Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  288  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98014763--98014812
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0
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2.6
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0
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23
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2.4
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27
2.2
27
82
5
68
38
15
18
28
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2.2
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1.96
98109047--98109230
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17
29
22
1.97
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29
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2
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2
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98228143--98228270
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116
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23
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1.97
98228170--98228292
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44
85
6
149
33
18
22
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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10
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2
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38
2.0
40
83
9
101
37
2
3
55
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98288166--98288229
20
3.3
19
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39
1
3
56
1.25
98288359--98288391
9
3.7
9
91
0
57
39
12
6
42
1.67
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18
2.0
18
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31
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77
23
10
17
48
1.78
98296899--98296938
20
2.1
19
90
4
62
55
17
0
27
1.43
98297946--98298007
30
2.1
30
90
0
97
24
1
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85
87
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27
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16
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3
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100
0
52
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30
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20
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1
3
58
1.25
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47
2.0
47
100
0
184
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1.79
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21
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0
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25
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10
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5
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1.79
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47
10.1
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0
795
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26
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1
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1.57
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0
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1.11
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17
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19
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2
0
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1.14
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23
3.0
23
78
20
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37
4
4
54
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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220
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44
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0
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0
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28
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44
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1038
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29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98416621--98417317
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3.2
216
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10
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0
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4
28
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345