Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  324  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.6
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0
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20
75
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50
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
0
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2.0
119
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29
1.95
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2.4
201
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19
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23
32
1.98
109092063--109092177
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24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1
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109107339--109107394
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3.1
18
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10
71
14
1
10
73
1.18
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4.2
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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60
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0
2
50
1.15
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16
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0
2
54
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2.0
21
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45
0
5
50
1.23
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10.7
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0
0
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0
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0
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109224413--109224503
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0
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15
2.1
15
100
0
62
19
19
6
54
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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25
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1.55
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0
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0
0
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1.97
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0
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2.0
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0
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1.51
109300870--109300957
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4.2
21
77
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83
34
45
0
20
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109300979--109301021
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2.9
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23
1.64
109300979--109301026
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1.62
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0
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23
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3.1
53
90
6
251
17
26
21
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345