Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  115140250

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  325  of  345  ( 41358 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109325515--109325678
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81
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9
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0
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0
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2.0
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17
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2.0
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2.0
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0
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29
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100
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16
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0
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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2.8
26
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0
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5
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0
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109390459--109390760
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35
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2.0
71
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2.6
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300
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26
6
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3.0
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5
0
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8
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1
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1.20
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2.0
176
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34
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.9
22
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2
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1.36
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25
20
1.97
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2.1
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391
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25
20
1.97
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.60
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1.9
94
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35
17
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1.76
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15
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1.68
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0
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36
10
13
40
1.78
109491950--109491996
24
1.9
25
83
12
62
6
42
2
48
1.40
109492445--109492807
160
2.3
157
83
7
421
34
7
16
41
1.76
109493222--109493247
12
2.2
12
100
0
52
0
7
0
92
0.39
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19
2.0
20
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9
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30
7
10
52
1.62
109496495--109496541
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2.2
20
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17
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27
0
8
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1.23
109498796--109498926
51
2.6
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0
208
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72
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72
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2
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23
20
17
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1.40
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105
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16
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26
1.95
109513004--109513419
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3.9
106
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324
34
18
21
25
1.96
109521134--109521171
18
2.1
18
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0
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109524730--109524760
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0
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1.18
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1.62
109524912--109525407
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1.61
109526799--109526850
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0
0
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29
2.1
29
90
0
93
33
0
8
58
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
4
50
1.22
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38
1.9
38
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0
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43
0
5
51
1.24
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17
3.1
17
80
5
68
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3
29
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1.49
109534314--109534372
9
7.3
9
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49
0
0
50
1.00
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1
2
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1.21
109534315--109534390
38
2.0
38
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0
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1
1
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1.17
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29
2.1
30
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4
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1.58
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2.0
157
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1.41
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4.2
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0
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0
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1.57
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20
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0
0
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1
1
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1.22
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2
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1.28
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2.1
21
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17
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0
5
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1.22
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6
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30
4
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1.40
109549119--109549169
3
17.3
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4
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33
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0
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3
0
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100
0
50
0
0
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2.1
21
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0
0
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0.93
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14
2.1
14
100
0
58
44
34
0
20
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109563755--109563793
17
2.3
17
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13
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43
2
0
53
1.14
109563852--109563939
38
2.2
40
84
7
110
51
5
3
39
1.43
109564060--109564111
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3.4
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48
5
0
46
1.26
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27
2.0
29
89
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87
60
5
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2.0
24
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2
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1.9
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1.9
19
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310
46
2
10
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1.52
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23
1.9
21
85
14
57
53
0
21
24
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345