Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  279  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.99
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40
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293
25
28
23
22
1.99
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15
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16
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1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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19
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0
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17
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.98
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1.98
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0
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56
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95417874--95417937
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18
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7
0
39
1.29
95436364--95436452
38
2.2
40
90
5
137
52
6
1
39
1.35
95436536--95436575
20
1.9
21
90
10
64
50
0
0
50
1.00
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29
2.0
29
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10
78
48
1
0
50
1.11
95438747--95438836
44
2.0
44
100
0
180
43
26
5
24
1.76
95440515--95440552
14
2.7
14
91
0
58
52
0
2
44
1.14
95445176--95445242
33
2.0
33
94
0
116
20
20
32
25
1.97
95448270--95448386
62
1.9
59
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5
162
41
4
4
50
1.41
95454574--95454606
10
3.3
10
100
0
66
42
9
12
36
1.74
95455360--95455441
42
2.0
42
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4
112
24
24
31
19
1.98
95458611--95458828
33
6.7
32
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5
168
31
21
11
36
1.88
95458650--95458821
65
2.6
65
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3
211
31
22
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36
1.87
95458611--95458823
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98
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31
21
10
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1.88
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2.0
13
100
0
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7
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95463701--95463741
19
2.2
19
90
0
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0
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1.35
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0
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17
22
30
28
1.97
95487028--95487118
44
2.1
43
85
2
119
43
25
16
14
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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3
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25
22
27
2.00
95492133--95492178
19
2.3
19
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7
56
56
6
13
23
1.60
95492848--95492962
58
2.0
59
89
5
180
20
4
2
73
1.13
95492889--95492950
25
2.5
24
80
15
63
16
4
3
75
1.10
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15
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30
0
1
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1.00
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0
1
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0
1
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0.96
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30
2.3
30
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90
30
0
1
68
0.98
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1.63
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2.0
39
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0
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20
25
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1.95
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2.1
57
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0
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2.5
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28
1.97
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0
102
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15
1.68
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2.8
21
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0
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127
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1.55
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157
37
2
13
46
1.56
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2.5
72
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7
285
37
2
12
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1.54
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2.0
56
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163
37
2
11
48
1.54
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2.8
100
90
3
437
54
3
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35
1.44
95510409--95510445
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2.2
17
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56
10
0
32
1.34
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21
3.0
21
81
6
74
50
26
1
21
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95511910--95511976
28
2.4
28
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5
73
55
23
0
20
1.44
95512656--95512690
17
2.0
17
88
5
52
65
14
0
20
1.26
95512767--95512884
41
2.9
40
82
2
110
25
20
22
32
1.98
95512818--95513315
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12.1
41
78
0
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20
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2.0
75
94
0
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1.98
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2.0
21
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25
20
1.90
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47
2.8
43
79
11
139
28
19
28
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345