Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  306  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103583019--103583169
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3.6
42
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1
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34
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103584586--103584659
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3.1
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103584614--103584666
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1.86
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4.7
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20
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20
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103595398--103595458
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2.0
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176
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28
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1.9
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250
27
29
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0
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2.0
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52
22
0
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45
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60
25
0
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47
1.52
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8
72
19
2
47
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1.61
103623375--103623517
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6.4
22
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16
71
19
2
47
30
1.61
103623391--103623501
15
7.5
15
70
13
86
18
1
49
30
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
50
30
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103623378--103623498
7
16.4
7
70
13
82
19
1
47
31
1.59
103623618--103623662
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2.7
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4
2
53
1.33
103627735--103627772
9
4.3
9
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51
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15
0
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103627735--103627805
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72
47
15
0
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1.46
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7.8
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24
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25
27
2.00
103628769--103628967
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2.6
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0
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27
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1
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34
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1.9
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2.0
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1.9
16
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32
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18
23
1.97
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18
2.0
17
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2
5
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171
32
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1.96
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67
2.8
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17
29
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103670316--103670543
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5.0
46
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1
323
21
23
14
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103672650--103672695
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0
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60
72
0
0
27
0.85
103672656--103672695
11
3.7
11
87
12
57
72
0
0
27
0.85
103680491--103680517
13
2.1
13
100
0
54
22
0
14
62
1.31
103681917--103682033
54
2.2
54
85
3
164
29
29
14
27
1.95
103681917--103682033
27
4.3
27
68
12
78
29
29
14
27
1.95
103682108--103682162
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2.4
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30
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21
21
17
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103684132--103684212
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20
19
35
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3.0
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21
18
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1.94
103684084--103684212
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1.9
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2.1
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0
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0
57
9
14
2
73
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103706996--103707047
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50
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0
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1.20
103712165--103712440
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2.0
137
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27
13
19
38
1.90
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2.6
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21
17
38
1.93
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5.0
22
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7
93
23
20
17
38
1.93
103721523--103721580
28
2.1
28
93
0
98
39
13
24
22
1.90
103732088--103732164
38
2.0
38
97
0
145
29
12
20
36
1.90
103735877--103735936
29
2.0
30
80
3
68
23
31
18
26
1.97
103736530--103736559
14
2.1
14
93
0
51
70
3
16
10
1.29
103736526--103736567
14
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2
21
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103737359--103737426
19
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18
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7
75
23
2
4
69
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103737377--103737440
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29
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29
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103737533--103737569
18
2.1
18
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0
74
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0
16
21
1.33
103737793--103737847
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2.0
28
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0
0
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35
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1.75
103742326--103742382
30
1.9
30
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14
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1.56
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28
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28
1.99
103756038--103756213
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28
1.98
103756034--103756206
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1.9
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0
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25
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0
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17
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1.78
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108
2.1
108
85
0
314
32
17
10
40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
136
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0
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11
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36
2.4
36
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43
1.73
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10.8
5
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14
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3
0
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2.0
167
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2.0
83
84
0
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34
1.92
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45
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9
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28
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28
23
1.98
103793031--103793487
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4.9
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11
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28
22
1.98
103793131--103793433
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3.3
91
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331
28
18
29
23
1.98
103793034--103793483
187
2.4
187
90
0
688
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19
28
23
1.98
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2.1
19
100
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1.93
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2.0
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27
1.96
103815224--103815603
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4.3
88
88
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30
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27
1.96
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2.0
59
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1.20
103817264--103817383
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18
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20
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32
2
1
63
1.18
103817317--103817380
20
3.0
23
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1.20
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5
175
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2
10
25
1.41
103818836--103818893
27
2.2
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1
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2
10
25
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103818849--103818905
28
2.0
29
83
16
75
64
1
14
19
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103819176--103819214
12
3.2
12
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0
60
56
0
23
20
1.42
103820898--103820943
17
2.7
17
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10
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1.30
103820898--103820940
16
2.6
16
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11
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72
1.29
103821717--103821878
26
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22
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1
2
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1
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26
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254
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5
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103821711--103821878
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2
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0
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103821815--103822020
82
2.6
79
77
8
204
29
5
5
59
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345