Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  19  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5613025--5613055
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1.9
16
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0
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1.00
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0
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0
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87
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1.98
5639722--5640570
439
1.9
439
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1278
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24
19
26
1.98
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10
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19
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1.98
5640569--5640957
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2.9
134
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19
22
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1.98
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2.7
44
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0
0
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3.2
20
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20
3
1
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1.02
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3.0
11
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0
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0
0
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5642704--5642741
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15
0
0
84
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1.85
5648301--5648845
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3.8
145
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2
926
32
7
31
28
1.85
5648661--5648735
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3.3
22
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10
32
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5650698--5651010
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7.9
40
93
1
513
21
21
30
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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13
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47
5.5
47
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1
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7
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1.85
5655057--5655625
140
3.9
139
77
18
572
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7
30
28
1.85
5655298--5655339
18
2.3
18
100
0
84
33
0
28
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1.58
5655251--5655388
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2.1
65
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2
249
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5
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1.81
5655316--5655607
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411
33
7
30
28
1.84
5655356--5655438
27
3.3
27
63
27
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32
4
30
32
1.79
5655204--5655437
116
2.1
112
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30
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5662534--5662618
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2.0
43
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20
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1.85
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4.8
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250
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18
21
22
1.94
5662799--5662993
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2.4
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2
295
37
18
21
22
1.94
5663390--5663459
22
3.2
22
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23
58
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4
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22
2.9
22
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27
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0
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0.59
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114
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271
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16
21
35
1.95
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16
2.6
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88
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2
38
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5664908--5664936
2
14.5
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100
0
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0
1.00
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4.0
24
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20
6
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1.77
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15
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41
1
0
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9
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9
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10
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1.53
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2.5
26
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2
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50
15
1
32
1.53
5672403--5672442
15
2.6
15
88
4
53
30
0
2
67
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8.3
6
83
11
55
32
0
2
65
1.05
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1.9
20
84
5
51
28
2
0
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1.02
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18
2.1
18
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13
36
11
38
1.81
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85
2.6
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78
5
230
25
27
17
29
1.97
5681996--5682222
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5.3
43
82
3
235
25
27
18
29
1.98
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19
7.9
19
83
5
126
25
33
28
13
1.93
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3.0
37
82
3
131
21
32
30
15
1.94
5684659--5684756
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1.99
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18
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0
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2.1
15
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29
0
6
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19
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13
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27
7.9
27
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0
275
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19
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1.91
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2.6
27
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3
5
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1.37
5697177--5697436
26
10.2
25
70
16
176
61
3
5
30
1.35
5697279--5697514
25
9.3
26
68
13
129
58
4
6
30
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5700661--5700717
25
2.3
25
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6
71
21
28
21
29
1.98
5702366--5702408
21
2.0
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0
27
41
1.56
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2.1
51
92
1
178
30
26
8
34
1.86
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6
96
0
59
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0
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5.0
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2
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21
15
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20
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0
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1
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10
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3
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5
0
31
1.18
5749486--5749654
10
16.6
10
67
15
53
57
2
2
37
1.27
5749488--5749654
19
8.3
19
66
17
63
57
2
2
37
1.27
5750227--5750314
31
2.8
31
79
5
88
35
1
3
60
1.21
5750287--5750326
19
2.1
19
90
9
64
40
0
2
57
1.12
5755485--5755549
30
2.1
31
88
2
96
43
9
12
35
1.74
5758583--5758698
16
6.8
16
70
20
74
62
2
3
31
1.26
5758583--5758686
51
2.1
48
80
8
111
62
2
2
31
1.24
5758788--5758971
14
12.6
14
67
21
69
62
3
2
32
1.23
5758767--5758941
22
8.0
21
67
22
71
60
2
3
33
1.26
5758763--5758973
9
23.8
9
64
22
56
61
2
2
32
1.25
5758787--5758912
24
5.0
26
75
16
90
61
2
3
33
1.25
5758902--5758971
22
3.2
23
75
20
69
65
4
0
30
1.11
5758821--5758978
66
2.4
65
74
15
144
63
3
2
31
1.23
5766901--5766976
40
1.9
40
86
5
109
21
14
30
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5766998--5767064
28
2.4
30
80
14
88
28
10
28
32
1.90
5767618--5767645
14
2.0
14
100
0
56
50
7
7
35
1.57
5769559--5769793
96
2.4
96
90
1
355
28
18
28
25
1.98
5769570--5769844
48
5.7
47
78
9
245
28
18
27
25
1.98
5769567--5769844
96
2.9
95
86
4
310
28
18
27
25
1.98
5773664--5773704
20
2.0
20
86
9
57
78
2
4
14
1.03
5784319--5784394
40
1.9
40
89
5
118
19
14
31
34
1.92
5784419--5784487
28
2.5
28
80
0
93
28
11
27
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1.92
5787602--5787848
101
2.5
99
84
3
304
32
19
22
25
1.97
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14
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2
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22
1
27
48
1.61
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2.9
42
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113
26
1
20
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1.57
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18
1.9
18
88
5
52
50
2
2
44
1.32
5789517--5789569
25
2.1
25
100
0
106
7
39
28
24
1.82
5792880--5793047
40
4.1
40
81
4
133
25
13
27
33
1.94
5797547--5797597
25
2.0
25
100
0
102
49
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7
23
1.74
5797838--5798014
46
3.8
46
82
8
200
30
26
21
21
1.98
5797838--5798014
47
3.8
47
82
6
209
30
26
21
21
1.98
5808989--5809039
25
2.0
26
85
11
70
66
0
0
33
0.92
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12
2.2
12
100
0
52
15
42
15
26
1.87
5817773--5817847
16
4.6
16
73
5
69
22
5
36
36
1.77
5817768--5817850
17
5.0
17
73
5
80
21
6
36
36
1.78
5817767--5817843
33
2.3
33
84
0
109
23
5
35
36
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5821192--5821230
20
2.0
20
94
0
69
48
0
2
48
1.15
5821288--5821352
34
1.9
33
84
9
87
40
10
9
40
1.72
5823439--5823467
15
2.0
15
93
6
51
48
13
27
10
1.75
5825165--5825213
16
3.1
16
90
0
80
36
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30
26
1.81
5834894--5834936
6
6.8
6
84
10
59
76
4
0
18
0.95
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9
5.6
9
87
0
73
28
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20
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1.79
5835255--5835369
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4.0
28
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10
108
27
13
29
29
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5841558--5841659
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2.3
45
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3
143
46
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13
21
1.84
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18
94
0
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20
17
1.85
5841875--5841981
40
2.7
39
81
4
99
39
17
7
35
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345