Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  103  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34057066--34057236
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0
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3.0
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119
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.0
17
88
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0
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19
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0
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2.4
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1
26
1.28
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2.6
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25
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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2.8
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0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
33
94
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116
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21
40
1.68
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34251151--34251184
15
2.3
15
90
5
52
23
0
32
44
1.54
34251171--34251216
21
2.1
22
84
11
60
21
0
45
32
1.52
34251182--34251233
14
3.7
14
80
10
54
19
1
46
32
1.61
34251252--34251293
15
2.9
15
75
17
52
30
0
33
35
1.58
34251481--34251574
29
3.2
30
73
11
88
26
1
30
41
1.63
34256165--34256230
23
2.9
23
95
0
114
33
4
21
40
1.73
34256165--34256437
46
6.1
45
69
19
137
31
5
22
39
1.78
34256295--34256437
23
6.1
23
75
8
119
32
6
22
38
1.81
34256330--34256448
47
2.6
46
84
6
134
31
5
23
38
1.79
34256867--34256913
19
2.5
19
76
10
51
21
2
4
72
1.12
34256834--34256923
31
2.9
30
77
19
96
26
4
2
66
1.22
34257051--34257079
11
2.7
11
94
5
51
48
0
10
41
1.37
34271583--34271613
7
4.4
7
100
0
62
45
12
0
41
1.42
34271784--34271829
13
3.1
15
79
20
53
43
0
0
56
0.99
34271784--34271837
19
2.9
19
78
19
53
44
1
0
53
1.11
34271910--34271968
29
2.2
29
82
11
72
38
3
0
57
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34272667--34272708
15
2.8
15
92
0
66
30
16
4
47
1.67
34273259--34273334
11
7.3
11
70
20
56
60
1
1
36
1.13
34273252--34273362
20
5.6
20
71
18
79
57
1
3
36
1.27
34273252--34273312
29
2.1
29
84
6
79
62
1
0
36
1.05
34273252--34273422
9
17.4
9
67
20
67
58
2
4
35
1.30
34273370--34273428
20
3.0
20
71
16
52
57
3
3
35
1.32
34273551--34273621
16
4.4
16
85
0
70
36
5
25
32
1.79
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26
2.0
26
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42
4
4
50
1.40
34273793--34273922
61
2.2
58
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6
154
52
3
0
43
1.25
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25
2.0
27
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31
17
7
43
1.78
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73
2.0
73
88
5
218
55
13
13
17
1.70
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43
2.0
43
82
4
104
34
26
16
22
1.95
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26
2.0
25
85
11
68
44
2
2
52
1.24
34281779--34281882
40
2.6
39
89
6
147
27
22
21
28
1.99
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47
6.8
45
77
12
272
26
19
30
24
1.98
34296515--34296833
141
2.2
140
83
7
385
26
19
30
24
1.98
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48
5.8
48
81
6
315
26
26
17
30
1.97
34307367--34307644
91
2.9
93
84
6
310
25
26
17
29
1.98
34312392--34312566
90
1.9
93
82
9
225
25
29
17
28
1.98
34315021--34315101
42
1.9
42
84
2
108
30
18
27
23
1.98
34314967--34315159
43
4.5
42
73
6
138
29
18
24
27
1.98
34319578--34319616
14
2.9
13
85
7
60
35
0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34319810--34319876
34
1.9
35
87
3
100
31
7
16
44
1.75
34323288--34323321
18
1.9
18
88
5
52
52
0
23
23
1.47
34333056--34333252
54
3.6
54
84
5
281
30
18
22
28
1.97
34334371--34334409
19
2.0
19
85
14
53
71
2
0
25
0.98
34334588--34334705
12
9.5
12
70
23
84
63
1
3
31
1.21
34334587--34334683
27
3.6
27
79
9
101
61
2
3
32
1.23
34334631--34334719
33
2.8
31
77
16
76
61
2
4
31
1.28
34334676--34334732
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17
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20
52
63
3
3
29
1.28
34336523--34337475
119
8.0
119
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2
1493
31
19
16
32
1.94
34343938--34344074
50
2.8
50
85
6
176
37
13
21
26
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345