Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  301  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102138610--102139591
45
21.6
45
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13
298
31
17
21
29
1.96
102138975--102139407
182
2.4
182
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2
550
31
17
21
29
1.96
102139290--102139635
183
1.9
182
85
1
478
31
20
21
26
1.98
102139479--102139631
44
3.5
43
77
10
150
30
22
21
25
1.99
102139332--102139681
183
1.9
183
82
3
445
32
22
20
25
1.98
102139332--102139722
183
2.1
183
79
3
403
32
21
19
26
1.97
102141021--102141132
3
37.0
3
75
5
91
32
6
1
59
1.32
102143420--102143595
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3.5
50
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3
248
35
16
21
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0
402
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18
26
26
1.98
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28
4.1
28
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6
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27
12
33
26
1.92
102146983--102147351
27
13.6
27
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5
192
42
19
6
31
1.77
102146983--102147213
108
2.1
108
84
4
304
43
20
6
29
1.77
102146983--102147378
54
7.3
54
74
8
252
41
19
7
31
1.79
102146983--102147379
135
2.9
135
86
3
514
41
19
7
31
1.79
102147060--102147352
108
2.7
107
82
5
315
43
18
6
32
1.75
102147168--102147392
27
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16
9
33
1.80
102150336--102150432
28
3.4
28
83
10
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32
14
28
23
1.94
102150730--102150964
27
8.7
27
80
4
215
40
18
8
32
1.80
102150730--102150964
54
4.3
54
79
6
237
40
18
8
32
1.80
102150730--102150964
81
2.9
79
79
10
269
40
18
8
32
1.80
102150753--102150979
108
2.1
108
88
2
321
40
16
10
33
1.82
102150929--102150980
27
1.9
27
96
0
95
38
17
13
30
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102152366--102152396
13
2.3
14
94
5
55
48
12
6
32
1.67
102156208--102156335
43
3.0
43
82
6
152
25
17
25
31
1.97
102160523--102160669
43
3.4
43
80
5
172
23
14
25
35
1.94
102164066--102164104
20
2.1
19
85
9
53
2
28
17
51
1.59
102182887--102183350
47
9.7
47
94
1
748
32
8
29
29
1.86
102184801--102185145
40
8.6
40
92
0
557
23
22
28
26
1.99
102188859--102189228
47
7.7
47
94
1
596
32
8
30
29
1.87
102197459--102197539
40
2.0
40
100
0
162
32
12
24
30
1.92
102199338--102199404
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2.0
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8
91
32
20
22
23
1.98
102207011--102207043
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
102210050--102210101
21
2.5
21
83
0
59
50
7
7
34
1.60
102212593--102213137
133
4.1
132
76
5
436
33
18
11
37
1.87
102212593--102213137
267
2.0
267
80
2
610
33
18
11
37
1.87
102213049--102213235
98
1.9
98
90
2
295
29
20
10
38
1.87
102213147--102213416
134
2.0
134
88
1
398
31
20
12
35
1.89
102214886--102214938
25
2.1
26
83
16
67
43
5
1
49
1.37
102215171--102215215
10
4.7
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15
60
6
11
0
82
0.84
102215258--102215303
18
2.6
17
80
10
56
28
4
0
67
1.10
102215231--102215303
36
2.0
36
84
12
96
23
5
2
68
1.24
102215321--102215379
21
2.7
21
84
10
66
42
0
1
55
1.09
102215306--102215386
22
3.7
21
75
21
62
40
0
3
55
1.17
102215402--102215472
37
1.9
36
88
2
106
43
1
4
50
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102215510--102215556
18
2.6
17
84
15
60
17
6
2
74
1.12
102215732--102215781
9
5.4
9
80
4
55
24
0
2
74
0.93
102216134--102216241
10
11.6
9
75
10
67
51
2
0
44
1.22
102216134--102216195
29
2.2
29
88
5
92
54
3
0
41
1.16
102219845--102220088
105
2.4
103
91
4
386
31
30
19
17
1.95
102223774--102223825
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2.0
26
96
0
95
28
34
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13
1.92
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30
19
19
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10
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29
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1.82
102224232--102224288
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1.9
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85
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80
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24
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38
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0
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29
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1.90
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2.0
26
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0
95
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13
1.92
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103
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605
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30
20
19
1.97
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29
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28
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0
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11
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45
0
1
52
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102237750--102237838
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22
69
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58
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1
38
1.18
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72
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2
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2.9
18
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5
61
67
0
3
28
1.08
102237930--102237973
10
4.6
10
80
11
56
81
0
6
11
0.86
102237930--102237963
17
1.9
17
94
5
59
82
0
5
11
0.83
102237927--102237973
18
2.6
18
86
3
67
80
0
8
10
0.89
102237891--102237981
18
5.4
17
69
13
62
75
2
8
13
1.12
102238069--102238093
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11
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0
50
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8
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17
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4
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8
21
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29
2.1
29
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0
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22
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29
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102245859--102246027
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28
1.99
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102251078--102251141
32
2.0
32
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0
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1.98
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1.8
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93
0
297
21
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28
1.98
102271563--102271735
45
3.8
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28
28
1.98
102271567--102271737
46
3.7
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79
12
204
21
21
28
29
1.98
102271961--102271998
19
2.0
20
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17
27
28
1.97
102278870--102279028
55
2.9
54
81
5
196
23
25
17
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102278847--102279041
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54
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23
23
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27
2.0
27
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18
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1.96
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2.2
22
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0
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1.86
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2.6
54
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3
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1.88
102284909--102285040
27
5.0
27
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3
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1.89
102287517--102287553
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25
1.99
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2.3
19
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27
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1.95
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2.0
294
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1011
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102319083--102319212
54
2.4
54
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0
179
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21
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1.78
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2.6
28
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42
21
5
30
1.76
102319191--102319324
55
2.4
55
80
6
146
39
22
6
31
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102319326--102319391
26
2.5
27
92
2
107
30
21
3
45
1.67
102319205--102319573
27
13.7
27
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119
38
20
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32
1.82
102319443--102319573
54
2.4
54
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0
136
39
19
9
31
1.84
102319423--102319574
81
1.9
81
79
8
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9
29
1.84
102320378--102320464
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2.7
51
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5
206
27
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22
27
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102320514--102320649
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22
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13
2.3
13
100
0
60
36
6
13
43
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345