Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  229  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77764347--77764516
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39
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0
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0
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2.0
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50
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0
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9
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0
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0
0.76
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138
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0
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1.96
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231
2.2
231
92
1
838
31
17
20
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77789721--77790306
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2.1
275
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32
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21
29
1.95
77790088--77790372
138
2.1
137
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2
446
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17
21
30
1.96
77790387--77790519
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30
1.98
77790385--77790574
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17
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1.98
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1.96
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58
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1.96
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2.0
102
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307
27
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24
1.97
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1.96
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11
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51
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80
1.01
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146
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3
50
1.28
77795117--77795187
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2.0
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0
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18
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77814115--77814167
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1.87
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2.6
27
95
2
113
31
28
12
27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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4.1
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20
38
1.93
77836592--77836702
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2.1
53
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18
22
20
38
1.93
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2.1
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88
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0
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22
29
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1.96
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156
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93
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293
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21
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27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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39
16
15
28
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14
2.7
14
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0
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18
13
1.56
77889806--77889973
73
2.3
75
87
3
241
33
20
17
27
1.96
77902221--77902257
18
2.1
18
89
0
56
62
5
0
32
1.18
77907177--77907256
24
3.1
26
78
8
76
58
1
0
40
1.06
77907291--77907380
31
2.8
31
79
14
87
55
2
1
41
1.19
77908562--77908590
14
2.0
15
93
6
51
13
3
0
82
0.79
77910394--77910607
107
2.0
107
89
0
329
28
17
17
36
1.93
77914031--77914220
38
4.9
38
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3
229
30
25
22
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1.99
77917327--77917435
55
2.0
55
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0
173
19
22
34
22
1.96
77931263--77931324
21
3.0
21
80
0
79
46
19
20
12
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77931251--77931448
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4.7
42
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5
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46
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18
17
1.84
77931251--77931354
21
5.0
21
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2
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1.80
77931253--77931448
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2.3
84
77
4
200
47
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17
17
1.83
77934238--77934549
93
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93
91
1
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34
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9
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9
100
0
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44
22
0
33
1.53
77942954--77942993
2
20.0
2
89
0
62
2
2
47
47
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
55
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0
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20
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10
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10
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0
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0
0
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45
4.5
45
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275
25
23
23
27
2.00
77952159--77952359
88
2.2
89
87
4
289
25
23
23
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2.00
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0
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0
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2
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27
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4.2
44
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279
26
24
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25
2.00
77994912--77995100
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2.1
90
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2.00
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0
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20.0
2
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47
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34
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13
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100
0
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0
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10
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0
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0
11
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15
2.2
16
90
5
54
37
8
2
51
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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0
100
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24
0
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27
2.0
27
88
0
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16
18
32
1.94
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2.0
84
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2.7
40
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207
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27
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2.0
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45
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0
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5.5
40
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1
287
23
22
27
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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