Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  95  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
31282419--31282560
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10
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2
0
62
1.13
31282419--31282552
32
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30
72
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34
2
0
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1.16
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1.17
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0
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5.1
18
73
14
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7
2
59
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
64
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0
211
32
17
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36
1.88
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2.0
45
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126
31
11
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28
1.91
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2.8
176
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671
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16
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22
22
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2.0
94
90
0
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30
23
19
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1.98
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86
5.3
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348
29
22
23
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2.9
130
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88
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22
18
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1.97
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111
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22
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28
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203
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17
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28
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12
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29
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25
27
1.97
31334651--31334883
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2.4
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299
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17
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4
12
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3
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114
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6
2
59
1.35
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2.4
21
96
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36
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1.74
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59
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29
3.8
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77
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110
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1.95
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2.0
56
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154
29
14
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25
1.94
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27
2.2
26
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69
47
17
15
19
1.83
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29
3.8
28
79
6
117
28
15
29
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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15
28
1.96
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2.1
27
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25
23
30
1.99
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56
2.4
55
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7
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31
4
19
44
1.71
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27
9.3
27
75
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150
31
7
20
40
1.80
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3.7
54
74
7
174
31
6
19
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1.77
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1.84
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42
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22
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1.83
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1.96
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25
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1.9
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1
202
29
8
18
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1.79
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0
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28
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15
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1.81
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2.0
24
87
12
69
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21
4
39
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
31432065--31432122
28
2.0
29
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3
73
34
8
25
31
1.86
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2.1
123
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30
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16
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17
2.3
18
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55
28
5
0
66
1.12
31448500--31448554
16
3.2
16
82
12
58
27
3
0
69
1.05
31448639--31448669
14
2.2
14
94
0
53
22
0
0
77
0.77
31448639--31448726
6
14.3
6
76
13
54
17
3
3
76
1.07
31448649--31448695
20
2.3
20
82
7
51
17
6
0
76
0.98
31450104--31450466
47
7.8
45
72
13
234
28
19
28
22
1.98
31450104--31450466
94
3.9
94
76
6
308
28
19
28
22
1.98
31450111--31450466
141
2.5
136
79
9
369
28
19
28
23
1.98
31454578--31454612
16
2.2
16
89
0
52
57
17
17
8
1.64
31454570--31454614
24
1.9
23
86
4
63
51
17
20
11
1.75
31461027--31461058
8
4.0
8
95
0
55
59
25
0
15
1.36
31462557--31462636
29
2.8
29
73
17
76
30
12
28
28
1.93
31466976--31467002
14
1.9
14
100
0
54
33
14
22
29
1.94
31472797--31472841
22
2.0
22
91
0
72
51
15
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26
1.68
31480924--31480984
27
2.3
27
82
0
68
31
16
22
29
1.96
31483029--31483253
113
2.0
113
99
0
441
41
21
4
32
1.74
31493524--31493566
21
2.0
21
82
13
52
44
9
9
37
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
31498166--31498322
43
3.7
43
72
3
154
27
16
25
30
1.97
31504906--31505085
46
3.9
46
83
7
222
22
30
17
28
1.97
31504917--31505085
94
1.8
92
87
7
252
23
30
17
28
1.97
31508441--31508678
118
2.0
118
94
0
413
32
24
13
29
1.93
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50
4.7
47
75
14
163
24
28
19
26
1.99
31517403--31517438
12
3.0
12
83
0
54
52
19
19
8
1.70
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11
4.3
11
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20
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82
1
5
9
0.90
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134
1.8
133
87
0
360
25
20
27
26
1.99
31522100--31522196
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2.2
45
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1
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27
20
23
27
1.99
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173
2.3
174
84
4
519
28
19
27
25
1.99
31523391--31523555
39
4.2
39
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0
258
28
27
21
21
1.99
31525973--31526233
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5.9
43
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10
159
29
15
27
26
1.96
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177
3.5
177
90
2
918
29
17
26
26
1.97
31526359--31526716
133
2.7
132
83
4
423
29
18
25
27
1.98
31527123--31527154
16
1.9
17
93
6
57
68
12
0
18
1.20
31532777--31532868
40
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7
116
14
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35
36
1.84
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13
2.8
13
95
0
63
5
30
0
63
1.17
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3
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3
100
0
88
34
0
0
65
0.93
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22
1.9
22
95
5
75
73
0
7
19
1.07
31548126--31548172
22
2.2
21
84
3
67
74
0
4
21
0.99
31553883--31553909
4
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4
100
0
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48
25
0
25
1.52
31556035--31556081
22
2.1
23
96
4
87
34
8
4
53
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
31558460--31558503
14
3.3
13
81
12
54
27
0
9
63
1.24
31573909--31573966
21
2.7
22
78
7
57
25
27
34
12
1.91
31575313--31575400
37
2.4
37
96
0
158
18
15
29
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1.92
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13
4.5
13
76
8
59
52
0
14
32
1.42
31577243--31577367
41
3.1
41
87
3
191
46
1
17
34
1.58
31577261--31577367
13
8.1
13
69
17
60
44
1
17
35
1.60
31577301--31577352
26
2.0
27
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11
72
48
1
15
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78
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1
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1.53
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20
2.1
19
85
9
53
2
28
17
51
1.59
31599582--31599645
32
2.0
32
100
0
128
25
15
21
37
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345