Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  59  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18046760--18046822
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Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
A
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G
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27
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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6.1
49
91
4
452
31
9
30
28
1.88
18325056--18325347
96
3.0
96
91
3
462
31
9
30
28
1.88
18325059--18325345
145
2.0
143
91
1
466
31
9
30
28
1.88
18327337--18327450
41
2.9
40
75
9
126
28
17
21
32
1.96
18327340--18327464
40
3.2
40
73
12
132
29
17
21
31
1.96
18327340--18327479
40
3.5
40
74
10
126
29
17
22
30
1.97
18339803--18339837
18
1.9
18
88
11
54
37
2
0
60
1.12
18341148--18341182
17
2.1
17
89
10
54
28
17
14
40
1.88
18348940--18349003
28
2.2
29
81
8
69
43
4
7
43
1.54
18352567--18352633
3
22.3
3
92
0
107
34
2
1
61
1.20
18353162--18353236
20
3.8
20
71
16
66
50
0
10
38
1.37
18355555--18355776
118
1.9
119
84
6
299
25
27
22
24
2.00
18355553--18355776
40
5.7
40
85
7
287
25
27
22
24
2.00
18363445--18363616
40
4.3
39
84
5
202
27
27
19
25
1.98
18363445--18363669
80
2.8
80
80
7
244
27
27
20
25
1.99
18366289--18366348
10
6.0
10
84
11
79
68
1
8
21
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18366967--18367006
21
1.9
21
84
0
53
15
2
0
82
0.77
18366998--18367184
96
1.9
97
92
1
313
29
26
15
27
1.96
18367925--18367965
13
2.9
15
75
17
52
75
0
2
21
0.92
18371896--18371937
21
2.0
21
81
9
50
14
19
19
47
1.82
18374308--18374366
10
6.0
10
82
11
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71
1
6
20
1.18
18375475--18375524
20
2.3
20
80
10
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26
6
12
56
1.58
18380444--18380647
27
7.6
27
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4
241
30
27
14
27
1.95
18384092--18384205
7
15.9
7
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5
104
45
33
0
21
1.52
18384093--18384133
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5.2
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16
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51
26
0
21
1.48
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11
100
0
52
38
0
0
61
0.96
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2.7
50
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2
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29
20
28
21
1.98
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39
3.3
39
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0
195
29
22
24
23
1.99
18414117--18414166
13
3.8
13
89
0
82
8
30
44
18
1.78
18416379--18416602
40
5.6
40
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6
262
25
26
21
26
2.00
18424297--18424520
40
5.7
40
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5
271
25
26
22
25
2.00
18424297--18424520
79
2.8
78
81
11
260
25
26
22
25
2.00
18428189--18428247
21
2.6
23
81
10
59
22
6
1
69
1.21
18431187--18431225
18
2.3
17
86
8
53
0
28
2
69
1.02
18436697--18436754
14
4.1
14
82
13
66
31
12
1
55
1.47
18436758--18436789
13
2.4
14
85
15
50
34
0
0
65
0.93
18436799--18436878
36
2.2
35
76
10
81
36
8
2
52
1.46
18448743--18449344
206
2.9
206
92
0
954
31
17
21
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18451273--18451307
16
2.1
17
94
5
63
25
11
0
62
1.28
18451336--18451367
13
2.4
14
85
15
50
34
0
0
65
0.93
18456152--18456191
20
2.0
20
85
9
55
47
10
5
37
1.59
18458049--18458088
21
2.0
20
85
14
55
30
22
12
35
1.91
18461876--18462037
41
4.0
41
80
6
177
23
22
28
25
1.99
18462564--18462589
13
2.0
13
100
0
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15
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18464374--18464524
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42
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10
175
29
25
19
25
1.98
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13
100
0
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20
0
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1.50
18472520--18472630
41
2.6
43
81
8
120
30
22
17
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345