Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  82  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26840156--26840201
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3
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1.33
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29
5.4
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3
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1.34
26846551--26846647
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1.13
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18
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3
0
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19
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0
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0
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100
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1.12
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34
75
13
99
29
2
3
64
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.9
16
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9
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29
0
0
70
0.88
26872768--26872868
19
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15
73
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2
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1.17
26872831--26872907
19
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78
16
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29
0
1
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0.97
26872857--26872908
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0
1
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0
0
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0
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2.0
20
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28
26
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3
10.7
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35
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1.11
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2.1
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85
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1.13
26898014--26898065
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3
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2
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0
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2
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9
11.8
9
68
18
55
25
2
5
66
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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23
0
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70
1.11
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2.1
23
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1.26
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2.2
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26
1.60
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27
2.0
27
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81
49
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1.67
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27
2.1
27
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49
7
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1.72
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31
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29
17
25
1.98
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17
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1.15
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37
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1.77
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0
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3.3
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0
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0
7
15
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26941851--26941898
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25
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56
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10
14
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0
0
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4.9
23
79
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129
14
5
35
45
1.67
26958944--26959056
46
2.5
46
86
2
156
14
5
35
45
1.67
26963317--26963349
16
2.1
16
88
11
50
48
0
33
18
1.48
26965419--26965509
23
4.0
23
80
5
103
43
36
5
14
1.68
26966508--26966555
25
1.9
25
86
0
69
12
12
6
68
1.37
26966508--26966563
25
2.2
25
83
0
67
14
10
7
67
1.40
26989064--26989097
16
2.1
16
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0
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0
32
0
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0.91
26994551--26994586
17
2.1
17
89
0
54
72
5
0
22
1.05
27004702--27004737
18
2.0
18
100
0
72
33
22
22
22
1.97
27028468--27028513
23
2.0
23
100
0
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30
21
17
30
1.96
27030091--27030136
23
2.0
23
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0
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23
10
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1.86
27034544--27034604
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16
19
1.94
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20
2.4
19
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17
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4
22
0
72
1.02
27043360--27043401
18
2.3
19
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7
4
26
1.42
27051401--27051578
40
4.5
40
87
2
236
26
28
21
23
1.99
27066062--27066179
40
3.0
40
92
0
191
22
17
30
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27071803--27072004
47
4.3
47
75
14
175
25
18
32
23
1.97
27071803--27072095
94
3.1
95
79
6
269
26
18
30
24
1.98
27072859--27072977
55
2.2
55
80
8
136
23
25
26
24
2.00
27073645--27073692
25
1.9
25
91
0
78
33
18
10
37
1.85
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22
2.3
23
80
3
61
36
11
17
34
1.86
27081265--27081328
23
2.8
23
75
0
65
31
15
14
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1.87
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4.2
105
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0
675
32
7
16
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1.75
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3.2
36
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4
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24
20
20
34
1.96
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1
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22
21
24
31
1.99
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7.3
72
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24
22
20
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1.98
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6.9
36
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22
22
23
31
1.98
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2.3
29
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5
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27
30
13
27
1.94
27087095--27087173
29
2.7
29
82
2
104
30
30
13
25
1.94
27089359--27089411
9
5.4
9
75
16
52
33
7
20
37
1.81
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11
5.5
11
74
16
59
35
10
19
35
1.86
27089353--27089419
20
3.3
20
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0
107
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10
20
34
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23
3.1
23
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3
119
28
21
20
28
1.98
27089469--27089549
24
3.4
24
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5
128
29
20
22
27
1.99
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31
2.1
31
90
0
101
39
15
21
23
1.92
27097305--27097352
25
1.9
25
91
0
78
35
25
14
25
1.94
27097396--27097454
20
3.0
20
89
0
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33
11
23
30
1.91
27097506--27097599
45
2.1
46
90
6
147
28
21
20
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27097505--27097606
23
4.4
24
90
7
149
29
20
21
28
1.98
27097813--27097876
31
2.1
31
93
0
110
37
15
23
23
1.93
27100013--27100529
48
10.9
48
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1
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30
28
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34
1.83
27100022--27100536
142
3.6
142
94
1
931
31
27
6
34
1.83
27106294--27106355
31
2.0
31
100
0
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29
1.85
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15
100
0
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0
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21
90
0
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2.0
46
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8
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21
22
21
34
1.97
27163093--27163841
47
15.9
47
96
0
1291
32
8
29
29
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345