Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  318  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107163747--107163806
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31
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86
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0
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1.30
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0
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4
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1.64
107185020--107185082
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2.0
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3.5
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12
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36
1.82
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20
17
1.92
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6
4.5
6
100
0
54
48
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18
18
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.5
22
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3
0
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1.16
107222850--107223132
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26
18
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1.98
107222837--107223131
100
3.0
98
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347
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26
18
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1.98
107222850--107223125
150
1.8
150
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0
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30
26
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25
1.97
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2.0
27
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0
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40
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4.7
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2.0
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2.6
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2.3
24
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1
1
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1.16
107252467--107252521
17
3.2
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1
1
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64
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2.6
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68
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5.9
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107260810--107260886
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2.0
39
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27
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29
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107271272--107271319
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2.0
24
91
0
78
16
41
16
25
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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93
0
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70
0
5
23
1.09
107281643--107281682
12
3.3
12
85
0
53
70
0
7
22
1.12
107281794--107281828
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3.1
11
91
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52
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11
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2.9
29
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26
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28
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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19
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499
30
21
16
32
1.95
107331884--107332480
89
6.6
89
73
9
420
29
21
16
32
1.95
107339088--107339112
12
2.1
12
100
0
50
76
0
8
16
1.02
107355145--107355177
15
2.3
14
94
5
57
54
0
0
45
0.99
107360867--107360927
9
6.3
9
71
14
50
32
3
3
60
1.29
107364606--107364655
17
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10
0
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107369243--107369292
17
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20
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18
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10
0
44
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1.37
107369706--107369755
17
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20
78
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10
0
44
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1.37
107369220--107370150
463
2.0
463
99
0
1835
23
16
23
36
1.94
107389491--107389613
48
2.6
48
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5
122
24
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26
1.98
107397987--107398016
12
2.5
12
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0
51
43
3
10
43
1.54
107399579--107399640
24
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5
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17
25
20
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1.95
107406455--107406487
12
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0
15
0
0.61
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33
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10
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24
1.97
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1.54
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34
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159
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0
13
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1.50
107426102--107426612
126
4.1
126
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2
602
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1.91
107428714--107428790
37
2.1
37
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2
129
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5
54
1.54
107437981--107438090
42
2.6
42
86
0
166
28
11
12
47
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
10
100
0
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20
10
30
1.85
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28
2.5
25
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25
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1
0
41
1.08
107445489--107445529
15
2.9
15
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2
0
43
1.13
107445764--107445804
21
2.0
21
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0
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0
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2.0
26
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3
5
40
1.45
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0
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0
0
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1.00
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0
0
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27
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0
0
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0.96
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1.9
171
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0
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1.68
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2
12
2
82
0.86
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5
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2
0
78
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10
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17
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1
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1.09
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1.9
23
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20
6
2
70
1.21
107448381--107448454
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3.2
23
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1
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0
2
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1.15
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23
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0
4
54
1.19
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32
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0
0
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1.00
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114
53
0
0
46
1.00
107448465--107448585
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2.1
58
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52
0
0
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1.00
107448496--107448645
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173
55
0
0
43
1.09
107448574--107448622
14
3.3
14
75
13
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2
2
32
1.17
107450868--107450901
12
2.8
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0
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17
8
1.66
107462529--107462567
2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107462966--107463048
21
3.8
21
73
17
78
45
24
1
28
1.61
107462948--107463041
46
2.0
46
89
4
145
42
24
2
30
1.66
107463213--107463382
41
4.2
41
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0
234
22
22
21
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1.97
107466738--107466773
15
2.4
15
95
0
63
58
0
2
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107466762--107466947
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1.9
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302
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0
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21
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3.2
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0
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1.17
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19
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3
3
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1.32
107483870--107483944
35
2.1
35
95
0
132
38
5
4
52
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345