95
38281439--38281503
22
3.0
22
80
8
78
33
23
23
20
1.97
38281931--38282169
27
9.0
27
86
4
315
25
22
19
33
1.97
38281931--38282170
53
4.5
54
86
4
335
25
22
19
33
1.97
38281930--38282170
80
3.0
79
87
3
340
24
21
19
33
1.97
38282158--38282311
54
2.9
54
80
4
143
30
9
20
40
1.83
38282190--38282339
54
2.8
54
83
2
185
29
8
20
42
1.80
38282189--38282339
81
1.9
81
86
5
216
29
7
20
42
1.80
38282189--38282339
27
5.6
26
81
7
151
29
7
20
42
1.80
38282189--38282356
27
6.2
27
77
8
128
29
7
20
42
1.80
38282189--38282366
81
2.2
81
83
6
209
29
7
19
42
1.79
38282189--38282356
54
3.1
53
76
10
144
29
7
20
42
1.80
38282368--38282501
27
5.0
27
89
0
196
42
8
20
28
1.82
38282516--38282600
27
3.2
26
79
12
91
30
8
21
40
1.82
38288704--38288742
10
4.0
10
96
3
71
28
0
0
71
0.86
38295823--38296033
38
5.5
38
85
8
225
21
22
25
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38295827--38296034
76
2.7
76
87
3
265
22
21
25
31
1.98
38301446--38301491
15
3.1
15
84
6
58
32
0
4
63
1.14
38301587--38301662
24
3.2
24
70
17
68
36
1
7
53
1.38
38301588--38301685
47
2.1
48
96
1
180
37
2
10
50
1.48
38304537--38304597
30
2.0
30
96
0
113
26
16
8
49
1.73
38310594--38310851
40
6.5
40
91
2
369
22
23
29
24
1.99
38312285--38312319
14
2.8
12
91
8
52
77
11
8
2
1.10
38315211--38316291
48
22.9
48
91
2
1726
33
6
28
30
1.83
38315211--38316291
94
11.4
95
94
1
1707
33
6
28
30
1.83
38315204--38316291
236
4.6
236
97
0
1973
33
6
28
30
1.83
38316432--38316534
37
2.8
37
95
0
179
23
19
32
25
1.98
38321524--38321555
12
2.7
12
100
0
64
43
9
15
31
1.78
38325850--38325968
44
2.6
44
85
4
148
27
26
15
30
1.96
38338200--38338231
16
1.9
16
93
6
55
81
0
0
18
0.70
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22
2.0
22
100
0
90
68
4
8
17
1.32
38347219--38347251
17
2.0
16
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5
57
36
0
27
36
1.57
38347634--38347788
84
1.8
84
88
0
238
30
18
18
32
1.95
38347912--38348105
29
6.8
28
72
13
121
57
5
11
25
1.55
38347948--38348105
29
5.5
29
74
11
130
57
5
10
26
1.53
38347974--38348028
27
2.0
28
89
7
85
52
5
14
27
1.63
38349952--38350060
49
2.2
49
82
6
123
22
30
20
27
1.98
38350086--38350208
46
2.6
46
84
7
142
23
30
17
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38351805--38351952
27
5.4
27
85
1
152
30
28
14
27
1.95
38357060--38357092
6
5.5
6
96
0
57
0
66
0
33
0.92
38358585--38358643
29
2.0
30
90
6
95
47
0
1
50
1.11
38358700--38358771
33
2.2
32
88
11
103
40
0
6
52
1.28
38358824--38358868
23
2.0
22
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4
54
33
4
11
51
1.58
38359017--38359058
20
2.0
20
82
13
50
47
0
4
47
1.23
38359078--38359120
21
2.0
21
90
0
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4
9
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2.3
25
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3
1
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1.27
38368001--38368028
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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