Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A06 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  223  of  345  ( 41358 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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1.99
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1.8
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270
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1.99
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0
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2.0
22
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26
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272
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1.99
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2.2
119
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274
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2.3
29
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0
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2.0
84
82
7
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33
24
17
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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1.85
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2.6
211
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259
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1.99
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2.0
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28
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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27
1.84
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2.0
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245
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14
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1
48
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75536026--75536177
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5.6
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13
26
1.94
75536026--75536177
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30
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13
26
1.94
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24
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63
4
2
30
1.26
75558874--75558916
18
2.4
18
80
0
50
44
11
2
41
1.53
75572309--75572404
45
2.1
45
94
0
165
32
5
19
42
1.74
75572938--75572999
23
2.7
23
87
0
88
29
16
17
37
1.92
75574234--75574263
15
2.0
15
100
0
60
46
0
20
33
1.51
75576162--75576279
47
2.5
46
81
10
132
30
18
25
25
1.98
75576156--75576368
46
4.6
47
77
11
147
28
18
27
25
1.98
75576200--75576419
47
4.7
48
77
11
199
29
17
28
24
1.97
75576160--75576415
140
1.8
139
84
6
347
28
17
28
25
1.98
75577622--75577843
67
3.4
65
75
9
209
23
28
15
32
1.95
75582625--75583271
47
13.6
47
92
3
917
28
29
9
32
1.88
75584735--75584852
57
2.1
57
96
1
220
22
23
8
44
1.80
75595163--75595232
30
2.3
30
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0
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24
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15
44
1.86
75601507--75601544
18
2.2
18
90
4
60
44
2
15
36
1.61
75605772--75605797
9
2.9
9
100
0
52
23
42
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23
1.86
75609971--75610102
39
3.4
39
91
2
203
30
19
25
25
1.98
75610095--75610309
39
5.5
39
92
1
342
19
22
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75609978--75610307
78
4.2
78
84
6
305
23
21
27
27
1.99
75610046--75610307
117
2.2
117
85
5
368
22
21
28
27
1.99
75610095--75610309
117
1.8
117
93
3
378
19
22
28
28
1.98
75615701--75615926
46
4.8
46
74
7
213
25
19
24
30
1.98
75632636--75632711
6
13.3
6
89
8
115
15
1
0
82
0.73
75635624--75635656
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
75638978--75639047
27
2.6
27
95
2
113
31
28
12
27
1.93
75638978--75639075
28
3.5
28
90
2
135
31
28
13
26
1.94
75647345--75647837
138
3.6
137
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3
569
31
18
27
22
1.97
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46
10.7
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66
14
160
31
18
27
22
1.97
75647940--75647988
25
2.0
25
84
7
66
51
8
14
26
1.70
75658524--75658882
47
7.6
47
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2
531
33
8
28
29
1.86
75663771--75664058
156
1.8
156
94
0
513
28
16
20
34
1.94
75665349--75665521
46
3.7
46
79
10
208
22
19
27
30
1.98
75665346--75665514
93
1.8
93
94
0
302
22
18
28
30
1.98
75665746--75665783
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
75672916--75673086
45
3.8
45
80
14
206
21
21
28
29
1.98
75672913--75673081
92
1.8
92
93
2
295
21
21
28
28
1.98
75673309--75673346
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
75691344--75691521
27
6.6
27
79
3
115
28
28
16
26
1.97
75691344--75691521
54
3.3
55
80
10
204
28
28
16
26
1.97
75691365--75691520
82
1.9
81
85
3
215
28
28
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75699241--75699418
27
6.6
27
79
3
115
28
28
16
26
1.97
75699241--75699418
54
3.3
55
80
10
204
28
28
16
26
1.97
75699262--75699417
82
1.9
81
85
3
215
28
28
16
26
1.97
75704534--75704752
94
2.3
95
79
6
241
26
21
29
22
1.99
75712097--75712457
47
7.7
46
70
13
193
26
19
30
23
1.98
75712194--75712452
94
2.8
91
78
12
276
27
19
30
23
1.98
75719114--75719182
34
2.0
34
100
0
138
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48
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0
39
1.40
75733352--75733436
6
14.3
6
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11
68
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1
7
15
1.06
75733364--75733438
25
2.8
26
86
11
100
76
1
6
16
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345