Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  12  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3873177--3873223
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0
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0
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2
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2.2
28
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1.21
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0
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0
0
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0
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195
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2.0
72
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2.2
91
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10
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3.4
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4
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1.28
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30
3.5
29
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13
88
63
3
4
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1.32
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20
2.2
20
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2.1
27
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41
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369
31
23
24
20
1.98
3909819--3910075
80
3.2
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3
358
31
23
24
20
1.98
3909851--3910075
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1.9
120
92
0
378
29
23
25
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3911289--3911428
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1.9
73
79
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17
20
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1.92
3912908--3912950
22
2.0
22
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0
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2.0
22
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2.7
43
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20
20
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11
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1.99
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18
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2
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17
2.1
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0
0
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0
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0
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2.9
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18
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63
0
0
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18
2.5
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61
53
0
0
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1.00
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2.2
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21
2.3
23
80
9
63
62
7
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1.44
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15
2.5
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80
19
50
37
0
17
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1.49
3945448--3945501
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2.2
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6
65
12
24
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2.0
29
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0
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29
2.0
29
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0
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20
17
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1.95
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33
2.1
33
100
0
136
27
27
11
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
31
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5
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2.4
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65
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1
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1.22
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2.8
14
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0
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12
100
0
50
16
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0
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0
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0
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20
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17
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2.1
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0
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0
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11
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10
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7
100
0
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13
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1.82
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3
202
26
26
17
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4021601--4021729
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2.0
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0
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19
31
1.79
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39
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7
102
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1
2
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0
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2.1
22
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0
56
41
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6
43
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16
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50
26
2
19
52
1.58
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30
2.4
28
75
13
70
30
7
28
33
1.84
4049498--4049539
19
2.2
20
87
8
61
26
19
9
45
1.80
4051815--4051858
20
2.2
20
88
8
63
68
15
11
4
1.36
4062789--4062817
15
1.9
15
100
0
58
37
0
0
62
0.96
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25
2.1
22
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10
55
50
4
4
42
1.40
4063848--4063950
35
2.9
35
92
0
179
14
22
33
29
1.94
4071349--4071387
11
3.7
11
83
13
55
87
7
5
0
0.68
4071346--4071387
22
1.9
22
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0
66
85
9
4
0
0.72
4071349--4071462
9
11.9
9
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3
11
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1.04
4072189--4072292
35
3.0
35
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172
14
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1.93
4076497--4076529
5
6.4
5
93
6
57
78
0
0
21
0.75
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26
1.9
25
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8
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54
8
20
16
1.68
4087923--4087953
16
1.9
16
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0
53
54
3
0
41
1.16
4089351--4089499
81
1.8
81
94
2
264
40
10
8
40
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
3.2
11
91
4
52
79
0
0
20
0.73
4100472--4100508
5
7.6
5
82
17
51
81
0
0
18
0.70
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18
2.1
18
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5
65
58
11
0
30
1.33
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28
2.0
29
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3
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39
7
0
53
1.28
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19
3.7
20
75
19
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34
0
4
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1.16
4106474--4106534
21
3.2
19
78
15
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32
0
3
63
1.10
4107214--4107273
30
2.0
30
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0
102
28
30
3
38
1.73
4109468--4109524
25
2.3
23
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18
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42
0
5
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1.24
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22
2.2
22
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7
73
22
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18
22
1.95
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126
4.1
126
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4
613
30
16
16
36
1.91
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34
3.3
32
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13
125
45
13
0
41
1.44
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42
2.0
42
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4
121
47
23
0
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1.52
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17
2.2
19
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13
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25
7
0
67
1.16
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362
4.6
360
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8
1603
38
16
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13
1.9
13
100
0
50
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1.79
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30
1.9
30
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13
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3
0
49
1.18
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39
2.1
39
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4
119
37
15
7
40
1.75
4124286--4124357
13
5.7
13
71
12
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40
15
8
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1.77
4126264--4126288
13
1.9
13
100
0
50
0
36
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48
1.46
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21
2.3
22
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13
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42
4
0
53
1.20
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6
5.5
6
86
6
50
35
2
0
61
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4133945--4134022
33
2.3
35
82
6
106
34
3
1
60
1.23
4133973--4134013
15
2.7
15
82
17
50
29
4
2
63
1.28
4133942--4134013
14
4.7
15
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23
53
31
4
1
62
1.23
4137274--4137321
21
2.2
21
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3
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33
4
4
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1.36
4138547--4138580
4
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4
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0
50
70
2
2
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0
0
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15
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0
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0
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2.0
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4
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50
6
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1.58
4138907--4138970
28
2.3
27
78
2
65
54
7
7
29
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345